基于小波非线性支持向量机分类预测的蛋白质结构、功能和进化关系研究及医学应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    20605010
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    27.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0310.化学信息学与人工智能
  • 结题年份:
    2009
  • 批准年份:
    2006
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

随着人类进入后基因时代,大量的生物信息数据不断涌现并更新,其中蕴藏了许多重要的迄今为止尚未人知的信息和规律。针对生物信息分析和蛋白质研究的现状,本课题组适时地提出利用非线性组合原理将非线性支持向量机与小波理论有机结合,构建小波非线性支持向量机模型,采用改进的SMO算法编写小波非线性支持向量机程序;基于氨基酸的物理化学特性,设计一套基于蛋白质整条序列来计算蛋白质序列特征描述符的新方法;综合运用多种分析技术建立蛋白质差异关系判断打分新机制,构建直接基于蛋白质序列即可系统地预测蛋白质的分类、结构、功能和进化关系的预测平台;应用预测平台对几种重大疾病的相关蛋白质进行分类,并初步探讨重大疾病的发生与蛋白质结构、功能和进化之间的内在机制,构建相关蛋白质信息数据库。建立自动化、共享预测网站,为解析海量的生物信息数据和节省高昂的结构测试费用提供方便、快捷、准确的研究手段。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(34)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
An Amperometric Glucose Biosensor Based on Titania Sol-gel/Prussian Blue Composite Film
基于二氧化钛溶胶-凝胶/普鲁士蓝复合膜的电流式葡萄糖生物传感器
  • DOI:
    10.2116/analsci.24.1425
  • 发表时间:
    2008-11-01
  • 期刊:
    ANALYTICAL SCIENCES
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Liang, Ruping;Jiang, Jingli;Qiu, Jianding
  • 通讯作者:
    Qiu, Jianding
聚乙烯二茂铁/碳纳米管复合物的制备及其对抗坏血酸的电催化测定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    南昌大学学报(理科版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邱建丁;邓敏强;梁汝萍
  • 通讯作者:
    梁汝萍
Preparation of porous chitosan/carbon nanotubes film modified electrode for biosensor application
生物传感器用多孔壳聚糖/碳纳米管薄膜修饰电极的制备
  • DOI:
    10.1007/s00604-007-0871-3
  • 发表时间:
    2008-07
  • 期刊:
    Microchimica Acta
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Xie, Hui-Ying;Liang, Ru-Ping;Qiu, Jian-Ding
  • 通讯作者:
    Qiu, Jian-Ding
Amperometric sensor based on ferrocene-modified multiwalled carbon nanotube nanocomposites as electron mediator for the determination of glucose
基于二茂铁改性多壁碳纳米管纳米复合材料作为电子介体的电流传感器用于测定葡萄糖
  • DOI:
    10.1016/j.ab.2008.12.002
  • 发表时间:
    2009-02-15
  • 期刊:
    ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Qiu, Jian-Ding;Zhou, Wen-Mei;Liang, Ru-Ping
  • 通讯作者:
    Liang, Ru-Ping
Ferrocene-modified multiwalled carbon nanotubes as building block for construction of reagentless enzyme-based biosensors
二茂铁改性多壁碳纳米管作为构建无试剂酶基生物传感器的构建块
  • DOI:
    10.1016/j.snb.2008.08.017
  • 发表时间:
    2008-12
  • 期刊:
    Sensors and Actuators B-Chemical
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Qiu, Jian-Ding;Deng, Min-Qiang;Xiong, Meng;Liang, Ru-Ping
  • 通讯作者:
    Liang, Ru-Ping

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其他文献

疾病标记物分子印迹技术在分离传感分析中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    分析化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王莹;黄春芳;梁汝萍;邱建丁
  • 通讯作者:
    邱建丁

其他文献

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邱建丁的其他基金

复杂环境介质中重金属与有机污染物检测的新技术新方法
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    300 万元
  • 项目类别:
    重点项目
辅助配体调控构筑稀土配位聚合物荧光探针及用于重金属离子检测研究
  • 批准号:
    21976077
  • 批准年份:
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    65 万元
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    面上项目
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    2016
  • 资助金额:
    65.0 万元
  • 项目类别:
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    21163014
  • 批准年份:
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  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    地区科学基金项目
特殊浸润性智能纳米生物传感界面的构建及应用
  • 批准号:
    20865003
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    28.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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  • 批准号:
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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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