GWAS发现的胰腺癌易感基因功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81572793
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    75.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1804.肿瘤遗传与进化
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Pancreatic cancer (PC) has the worst survival rate among any human cancer and there are no effective markers for screening and early diagnosis. Our previous GWAS (Wu et al, Nat Genet 2012) has identified 7 genes or loci associated with PC risk. Among them, the most significant signal was rs372883T>C in the 3′UTR of BACH1, whose roles in cancer has not been elucidated yet. Our preliminary results show that the rs372883T (not C)-containing BACH13′UTR is able to bind miR-1257 and thus suppress reporter gene expression. The BACH1 mRNA levels in human pancreatic tissues are significantly associated with rs372883 genotype (CC genotype > CT genotype > TT genotype); the BACH1 expression is significantly lower in PC tissues than in adjacent normal tissues. We also found a reverse association between BACH1 levels in PC tissue with patients’ survival, suggesting that BACH1 may not only play a role in the development but also involve in the progression of PC. Our preliminary results also indicated that knockdown of BACH1 enhances melignant phenotypes of cells such as proliferation, colony formation, migration, and invasion in vitro, and tumor growth and metastasis of xenograft in mice. Having these interesting and promising results, this project will further investigate and elucidate the underlying mechanism of the effect of BACH1 on pancreatic cancer. The findings of this project will be of significance for prevention and target therapy of pancreatic cancer.
我们通过全基因组关联研究发现7个胰腺癌易感等位基因,其中BACH1 3′UTR的rs372883T>C变异是最重要易感信号。BACH1在肿瘤发生发展中的作用尚不清楚。预实验结果表明,含rs372883T的3′UTR可与miR-1257结合并降低报告基因表达;不同rs372883基因型的人胰腺组织中BACH1 RNA表达差异显著,即CC基因型>CT基因型>TT基因型;癌组织的BACH1表达水平显著低于癌旁组织,而低表达患者的生存时间显著低于高表达患者,提示BACH1不但与胰腺癌发生相关而且还涉及胰腺癌进展。细胞恶性表型和动物移植瘤实验证明,BACH1低表达显著促进胰腺细胞恶性表型。在这些工作基础上,本项目拟进一步研究并阐明BACH1在胰腺癌发生发展中的作用机制。此项目是基于我们全基因组分析的发现进行的深入研究,既具重要性又具原创性,研究结果对胰腺癌的防治及寻找药物靶点都将具有重要意义。

结项摘要

胰腺癌是一种发病率相对较低的消化系统恶性肿瘤,但是其预后极差,提示胰腺癌恶性程度非常高。我们前期采用全基因组关联研究的方法,从2972例胰腺癌患者和正常对照中 (981例胰腺癌患者,1991例正常人对照) 鉴定了5个新的与胰腺癌发病风险相关的染色体区段,其中rs372883 (位于基因BACH1的3’UTR) 在胰腺癌易感中具有显著意义 (T>C, odds ratio (OR) = 0.69, 95% confidence interval (CI), 0.62−0.70; P = 2.10 × 10–10),提示BACH1在胰腺癌易感中可能具有重要作用,然而其作用机制尚不清楚。本项目运用生化及分子生物学、细胞生物学等研究策略,首先证明了BACH1在胰腺癌组织中低表达,在胰腺癌细胞中高表达BACH1能显著抑制细胞的增殖及血管生成能力,而这些表型改变是由BACH1直接调控的下游基因HMOX1介导的。此外,高表达BACH1还能显著增强胰腺癌细胞对吉西他滨处理的敏感性,提示BACH1的差异表达还可能与胰腺癌患者的化疗敏感性相关。接着我们阐明了rs372883多态是与miRNA-1257选择性结合来调控BACH1的表达,进而调节下游增殖及促血管生成信号通路,使个体对胰腺癌具有不同的遗传易感性。同时,临床数据分析结果也表明携带rs372883CC基因型的患者对吉西他滨的治疗较TT基因型的患者更为敏感,且生存时间显著延长。这说明rs372883多态不仅与胰腺癌的易感性的相关,也可能是反映胰腺癌患者后续治疗敏感性的标志物。本项目是基于我们先前关联分析研究的进一步生物学功能机制探讨,具有原创性和系统性。研究结果对于阐明胰腺癌病因、分析胰腺癌预后及判断胰腺癌患者对吉西他滨治疗的应答反应具有重要理论意义和潜在的应用价值。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Functional role of BTB and CNC Homology 1 gene in pancreatic cancer and its association with survival in patients treated with gemcitabine.
BTB 和 CNC 同源 1 基因在胰腺癌中的功能作用及其与吉西他滨治疗患者生存的关系
  • DOI:
    10.7150/thno.23978
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Theranostics
  • 影响因子:
    12.4
  • 作者:
    Huang X;Zheng J;Li J;Che X;Tan W;Tan W;Shao M;Cheng X;Du Z;Zhao Y;Wang C;Wu C;Lin D
  • 通讯作者:
    Lin D
Integrative analysis of gene expression profiles reveals specific signaling pathways associated with pancreatic duct adenocarcinoma.
基因表达谱的综合分析揭示了与胰管腺癌相关的特定信号通路
  • DOI:
    10.1186/s40880-018-0289-9
  • 发表时间:
    2018-04-27
  • 期刊:
    Cancer communications (London, England)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li J;Tan W;Peng L;Zhang J;Huang X;Cui Q;Zheng J;Tan W;Wu C;Lin D
  • 通讯作者:
    Lin D

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其他文献

转化生长因子-1基因多态性与食管鳞癌放疗和化疗疗效及生存的关系
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    中华预防医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周宇灵;章文成;陈侠斌;肖泽芬;乔艳;于典科;林东昕;谭文
  • 通讯作者:
    谭文
Risk of pancreatic cancer is associated with genetic polymorphisms in methylenetetrahydrofolate reductase and thymidylate synthase
胰腺癌的风险与亚甲基四氢叶酸还原酶和胸苷酸合酶的基因多态性有关
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Clin. Gastroenterol. Hepatol.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王丽;缪小平;谭文;陆星华;赵平;赵晓航;单毅;李辉;林东昕
  • 通讯作者:
    林东昕
亚甲基四氢叶酸还原酶基因单核苷酸多态与大肠癌风险
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中华预防医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    缪小平;杨燊;谭文;张雪梅;叶颖江;林东昕;王杉
  • 通讯作者:
    王杉
全基因组关联分析发现YAP1 基因遗传变异与小细胞肺癌患者生存相关
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Cancer Research
  • 影响因子:
    11.2
  • 作者:
    林东昕
  • 通讯作者:
    林东昕
细胞周期素D1基因A870G多态与直肠癌术后同步放化疗急性毒副反应的关系
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中华肿瘤杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    金晶;李晔雄;林东昕;谭文
  • 通讯作者:
    谭文

其他文献

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林东昕的其他基金

食管鳞癌中炎性相关基因异常表达的分子调控机制研究
  • 批准号:
    91229126
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    160.0 万元
  • 项目类别:
    重大研究计划
肝癌中炎性相关基因异常表达的分子机制研究
  • 批准号:
    81030050
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
    250.0 万元
  • 项目类别:
    重点项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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