肝脏炎癌恶性转化关键节点的动态网络标志物模型及临床应用研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:91529303
- 项目类别:重大研究计划
- 资助金额:250.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:F0302.控制系统与应用
- 结题年份:2018
- 批准年份:2015
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2016-01-01 至2018-12-31
- 项目参与者:王俊文; 陈磊; 曾涛; 杨文; 刘小平; 张秀军; 史倩倩; 张万纬; 李美仪;
- 关键词:
项目摘要
It is a nonlinear and dynamical process from hepatitis to liver cancer involving a malignant transformation at a network level. This project aims to develop a mathematical model to analyze such a malignant transformation from hepatitis to liver cancer based on both theoretical analysis and clinical data, and further establish a method for early prediction of liver cancer. Specifically, (a) derive gene regulatory networks of hepatitis to liver cancer by integrating multi-level omics data; (b) identify dynamical network biomarkers to characterize the critical transition from inflammation to cancer, based on the observed data and on various conditions; (3) develop a prediction model to identify the early signal of the critical transition of the inflammation to liver cancer, and further validate the theoretical results with clinic data or animal models.
我国肝癌的发病常伴有“肝炎-肝硬化-肝癌”的慢性非可控性迁延不愈过程,患者出现临床症状时多已处于肝癌中晚期,错过了治疗的最佳时间。因此提高肝癌的早期诊断水平、寻找肝癌早期干预方案已经成为一个迫在眉睫的关键科学问题。本项目将由动力系统理论和生物实验相结合的系统生物学研究模式,以病理学明确的肝癌早期病变组织(高度不典型性增生结节)和慢性肝炎高危队列为主要切入点,建立肝炎向肝癌转化过程中临床样本的多层次组学大数据(如基因组、转录组等)整合模型,从系统的视角,研究非可控肝癌恶性转化过程中的调控网络,揭示恶性转化过程中活性调控网络的动态变化及疾病的分子机制,确定表征疾病进程的组织学和血清学动态网络标记物(DNB),识别肝炎恶性转化过程的关键节点和关键网络,建立癌症前兆的“前疾病状态”预测和诊断方法,并由临床样本或生物实验验证基于DNB的理论预测结果。
结项摘要
该项目由动力系统理论和生物实验相结合的系统生物学研究模式,建立肝炎向肝癌转化过程中临床样本的多层次组学大数据整合模型,研究非可控肝癌恶性转化过程中的调控网络,揭示恶性转化过程中活性调控网络的动态变化及疾病的分子机制,确定表征疾病进程(或诊断疾病)的网络标记物(network biomarker)及预测疾病的动态网络标记物(DNB: dynamic network biomarker),识别肝炎恶性转化过程的关键节点和关键网络,建立癌症前兆的预测和诊断方法。特别是,与现行的分子标志物不同,我们建立了(a)疾病诊断的网络标志物及(b)疾病预测的动态网络标记物的理论和方法,实现了由网络诊断疾病,由网络预测疾病。
项目成果
期刊论文数量(47)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Molecular dynamics simulation reveals how phosphorylation of tyrosine 26 of phosphoglycerate mutase 1 upregulates glycolysis and promotes tumor growth
分子动力学模拟揭示磷酸甘油酸变位酶 1 酪氨酸 26 的磷酸化如何上调糖酵解并促进肿瘤生长
- DOI:10.1002/lpor.201500090
- 发表时间:2017
- 期刊:Oncotarget
- 影响因子:--
- 作者:Wang Yan;Cai Wen-Sheng;Chen Luonan;Wang Guanyu
- 通讯作者:Wang Guanyu
Inference of Gene Regulatory Network Based on Local Bayesian Networks
基于局部贝叶斯网络的基因调控网络推理
- DOI:10.1371/journal.pcbi.1005024
- 发表时间:2016
- 期刊:Plos Computational Biology
- 影响因子:--
- 作者:Liu Fei;Zhang Shao-Wu;Guo Wei-Feng;Wei Ze-Gang;Chen Luonan
- 通讯作者:Chen Luonan
Part mutual information for quantifying direct associations in networks
用于量化网络中直接关联的部分互信息
- DOI:10.1073/pnas.1522586113
- 发表时间:2016
- 期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
- 影响因子:11.1
- 作者:Zhao Juan;Zhou Yiwei;Zhang Xiujun;Chen Luonan
- 通讯作者:Chen Luonan
Interferon-microRNA signalling drives liver precancerous lesion formation and hepatocarcinogenesis
干扰素-microRNA信号传导驱动肝脏癌前病变形成和肝癌发生
- DOI:10.1136/gutjnl-2015-310318
- 发表时间:2016
- 期刊:Gut
- 影响因子:24.5
- 作者:Yang Yingcheng;Lin Ximeng;Lu Xinyuan;Luo Guijuan;Zeng Tao;Tang Jing;Jiang Feng;Li Liang;Cui Xiuliang;Huang Wentao;Hou Guojun;Chen Xin;Ouyang Qing;Tang Shanhua;Sun Huanlin;Chen Luonan;Gonzalez Frank J.;Wu Mengchao;Cong Wenming;Chen Lei;Wang Hongyang
- 通讯作者:Wang Hongyang
Single cell clustering based on cell-pair differentiability correlation and variance analysis
基于细胞对可微相关性和方差分析的单细胞聚类
- DOI:--
- 发表时间:2018
- 期刊:Bioinformatics
- 影响因子:5.8
- 作者:Hao Jiang;Lydia L. Sohn;Haiyan Huang;Luonan Chen
- 通讯作者:Luonan Chen
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- 通讯作者:陈洛南
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