冠心病血瘀证相关lncRNA-miRNA调控网络研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81673847
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    62.0万
  • 负责人：
    王阶
  • 依托单位：
    中国中医科学院广安门医院
  • 学科分类：
    H3103.证候基础
  • 结题年份：
    2020
  • 批准年份：
    2016
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Coronary heart disease (CHD) is a complicated disease with multiple genes and factors involved. Previous researches have shown that CHD Blood Stasis syndrome (BSS) has its unique miRNA expression profile and miRNA-mRNA interaction network. It is newly reported that lncRNA could function as competing endogenous RNA (ceRNA) to inhibit the combination of miRNA and its target mRNA to regulate the miRNA and mRNA. Promoting blood circulation and dissolving blood stasis may treat CHD BSS by balancing the dysregulation of lncRNA and miRNA. In this research we use high-throughput sequencing, bioinformatics, RNAi, qRT-PCR and Western blot to screen out and identify the lncRNA and miRNA and the lncRNA-miRNA-mRNA interaction network correlated with CHD BSS. Then we use promoting blood circulation and dissolving blood stasis medicine to intervene, hoping to elaborate the biological material basis and scientific connotation of medicine-syndrome correspondence from the perspective of epigenetics, and provide new therapeutic targets for developing new medication for CHD BSS.
冠心病是多基因多因素复杂疾病，血瘀证是其最常见证候。我们研究表明，冠心病血瘀证有特异的miRNA表达谱和miRNA-mRNA调控网络。新近研究发现，miRNA上游存在“竞争性内源RNA”（lncRNA）,通过竞争性抑制miRNA与靶基因mRNA 3’UTR的结合，发挥对miRNA和靶基因的调控作用，活血化瘀方药可能是通过改变lncRNA表达水平，恢复其相关miRNA与靶基因之间的失衡状态来治疗冠心病血瘀证。本课题拟选择冠心病血瘀证病例，利用高通量测序、细胞转染、qPCR等技术，筛选与冠心病血瘀证相关的miRNA和lncRNA基因，构建冠心病血瘀证相关lncRNA-miRNA-mRNA调控网络，并通过“以药测证”，观察活血化瘀药物对冠心病血瘀证相关lncRNA-miRNA-mRNA调控网络的影响，阐述冠心病血瘀证病证结合、方证相应理论的科学内涵，为研制治疗冠心病血瘀证的有效方药提供新靶点。

结项摘要

病证结合是当前中西医结合诊疗的基本模式，血瘀证作为冠心病最主要和最常见的中医证型，已被广泛运用于冠心病的临床诊疗。但是，冠心病血瘀证的客观物质基础及发生机制尚未完全阐释。有鉴于此，本课题按照“血瘀证—客观物质基础—活血化瘀—作用机制”思路，从lncRNA-miRNA-mRNA调控网络进行设计，并严格按照项目设计思路、研究方法及内容，完成了如下工作：①利用高通量测序及生物信息学方法，对冠心病血瘀证、冠心病非血瘀证和正常对照人群进行差异基因分析，获得了冠心病血瘀证相关的39个lncRNA，229个miRNA和221个mRNA。GO和KEGG通路富集分析显示，这些差异基因主要与免疫和炎症反应相关。②运用starBase、Pearson相关分析和拓扑分析，获得4个关键基因：lncRCTA-384D8.35、lncRCTB-114C7.4、lncRRP11-567M16.6和hsa-miR-3158-3p。③通过扩大样本量对关键基因及其上下游节点进行qRT-PCR验证，结果支持高通量测序和生物信息学分析的结果。④利用慢病毒介导的shRNA转染技术，实现RNA干扰，进行基因间调控关系的细胞学实验，验证了6条主要的冠心病血瘀证lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。⑤采用临床随机双盲安慰剂对照试验，研究活血化瘀药物对以上构建的冠心病血瘀证的1条lncRCTB114C7.4-miR3656-EGR1调控网络进行干预，以药测证，反向验证了冠心病血瘀证的lncRCTB114C7.4-miR3656-EGR1网络发生机制和物质基础。⑥结合RNA干扰技术进行细胞学体外研究，进一步揭示出该调控网络中的药物作用靶点是lncRCTB114C7.4，具体调控模式为lncRCTB114C7.4↑-miR3656↓-EGR1↓，发挥的生物学功能是抑制细胞凋亡。因此，本研究结果揭示了冠心病血瘀证的lncRNA-miRNA-mRNA网络发生机制，并发现其中一条lncRCTB114C7.4-miR3656-EGR1网络参与了活血化瘀药物的治疗机制，表明lncRCTB114C7.4-miR3656-EGR1很可能是冠心病血瘀证的网状生物标志物和治疗靶标，进而从lncRNA-miRNA-mRNA的表观遗传学层面，阐释了冠心病血瘀证及方证对应的科学内涵。

项目成果

期刊论文数量（15）
专著数量（0）
科研奖励数量（1）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
冠心病不稳定性心绞痛血瘀证患者IL-6基因甲基化研究及方法探讨
  • DOI：
    10.13422/j.cnki.syfjx.2017190023
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中国实验方剂学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陈光;何浩强;刘咏梅;王理;王阶
  • 通讯作者：
    王阶
冠心病“痰瘀滞虚”病机及临床研究
  • DOI：
    10.7661/j.cjim.20190201.031
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    中国中西医结合杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王阶;姚魁武;李军;邢雁伟;熊兴江;董艳;陈光;刘咏梅;李洪峥;张振鹏
  • 通讯作者：
    张振鹏
丹参酚酸B调节miR-210保护HUVEC过氧化损伤机制研究
  • DOI：
    10.16370/j.cnki.13-1214/r.2018.04.001
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    河北中医药学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张云;刘咏梅;程恒文;张盈颖;吴广均;王阶
  • 通讯作者：
    王阶
Network Pharmacology-Based Prediction and Verification of the Targets and Mechanism for Panax Notoginseng Saponins against Coronary Heart Disease
基于网络药理学的三七总皂苷抗冠心病作用靶点及机制的预测与验证
  • DOI：
    10.1021/acsami.5b07026
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Dong Yan;Duan Lian;Chen Heng wen;Liu Yong mei;Zhang Yun;Wang Jie
  • 通讯作者：
    Wang Jie
Transcriptome sequencing of lncRNA, miRNA, mRNA and interaction network constructing in coronary heart disease
冠心病lncRNA、miRNA、mRNA转录组测序及互作网络构建
  • DOI：
    10.1186/s12920-019-0570-z
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    BMC Medical Genomics
  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Liao Jiangquan;Wang Jie;Liu Yongmei;Li Jun;Duan Lian
  • 通讯作者：
    Duan Lian

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其他文献

冠状动脉粥样硬化性心脏病血瘀证基因组学研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    国际心血管病杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陈光;王阶;高嘉良;董艳
  • 通讯作者：
    董艳
冠心病血瘀证实质的系统生物学研究现状与思考
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中医杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    虞桂;王阶
  • 通讯作者：
    王阶
丹参中水溶性和脂溶性效应组分的提取优化工艺研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    时珍国医国药
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    章洪;程慧萍;郭丽丽;王阶
  • 通讯作者：
    王阶
生理药代动力学模型的特征及其国内外研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中国实验方剂学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    董宇;赵兰英;吴萍;王阶
  • 通讯作者：
    王阶
CYP450酶与中药代谢相互作用关系研究概况
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    中国中医药信息杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    董宇;王阶;杨庆;王怡薇;朱晓新
  • 通讯作者：
    朱晓新

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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