长链非编码RNA对缺血性中风中经络不同证候的影响及功能机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81860822
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    36.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3108.中医内科学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Disease burden of ischemic stroke (IS) is heavy, the pathogenesis of IS has not been elucidated. In the prevention and treatment of IS, it is meaningful to explore the differentiation basis and therapy target with different IS syndrome types. In our prophase research, through lncRNA microarray, qRT-PCR and cytoplasm-nucleus separation experiment, we found three lncRNAs located in nucleus and associated with the occurrence of IS. Therefore, hypothesis is as follows: these three lncRNAs may influence the occurrence and development of different traditional Chinese medicine (TCM) syndrome types with IS attacking on meridians. In order to verify the hypothesis, we firstly identify the diagnosis and prognosis lncRNA biomarkers of wind-phlegm blocking collaterals symptom and wind-yang disturbance syndrome with IS attacking on meridians. Secondly, we use CCK-8, flow cytometry and transwell assay in vivo and TTC staining, balance beam experiment and Zea Longa score in vitro to investigate the biological functions of lncRNAs. Finally, we screen and validate the RNA binding proteins of candidate lncRNA biomarkers through ChIRP-MS and RIP experiments. In this research, we can provide biological objective evidences for the differentiation with IS attacking on meridians, basic data for revealing the essential features of TCM syndromes, and clinical therapy targets for the prevention and treatment of IS.
缺血性中风(IS)疾病负担沉重,发病机制尚未阐明,探索IS辩证依据及治疗靶点对IS的防治具有重要意义。申请人前期运用lncRNA芯片、qRT-PCR、核质分离等技术鉴别出定位于细胞核中的3个lncRNAs与IS的发生相关。据此假设:3个lncRNAs可能影响IS中经络不同证候的发生发展。为验证假设,我们先从人群水平鉴别出IS中经络风痰瘀阻证、风阳上扰证的诊断及预后的lncRNAs生物标志物。然后,在细胞水平上运用CCK-8、流式细胞术、Transwell实验,在动物水平上通过TTC染色法、平衡木实验、Zea Longa评分,以探索lncRNA的生物学功能。再运用ChIRP-MS、RIP等技术,筛选及验证与候选lncRNAs结合的RNA结合蛋白。研究结果可为IS中经络辨证提供生物学客观依据,为阐明中风“证”本质提供基础数据,为IS防治提供治疗靶点。

结项摘要

缺血性中风(IS)疾病负担沉重,发病机制尚未阐明,探索IS辩证依据及治疗靶点对IS的防治具有重要意义。本项目首先通过大样本病例对照研究,从人群水平鉴别出可能与IS中经络风痰瘀阻证、风阳上扰证发生相关的lncRNA G066582和SERPINB9P1。然后,通过在A172细胞建立氧糖剥夺/再灌注(OGD/R)模型,运用细胞转染、qRT-PCR、CCK-8、流式细胞术、EdU细胞增殖实验、Transwell实验,发现lncRNA G066582可降低细胞活性、促进细胞凋亡、降低细胞迁移和增殖能力,而lncRNA SERPINB9P1可抑制细胞凋亡、增强细胞活力,从而阐明G066582和SERPINB9P1的生物学功能。再运用ChIRP-MS实验,筛选出可能与lncRNA SH3BP5-AS1特异性结合的7个蛋白(EL-S-270、LMNA、PS1TP5BP1、EEF1A1、PKM、KRT78、VIM),以及6个SERPINB9P1的潜在结合蛋白(MAP2K3、HNRNPK、HSPA2、VDAC1、PARK7、EEF1A1)。本项目鉴别出了与IS中经络风痰瘀阻证、风阳上扰证发生相关的lncRNAs,阐明了其生物学功能,筛选出与lncRNAs特异性结合的RNA结合蛋白。本项目研究成果可为IS中经络辨证提供生物学客观依据,为阐明中风“证”本质提供基础数据,为IS防治提供治疗靶点。本项目已发表3篇学术论文,3篇论文被期刊录用。培养了硕士研究生4名,博士研究生2名,均为在读研究生。还有2名课题组成员晋升职称。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Comprehensive Analysis of Blood-Based m6A Methylation in Human Ischemic Stroke
人类缺血性脑卒中血液 m6A 甲基化的综合分析
  • DOI:
    10.1007/s12035-022-03064-2
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    Molecular Neurobiology
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Lulu Zhu;Shengying Liu;Fangping Liao;Jialei Yang;Tian Liang;Yibing Yang;Xianli Huang;Lian Gu;Li Su
  • 通讯作者:
    Li Su
Machine Learning Analysis of MicroRNA Expression Data Reveals Novel Diagnostic Biomarker for Ischemic Stroke
MicroRNA 表达数据的机器学习分析揭示了缺血性中风的新型诊断生物标志物
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Stroke and Cerebrovascular Diseases
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xinyi Zhao;Xingmei Chen;Xulong Wu;Lulu Zhu;Jianxiong Long;Li Su;Lian Gu
  • 通讯作者:
    Lian Gu
急性缺血性脑卒中患者外周血LINC00342相对表达水平及其与临床特征的关系
  • DOI:
    10.1016/j.regpep.2013.10.002
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    广西医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱路路;吴旭龙;赵直;徐冰一;赵心怡;古联;苏莉
  • 通讯作者:
    苏莉

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其他文献

外周血 hsa_circRNA_104600 表达水平与急性缺血性脑卒中的关系研究
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    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中华中医药学刊
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    古联;陈卓;严雁;龙建雄;朱路路;苏莉
  • 通讯作者:
    苏莉

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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