肺癌血清肿瘤标志物寡核苷酸适配体的筛选及其应用研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81360333
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    42.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1813.肿瘤诊断
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

In the efforts to explore an approach of Lung Cancer early diagnoses, we proposed a new strategy by an oligonucleotide aptamer(ligand) attaching a polymerase chain reaction(PCR) template to detect tumor marker. The oligonucleotide aptamer is selected by systematic evolution of ligands by exponential enrichment(SELEX), so that after aptamer target binding, the template moiety serves as the PCR template in real-time quantitative PCR(RT-PCR), and therefore, the binding event can be reported by the following RT-PCR signals, the oligonucleotide aptamer is for target(tumor marker) sensing and detection with higher sensitivity and specificity. In our researching, we will efforts to establish a detection and assay method of multiple tumor markers from Lung Cancer serum by oligonucleotide aptamers attaching a PCR template, find new tumor markers, and establish libraries of tumor markers from Lung Cancer serum. The contents include that: <1>selecting and obtaining oligonucleotide aptamers of multiple tumor markers from Lung Cancer serum by SELEX. <2>establishing a oligonucleotide-aptamer-based assay method, which is attached a PCR template,for multiple tumor markers from Lung Cancer serum. <3>establishing libraries of tumor markers from Lung Cancer serum, for early, medium-term and terminal Lung Cancer.
寡核苷酸适配体(配基)可与靶分子特异性识别并相互结合。该项目拟利用消减指数级富集的配体进化系统(SELEX)技术筛选肺癌血清标志物(靶分子)的寡核苷酸适配体;利用具有实时定量PCR模板的核酸信标配基传感检测技术,针对多种肺癌血清标志物,建立肺癌血清多标志物分子检测技术;利用特异性配基获得肺癌血清标志物,研究和发现新的肺癌血清标志物,建立肺癌病人早期、中期和晚期血清标志物谱库,为肺癌早期诊断和治疗新方法的建立奠定科学和技术基础。 研究内容包括以下三个方面:<1>利用SELEX技术筛选多种肺癌血清标志物的寡核苷酸适配体;<2>研究和建立基于PCR模板配基的多分子血清标志物分子检测技术;<3>研究寡核苷酸适配体与肺癌血清标志物的分子间相互作用,建立肺癌病人早期、中期和晚期血清标志物谱库。

结项摘要

肺癌是严重威胁人类健康的恶性肿瘤之一。利用肺癌血清标志物发现肺癌,从而进行临床早期干预,对提高肺癌病人的治愈率和生存率具有重要的意义。本项目构建的核酸信标配基分子,可通过核酸适配体特异性识别和结合靶蛋白,将蛋白信号转化为信标配基的核酸信号。而双链信标配基序列可以进行PCR扩增,实现靶蛋白信号的指数级放大。该方法是一种高灵敏度的微量蛋白检测技术,可望成为一种肺癌病人血清早期检测方法。. 本项目利用SELEX技术,从肺癌血清中筛选获得了可与肺癌血清标志物特异性结合的寡核苷酸适配体,并对其中6条适配体序列与肺癌病人血清结合特异性进行了初步验证;以琼脂磁珠为载体,核酸信标配基为探针,建立了一种基于寡核苷酸适配体的肺癌血清标志物标志物RT-qPCR分子检测技术,优化了检测条件,并对其特异性和稳定性进行了验证;利用适配体Apt-1,从肺癌病人血清中调取获得了857种特异性蛋白质,初步开展了相关蛋白质的分类、比对等生物信息学研究工作。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
环氧基化磁性微球的制备及表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    西北师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曾家豫;杨楠;万波;马宁;廖世奇
  • 通讯作者:
    廖世奇
肺癌血清肿瘤标志物及其检测方法研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    甘肃医药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    廖世奇;万波;曾家豫;马梅兰
  • 通讯作者:
    马梅兰
癌胚抗原特异性单克隆抗体(Anti-CEA)核酸适配体的筛选
  • DOI:
    10.7655/nydxbns20150605
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    南京医科大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曾家豫;万波;马瑾;袁红霞;李星;赵运旺;廖世奇
  • 通讯作者:
    廖世奇

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其他文献

生物化学课堂教学的细节
  • DOI:
    10.13488/j.smhx.20180515
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生命的化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘国安;张丽娜;杨红;武国凡;曾家豫;张腾国
  • 通讯作者:
    张腾国
核酸适配体结合蛋白质靶标的亲和力表征方法及其在疾病诊断中的应用
  • DOI:
    10.13865/j.cnki.cjbmb.2018.04.04
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国生物化学与分子生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    汪靖;王进;曾家豫
  • 通讯作者:
    曾家豫
胃癌血清适配体的筛选及其鉴定
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    南京医科大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    葸玉琴;赵运旺;李东东;曾家豫;廖世奇
  • 通讯作者:
    廖世奇
双向热循环消减-SELEX方法筛选肝癌血清核酸适配体
  • DOI:
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    2019
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    --
  • 作者:
    曾家豫;张蕾;翟蒙;许金苓;袁红霞;王维君;陈聪盈;田彩平;廖世奇
  • 通讯作者:
    廖世奇
核酸适配体在肿瘤血清标志物筛选中的应用研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生物医学工程学杂志
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    --
  • 作者:
    马淑玲;曾家豫
  • 通讯作者:
    曾家豫

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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