LPxTG酶突变在B族链球菌CC17侵袭性中的功能及机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81902121
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2602.微生物学检验
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

CC17 is the most popular invasive GBS, The exactly molecular mechanism is not clear. By sequence analysis of multiple invasive GBS strains, and found that several SNPs in genes of the LPxTG enzyme named SAP and ScpB were significantly different from the colonized strains. Bioinformatics analysis indicated that the mutant amino acids occurred in the core domains of SAP and ScpB, Evolutionary analysis showed that the mutant SNP strains aggregated into clade1,all stains are CC17 in clade1, and the mutated gene sequence is totally consistent with the popular invasive strain COH1. It is hypothesized that the LPxTG enzyme mutation affects the invasive function of CC17 and the SNPs are related to the evolution. In this study, six mutant strains were constructed by using COH1 and A909 as recipient strains, and the invasive differences of mutant strains in in vitro functional experiments and in vivo experiments were compared, and the specific functions of LPxTG enzyme mutations in CC17 invasion were clarified. Revealing the mechanism of joint mutation of SAP and ScpB leading to the invasion of CC17; continue to complete the local saved GBS strains genome sequencing, establish the published GBS-WGS database, and clarify the specific characteristics of LPxTG enzyme gene SNPs in GBS epidemic and evolution, To provide evidence for the study of CC17 pathogenesis.
CC17是最主要流行的侵袭性GBS群,其致病的确切分子机制尚不明确。课题组前期完成多个GBS侵袭株测序,发现LPxTG酶SAP和ScpB基因的SNP与定植株差异显著,生物信息学分析提示突变氨基酸发生在SAP和ScpB的核心结构域,进化分析显示突变SNP株聚集为一个Clade1,均为CC17,突变基因序列与高侵袭流行株COH1比对高度一致,提出LPxTG酶突变影响CC17侵袭性功能并与其遗传进化有关假说。本研究拟以COH1和定植株A909为受体菌构建6种突变菌株,比较突变菌株在体外功能实验及小鼠体内实验中的侵袭性差异,明确LPxTG酶突变在CC17侵袭性中的具体功能,揭示SAP和ScpB联合突变导致CC17侵袭性增强的机制;继续完成本地已保存GBS全基因组测序,建立已公布GBS-WGS数据库,阐明LPxTG酶基因SNP在GBS流行与进化中的具体特征,为研究CC17致病机制提供有力证据。

结项摘要

CC17是最主要流行的侵袭性GBS群,其致病的确切分子机制尚不明确。课题组前期完成多 个GBS侵袭株测序,发现LPxTG酶SAP和ScpB基因的SNP与定植株差异显著,生物信息学分析提示 突变氨基酸发生在SAP和ScpB的核心结构域,进化分析显示突变SNP株聚集为一个Clade1,均为 CC17,突变基因序列与高侵袭流行株COH1比对高度一致,提出LPxTG酶突变影响CC17侵袭性功能并与其遗传进化有关假说。课题期间完成阐明不同LPxTG酶突变(SAP)的标准菌株(COH1和A909)体外功能,部分结果有显著差异。完成对T7Iq:pET28a:sap(COH1); T7Iq:pET28a:sap(A909)两个菌株的较大培养量(1L)的SAP蛋白提取和完成后续纯化(采用FPLC平台),进行纯化蛋白的体外功能试验DNS,显示纯化蛋白具有相应功能,并显示出功能有差异,P=0.0003。建立SAP蛋白提取及纯化平台,并进一步从蛋白层面证实不同SNP模型的SAP体外功能具有差异在菌株层面和纯化蛋白层面的体外实验验证LPXTG相关的毒力因子SAP功能研究。构建完成本地GBS-WGS检测平台和生物信息分析平台,选取本地侵袭性GBS菌株共111株,2021年孕产妇定植GBS菌株120株及早期定植菌株22株,共计253株进行WGS, 目前已完成133株GBS数据本地化存储与分析,其中侵袭性菌株全部完成生物信息分析。完成构建既定GBS菌株基因组的同线性分析模型及特异性SNP位点的定位,完成构建既定GBS菌株基因组的进化树结合其它重要信息的集成可视图形化分析模型。并完成建立网页版可视化生物信息分析,明确LPxTG酶突变SNP在GBS中流行分布规律和遗传特征,为研究CC17致病机制提供有力证据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
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专利数量(0)
Occurrence and Characteristics of Mcrs among Gram-Negative Bacteria Causing Bloodstream Infections of Infant Inpatients between 2006 and 2019 in China.
2006-2019年我国婴幼儿血流感染革兰氏阴性菌MCR发生情况及特点
  • DOI:
    10.1128/spectrum.01938-21
  • 发表时间:
    2022-02-23
  • 期刊:
    Microbiology spectrum
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Wu L;Xu T;Ji Y;Song J;Wang F;Huang J;Zhou K
  • 通讯作者:
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高通量测序技术在B族链球菌鉴别分型中的研究进展
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  • 通讯作者:
    吴丽娟
The accuracy and influencing factors for preference of self-sampling in group B streptococcus screening: a cross-sectional study
B族链球菌筛查中自我取样的准确性及影响因素:一项横断面研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2021-01-12
  • 期刊:
    JOURNAL OF MATERNAL-FETAL & NEONATAL MEDICINE
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    Chen, Ruirui;Wu, Lijuan;Zhu, Yuanfang
  • 通讯作者:
    Zhu, Yuanfang

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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