基于蛋白质组学和脂质组学研究脂肪酸2-羟化酶调控肿瘤细胞能量代谢的分子机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31770887
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2103.生命组学技术
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Dysfunction of energy metabolism is popular in various cancer cells. Fatty acid 2-hydroxylase (FA2H) is a recently identified NAD(P)H-dependent enzyme, which catalyze the formation of 2-hydroxy fatty acid(2-OHFA). We found that in adipocyte FA2H regulate the glucose and lipid metabolism by increasing the fluidity of membrane lipid raft. This indicates there exists the relationship among FA2H, caveolae, and cellular energy metabolism. Western blot experiment indicates FA2H is highly expressed in human colorectal cancer cell. But the underlying role and mechanism of FA2H in colorectal cancer development is still poorly clear. Based on these findings, we will here study on the mechanism of FA2H in modulation of cellular energy metabolism in colorectal cancer cell using the combination of SILAC-based quantitative proteomics, MS-based lipid analysis technique, bioinformatics, and molecule biological methods. We here hypothesize that caveolae and protein palmitoylation mediate the regulation of cellular energy metabolism by FA2H, based on the fact that 2-OHFA, the catalytic product of FA2H, is involved in the production of 2-OH sphingolipid and the process of protein palmitoylation. Our study will help us understand the physiological and pathological significance of FA2H in colorectal cancer development and provide information for seeking novel theraputic target for colorectal cancer cell.
细胞能量代谢异常是肿瘤细胞的特征之一。脂肪酸2-羟化酶(FA2H)是近年发现的一种NAD(P)H依赖性酶,可催化2-羟基脂肪酸(2-OHFA)生成。申请人近期研究发现FA2H通过调节胞膜脂筏的流动性来调控脂肪细胞的糖脂代谢,提示FA2H、caveolae、细胞能量代谢之间存在某种必然联系。我们的预实验证明FA2H在人结肠癌细胞中高表达,但其在肿瘤发生发展尤其在结直肠癌中的作用及机制尚不清楚。基于此,本项目拟利用SILAC定量蛋白质组学、基于质谱的脂质分析、分子生物学等多种研究手段,围绕FA2H催化产物2-OHFA两种可能的代谢去路-生成2-羟基鞘脂和参与蛋白质棕榈酰化修饰,研究FA2H调控结肠癌细胞能量代谢的分子机制。我们认为caveolae和蛋白质棕榈酰化修饰介导了FA2H的调控过程。这些研究将有助于理解FA2H在结肠癌发生发展中的生理学和病理学意义,并为寻找结肠癌治疗新靶点提供新思路。

结项摘要

结直肠癌是全球常见的恶性肿瘤之一,具有易转移易复发的特点,其发病率和死亡率在癌症中均位居前列。脂肪酸-2-羟化酶(fatty acid-2-hydroxylase, FA2H)可催化2-羟基脂肪酸的生成,参与调控肿瘤细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等生理过程。代谢重编程是肿瘤细胞的一个显著特征。肿瘤细胞因其异质性,使其代谢方式更为复杂。本项目借助基于TMT和SILAC标记的定量蛋白质组学和分子生物学技术,以人结直肠癌LoVo和HT-29细胞系作为研究对象,揭示了FA2H通过介导人结肠癌细胞代谢重编程调控其迁移侵袭的潜在分子机制。 研究发现FA2H的调控机制存在细胞异质性的特点,与肿瘤细胞所处的微环境密切相关。本项目的研究结果为挖掘FA2H在结肠癌发生发展中的生理学和病理学意义,发现结肠癌治疗的新靶点提供了新的思路。

项目成果

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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