基于多个基因序列探讨华北耧斗菜复合体内无距性状的起源问题

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31700180
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0202.植物系统发生与进化
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The multiple origins in closely related species have been attracting a lot of attention in evolutionary researches. There is evidence for the multiple origins of Aquilegia ecalcarata Maxim. from the Aquilegia yabeana complex, according to the phylogenetic tree based on chloroplast DNA. As the only species in the genus who has no spur, A. ecalcarata together with Aquilegia yabeana、A. oxysepala var. kansuensis、A. rockii、A. ecalcarata f. semicalcarata (Schipcz.) Hand-Mazz. comprise a monophyletic group. However, the origin times and ancestor species of A. ecalcarata have not been totally solved, it requires evidence from nuclear gene data to further confirm the results based on chloroplast DNA. Our research plans to sample representative populations from different locations, adopt both chloroplast and nuclear gene fragments as molecular markers, perform morphological measurements, apply molecular systematics and statistical analysis to focus on the following questions: 1) the phylogenetic relationship among Aquilegia yabeana complex, and the ancestor species of A. ecalcarata, how many times A.ecalcarata originated; 2) estimate the divergence time among the species complex; 3) how the key phenotypes vary within populations, between populations and among species. Since the diversity of spur in Aquilegia is closely related to the species divergence and reproductive isolation, “spurless status” has unique significance in the genus. Our research will provide important information for the origin of A. ecalcarata and laid foundation for its speciation and divergence researches in the future.
近缘物种中的多次起源问题一直引人关注。基于叶绿体DNA片段的系统发育树表明,华北耧斗菜复合体中的无距耧斗菜可能为多次起源。作为耧斗菜属中唯一的无距种,其与4个有距的种华北耧斗菜、甘肃耧斗菜、直距耧斗菜、细距耧斗菜构成一个单系类群。无距耧斗菜的起源次数和祖先类群尚未得到彻底解决,需要来自核基因的数据才能进一步证实。本项目拟以该复合体为研究对象,选取不同分布地点居群,采用多个叶绿体基因和核基因片段,并进行多个性状的测量,利用分子系统学手段和形态学数据统计分析,探讨:1)复合体内部的谱系关系,无距性状的起源次数和起源类群;2)估算复合体内部的分化时间;3)距长等重要性状在居群内、居群间、物种间的变异式样。由于距的多样性与耧斗菜属的适应性辐射和生殖隔离密切相关,无距性状在该属中具有独特意义。本项目的结果将为深入认识“无距”性状的起源提供重要信息,为后续开展该复合体内的物种形成研究奠定基础。

结项摘要

近缘物种中的多次起源问题不仅引人关注,而且在实际研究中充满挑战,基因渐渗或杂交事件会干扰对多次起源的判定,要彻底排除杂交的影响,需来自遗传水平、表型水平的多重证据。作为耧斗菜属中唯一的无距种,无距耧斗菜与3个有距的种华北耧斗菜、甘肃耧斗菜、直距耧斗菜构成一个单系类群,但其起源次数和祖先类群尚未得到彻底解决。本项目基于前期研究结果,推测华北耧斗菜复合体中的无距耧斗菜可能为多次起源。但其他研究表明,耧斗菜属物种之间易发生杂交,因此无距耧斗菜中目前发现的多次起源是真实存在,还是杂交所致,需来自核基因的数据进一步证实。本项目以该复合体为研究对象,提出无距耧斗菜四种起源模型,利用多个居群和多个叶绿体基因、核基因片段,并开展多个性状测量,进行分子系统学和形态学数据分析,探讨:1)复合体内部的谱系关系,无距性状的起源次数和起源类群;2)估算复合体内部的分化时间;3)距长等重要性状在居群内、居群间、物种间的变异式样。.重要结果为:1)基于42个居群,15个核基因片段和3个叶绿体片段阐明无距耧斗菜内部存在显著的遗传分化(FST=0.308)且二者之间基因流水平较低(2N1M1= 0, 2N2M2 = 0.172),排除杂交模型,推测独立起源自甘肃耧斗菜和直距耧斗菜,起源时间在0.6-0.9Myr;2)22个花部和19个营养性状分析揭示无距耧斗菜1和2之间在13个性状上存在显著差异,无距2(2.08±1.21mm)的距长显著大于无距1(1.31±0.53mm);3)结合遗传分化、表型分化和不同的地理分布,建议将无距1和无距2处理为两个物种,且二者均偏好多石的生境,表明对新生境的平行进化可能是其独立起源的重要机制。由于距的多样性与耧斗菜属适应性辐射和生殖隔离密切相关,无距性状在该属中具有独特意义,其多次独立起源证明即使在基因流较为普遍的类群中,重要性状也可能发生平行进化,丰富了人们对性状演化与物种起源的认识。同时,“距”在其他植物类群的适应性分化中亦扮演重要角色,本项目的结果将为同类研究提供有益借鉴与重要参考。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic diversity and evolutionary history of four closely related Aquilegia species revealed by 10 nuclear gene fragments
10个核基因片段揭示四种密切相关的耧斗菜物种的遗传多样性和进化史
  • DOI:
    10.1111/jse.12298
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of Systematics and Evolution
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Huang Lei;Geng Fang Dong;Fan Jing Jing;Xue Cheng;Zhang Xiao Yan;Kang Ju Qing;Zhang Jian Qiang;Ren Yi
  • 通讯作者:
    Ren Yi
Morphological variation pattern of Aquilegia ecalcarata and its relatives
耧斗菜及其近缘种的形态变异规律
  • DOI:
    10.1111/jse.12494
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Journal of Systematics and Evolution
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Xue Cheng;Geng Fang-Dong;Zhang Xiao-Yan;Chang Xiao-Peng;Kang Ju-Qing;Huang Lei;Zhang Jian-Qiang;Ren Yi
  • 通讯作者:
    Ren Yi

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
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          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
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