基于影像计算的人体气道树结构和功能分析方法与其在COPD中的应用研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81671773
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    56.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2708.医学图像数据处理、分析与可视化
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is the major cause of premature adult deaths in all counties of the world. Multi-detector Computed Tomography (MDCT) has become an effective and invaluable tool for the diagnosis of COPD, but the automatic analysis of airway structure is difficult and the ventilation function cannot be revealed. This project will firstly study the approach of automatic extraction from MDCT images and assessment of the airway tree, and determine the geometrical parameters of airway tree including the length, sectional area, wall thickness, branch angle, rotation angle of each generation of bronchus. Secondly, the subject-specific structure model extracted from CT images will be imported into the software of Finite Element Analysis (FEA), the simulation of Computational Fluid Dynamics (CFD) will be conducted to calculate the ventilation measures such as the air velocity, wall pressure and wall shear stress. Meanwhile experiments will be done using the airway tree fabricated by 3D printer. Thirdly, the proposed approaches will be applied to the subjects with COPD, and the influence of COPD on the structural and functional airway measures can be quantified. Finally, we will build up the risk evaluation model, phenotype classifier and the progression prediction model of COPD, and find imaging biomarkers of COPD which are more sensitive and suitable for clinic applications.
慢性阻塞性肺疾病(COPD)严重危害人类健康,带来沉重的社会经济负担。多排探测器计算机断层成像(MDCT)是一种有效的、非创伤性气道疾病研究和评价手段,但缺少定量化的气道结构分析方法,且无法反映气道通气功能。本项目首先研究气道树的自动提取和分析方法,确定各级支气管长度、横截面积、壁厚、分叉角度和反转角度等气道树几何结构参数;然后,以提取的气道树作为个性化结构模型输入到有限元计算软件,开展计算流动动力学(CFD)仿真,并通过3D打印制作气道树开展实验研究,计算和测量气道树中空气流速、壁面压力和壁面剪切应力等通气功能参数;接着,将上述方法应用到COPD患者,明确COPD对气道结构参数和通气功能参数的影响;最后,将气道结构和功能参数相结合,利用机器学习方法构建COPD风险评估、表型分类和进展预测模型,发现适用于临床的、更为敏感的、基于影像的COPD生物标记物。

结项摘要

慢性阻塞性肺病(COPD)已经成为全球公共卫生问题之一。定量化、区域化检测气道结构和功能变化是COPD研究、早期诊断和治疗的关键步骤。多探测器计算机断层成像(MDCT)是一种重要的、非创伤性的、气道疾病定量评价手段,但在气道自动提取、通气功能计算、影像生物标记物方面存在挑战。.本项目主要研究内容包括:(1)气道自动提取和结构分析;(2)气道通气功能计算和分析;(3)COPD影像生物标记物的发现与评价。. 在第一部分中,持续改进MDCT图像中气道树自动提取方法,实现了一种末端细支气管搜索与连接方法,一种基于3D U-Net网络的深度学习提取方法。提升了气道提取的长度和级数,Dice指数、末端叶子节点提取率和气道长度提取率可达0.91,83.1%和89.6%,高于nnU-Net的0.88,63.7%和68.6%。为精确表征COPD气道树结构改变提供了重要方法学支撑。同时,发现COPD组气道树级数和长度均明显减小,重度COPD气道树大幅度裁剪。. 在第二部分中,建立并验证了气道树提取建模、边界条件设定、CFD计算、气道功能参数提取分析等一整套方法。基于该方法,研究了气管支气管变异下的空气流动、COPD患者气道树中的颗粒沉降、肺癌患者肺叶切除术后气道树结构与功能改变。结果表明,在气管支气管后侧壁面剪切应力明显增大,可能与局部炎症和咳嗽有关;COPD患者气管狭窄位置影响沉降效率和比率,这有助于提高吸入性药物治疗疗效;肺叶切除术后气道树严重变形可能会导致术后气短。. 在第三部分中,基于气道树2D快照、肺区形态2D快照、深度CNN迁移多示例学习,提出并实现了三种COPD疾病预测方法和模型,预测准确率可达99.29%。继而,提出了一种由聚类方法生成数据训练的CT影像中肺实质提取CNN模型,将气肿和COPD患者之间肺区密度开展了对比。结果表明,深度学习适合于利用CT图像识别COPD,通过CT扫描和肺癌筛查可以帮助从大量人群中发现COPD高危亚群。. 总之,项目从影像计算角度揭示了COPD气道树的结构和功能改变,对于认识COPD疾病的本质、特征和发生、发展规律,实现早期诊断和及时有效治疗具有重要帮助。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
Segmentation of lung parenchyma in CT images using CNN trained with the clustering algorithm generated dataset
使用由聚类算法生成的数据集训练的 CNN 对 CT 图像中的肺实质进行分割
  • DOI:
    10.1186/s12938-018-0619-9
  • 发表时间:
    2019-01-03
  • 期刊:
    BIOMEDICAL ENGINEERING ONLINE
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Xu, Mingjie;Qi, Shouliang;Qian, Wei
  • 通讯作者:
    Qian, Wei
DCT-MIL: Deep CNN transferred multiple instance learning for COPD identification using CT images
DCT-MIL:深度 CNN 使用 CT 图像传输多实例学习来识别 COPD
  • DOI:
    10.1088/1361-6560/ab857d
  • 发表时间:
    2020-07-21
  • 期刊:
    PHYSICS IN MEDICINE AND BIOLOGY
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Xu,Caiwen;Qi,Shouliang;Qian,Wei
  • 通讯作者:
    Qian,Wei
Ensemble Learning of Multiple-View 3D-CNNs Model for Micro-Nodules Identification in CT Images
用于 CT 图像微结节识别的多视图 3D-CNN 模型的集成学习
  • DOI:
    10.1109/access.2018.2889350
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    IEEE Access
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Monkam Patrice;Qi Shouliang;Xu Mingjie;Li Haoming;Han Fangfang;Teng Yueyang;Qian Wei
  • 通讯作者:
    Qian Wei
Radiomics方法研究应用进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    肿瘤
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙航;李宏;张亭亭;滕月阳;齐守良;钱唯
  • 通讯作者:
    钱唯
Particle Disposition in the Realistic Airway Tree Models of Subjects with Tracheal Bronchus and COPD.
气管支气管和 COPD 受试者真实气道树模型中的颗粒分布
  • DOI:
    10.1155/2018/7428609
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    BioMed research international
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang B;Qi S;Yue Y;Shen J;Li C;Qian W;Wu J
  • 通讯作者:
    Wu J

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其他文献

一种人体气道树快速自动提取算法的医学评价和应用
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基于胸部CT图像的肺结节分割
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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
    康雁
一种改进的投票算法检测细胞核
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
    辜嘉
一种人体气道树快速自动提取算法的设计
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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    郭启勇
面向临床肿瘤诊疗决策的多模态医学影像融合
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国生物医学工程学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    齐守良;岳勇;辛军;康雁
  • 通讯作者:
    康雁

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基于深度学习的COPD影像表型、炎性表型与糖皮质激素疗效预测研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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