LncRNA PRR11-AS1通过PRR11及p53通路调控细胞增殖与凋亡影响肺腺癌预后的分子机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81902319
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1813.肿瘤诊断
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Lung cancer is the most common malignant tumor in China, in which lung adenocarcinoma accounts for about 50% lung cancer in total. The prognostic mechanism affecting it has not been fully elucidated. A variety of long non-coding RNAs (lncRNAs) have been found to be associated with lung adenocarcinoma survival. We found that lncRNA PRR11-AS1 is associated with lung adenocarcinoma patient’s survival by bioinformatics data mining. By measuring lncRNA PRR11-AS1 expression in clinical samples, we confirmed that the high expression of lncRNA PRR11-AS1 in lung adenocarcinoma tissue. The overexpression of lncRNA PRR11-AS1 could promote lung adenocarcinoma cell proliferation and inhibit cell apoptosis. Further experiments showed that overexpression of lncRNA PRR11-AS1 could decrease the expressions of p53 downstream target genes including Noxa, Bax, Puma and p21. We propose the following hypothesis: "lncRNA PRR11-AS1 can regulate p53 pathway, affecting the proliferation and apoptosis of lung adenocarcinoma cells, and can participate in the prognostic process of lung adenocarcinoma". On the basis of pre-experiment, this project intends to understand the molecular mechanisms that how lncRNA PRR11-AS1 regulates lung adenocarcinoma cells by cell transfection, co-immunoprecipitation, and other experimental methods, which provides new molecular targets for the treatment of lung adenocarcinoma.
肺癌是我国最常见的恶性肿瘤,肺腺癌约占肺癌总数的一半,影响其预后机制尚未完全阐明。已有多种长链非编码RNA(lncRNA)被发现与肺腺癌预后存在相关性。本课题组通过生物信息学挖掘,发现肺腺癌患者癌组织中lncRNA PRR11-AS1与生存密切相关,其后在临床样本中证实lncRNA-PRR11-AS1在肺腺癌组织中高表达,转染lncRNA-PRR11-AS1慢病毒表达载体可以促进肺腺癌细胞的增殖同时抑制细胞凋亡,使p53通路相关蛋白Noxa、Bax、Puma及p21的表达显著下调。因此,我们提出假说“lncRNA-PRR11-AS1可以调控p53通路,影响肺腺癌细胞增殖与凋亡,参与预后过程”。在预实验的基础上,本课题拟在细胞模型中通过细胞转染、免疫沉淀技术等实验方法,深入探讨其在肺腺癌预后进程中的作用及相关分子机制,为肺腺癌的治疗寻找新的分子靶点。

结项摘要

肺腺癌占肺癌的比例约为35%-40%,了解影响其预后的因素是延长患者生存的重要研究方向。随着生物信息学的成熟,越来越多的长非编码链RNA被发现与肿瘤预后相关。我们前期生物信息学分析发现新型长非编码链RNA PRR11-AS1与肺腺癌的预后相关。为了进一步明确该长非编码链RNA发挥的生物学作用,我们通过整合多个开源数据库的分析,包括GEPIA2、UALCAN、CCLE、cBioportal、MEXPRESS、Metascape等,研究了PRR11和PRR11-AS1表达谱、甲基化调控、免疫浸润、癌症细胞干细胞、对生物功能的影响。我们进一步发现PRR11基因表达与临床指标、预后影响和潜在药物之间的相关性。. 本项目结果提示,PRR11-AS1在泛癌水平存在异常表达情况。PRR11的异常表达可能受到基因突变或甲基化的影响。PRR11可影响许多生物学机制,包括细胞周期、铁蛋白脱失、RNA m6A甲基化修饰、自噬。在转化医学意义上,PRR11的异常表达与LUAD的多个临床评估者相关。值得注意的是,PRR11表达对LUAD预后的影响也在独立数据库和荟萃分析中得到验证。. 在项目执行期间,发表了高水平学术论文5篇,其中SCI收录5篇;培养了博士研究生2名。本课题研究结果提示了新型长非编码链RNA PRR11-AS1在肺癌预后中发挥多种潜在影响,为进一步研究该分子如何参与肺癌侵袭、转移的分子机制和挖掘长非编码链RNA预后标志物研究提供数据基础。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Lung segmentectomy assisted by highly selective independent segmental ventilation: a series of three cases
高选择性独立节段通气辅助肺段切除术:三例系列报道
  • DOI:
    10.1186/s13019-021-01474-2
  • 发表时间:
    2021-04-15
  • 期刊:
    Journal of Cardiothoracic Surgery
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Shi X;Ye J;Chen J;Zhai J;Liu X;Lu D;Lin Z;Ni Z;Wu H;Cai K
  • 通讯作者:
    Cai K
Integrative pan cancer analysis reveals the importance of CFTR in lung adenocarcinoma prognosis
综合泛癌分析揭示 CFTR 在肺腺癌预后中的重要性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Xiaoshun Shi;Mengying Kou;Xiaoying Dong;Jianxue Zhai;Xiguang Liu;Di Lu;Zhen Ni;Jianjun Jiang;Kaican Cai
  • 通讯作者:
    Kaican Cai
The first comprehensive database of germline pathogenic variants in East Asian cancer patients
第一个东亚癌症患者种系致病变异综合数据库
  • DOI:
    10.1093/database/baab075
  • 发表时间:
    2021-12-29
  • 期刊:
    Database
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Shi X;Li R;Zhai J;Chen AM;Huang K;Zheng Z;Chen Z;Dong X;Liu X;Lu D;Feng S;Diao D;Ren P;Liu Z;Morahan G;Cai K
  • 通讯作者:
    Cai K
IRGS: an immune-related gene classifier for lung adenocarcinoma prognosis
IRGS:肺腺癌预后的免疫相关基因分类器
  • DOI:
    10.1186/s12967-020-02233-y
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Journal of Translational Medicine
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Xiaoshun Shi;Ruidong Li;Xiaoying Dong;Allen Menglin Chen;Xiguang Liu;Di Lu;Siyang Feng;He Wang;Kaican Cai
  • 通讯作者:
    Kaican Cai
Current Evidence of the Efficacy and Safety of Neoadjuvant EGFR-TKIs for Patients With Non-small Cell Lung Cancer
新辅助 EGFR-TKI 对非小细胞肺癌患者疗效和安全性的现有证据
  • DOI:
    10.3389/fonc.2021.608608
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in Oncology
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Shi X;Dong X;Zhai J;Liu X;Lu D;Ni Z;Wu H;Cai K
  • 通讯作者:
    Cai K

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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