中国人群X染色体上STR和InDel遗传标记的多态性研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81302620
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2502.法医物证学及法医人类学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31
  • 项目参与者:
    孙宽; 赵珍敏; 胡真; 赵书民;
  • 关键词:

项目摘要

Paternity testing is one of the major contents of forensic genetics. Based on the platform of capillary electrophoresis, the multiple fluorescent PCR and genotyping technology is the main method for STR analysis. Nowadays, the generally applied STR genotyping kits were principally focused on studying of auto-chromosomes, which can’t provide effective genetic information for special cases such as the judgement of relationships between grandmother and granddaughter without any references or half-sib sisters with the same father, et al. By virtue of the unique genetic law of X chromosome, it plays an important role in the cases mentioned above. However, not so much studies were observed in the research of genetic markers on X chromosome today, national or international. Based on the previous working experiences, we intend to study genetic markers of STR and InDel on X chromosome in Chinese population systematically. Screening out a group of X-STR and X-InDel markers with excellent forensic application values which can be generally applied in the main nations of China and building a genotyping system accordingly is our final aim, which can not only enrich the genetic information study on X chromosome, but also provide a new technological method for special paternity testing.
亲缘关系鉴定是法医物证学研究的主要内容之一。依托短串联重复序列STR标记,基于毛细管电泳技术平台的多重荧光复合扩增分型技术是目前国内外的主要技术手段。目前,国内外所普遍使用的STR分型试剂盒主要局限在人类常染色体上,对于一些诸如缺少参照样本的祖母与孙女、同父姐妹等类型的案件,尚不能够提供有效的遗传信息。X染色体由于其独特的遗传规律,在上述类型的案件鉴定中具有重要的应用价值。目前,国内外对于X染色体上遗传标记的研究尚不多见。本课题拟在前期工作基础上,系统研究中国人群X染色体上的STR和InDel遗传标记,筛选出一组具有良好法医学应用价值在中国主要民族中具有通用性的X-STR基因座和X-InDel位点并建立相应的分型体系,不仅丰富了X染色体上的遗传信息,更能为特殊亲缘关系鉴定提供新的技术手段。

结项摘要

亲缘关系鉴定是法医物证学研究的主要内容之一。依托短串联重复序列STR标记,基于毛细管电泳技术平台的多重荧光复合扩增分型技术是目前国内外的主要技术手段。目前,国内外所普遍使用的STR分型试剂盒主要局限在人类常染色体上,对于一些诸如缺少参照样本的祖母与孙女、同父姐妹等类型的案件,尚不能够提供有效的遗传信息。X染色体由于其独特的遗传规律,在上述类型的案件鉴定中具有重要的应用价值。目前,国内外对于X染色体上的遗传标记的研究尚不多见。针对X染色体遗传标记开发的国际商业化试剂盒仅有一个(德国Qiagen公司的Investigator X-12试剂盒)。本研究在前期工作基础上,系统研究中国人群X染色体上的STR和InDel遗传标记,筛选出一组具有良好法医学应用价值在中国主要民族中具有通用性的X-STR基因座和X-InDel位点并建立相应的分型体系,从灵敏度、特异性、准确性、重复性、样本的适用性、对混合物的分型能力这几个方面着手,对试剂盒进行了优化及评估。这一优化体系的构建为法医学进一步丰富了X染色体上的遗传信息,可为特殊亲缘关系鉴定提供新的技术手段。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Population genetic study of 34 X-Chromosome markers in 5 main ethnic groups of China
中国5个主要民族34个X染色体标记的群体遗传学研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Suhua Zhang
  • 通讯作者:
    Suhua Zhang
二代测序技术在法医学中的应用进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    法医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张素华
  • 通讯作者:
    张素华
Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci System
利用26个Y-STR基因座系统分析维吾尔族遗传混合
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Suhua Zhang
  • 通讯作者:
    Suhua Zhang
Parallel Analysis of 124 Universal SNPs for Human Identification by Targeted Semiconductor Sequencing
通过靶向半导体测序对 124 个用于人类识别的通用 SNP 进行并行分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Suhua Zhang
  • 通讯作者:
    Suhua Zhang
Developmental validation of an X-Insertion Deletion polymorphism panel and application in HAN population of China
X-插入缺失多态性panel的开发验证及其在中国汉族人群中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Sci Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Suhua Zhang
  • 通讯作者:
    Suhua Zhang

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低温与氮耦合对水稻内源激素含量的影响
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基于multi-SNP标记及不拆分策略的复杂混合样本身份溯源研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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