超分辨成像方法建立乳腺癌细胞中生长因子受体聚合与蛋白激酶活化之间的定量预测模型

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31500695
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0509.生物学过程与代谢
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Targeted biological agents that aim to inhibit specific membrane receptors, such as EGFR and its related family members, have been widely applied in both oncological researches and clinical trials for a majority of tumor types including breast, lung, gastrointestinal and urological malignancies. These receptors are believed to play important roles in cancer development and progression by activating critical protein kinases via complex signaling pathways. However, only a small portion of patients with overexpression of such receptors respond to specific molecular-targeted therapies. Improvement requires identification of definitive predictive biomarkers and biophysical organizations of them, which remain very challenging. Here we propose to use our super-resolution imaging technique to reveal the organizational status of oligomerization of several critical growth factor receptors, and, with developed mathematical tools, to derive an image parameters-based model for the prediction of protein kinase activation in breast cancer cells, probing the non-genetic cell-to-cell heterogeneity. Our suite of technologies will greatly advance the understanding of breast cancer development, and set a potent approach to achieve the ultimate goal of enabling more informed personalized molecular-targeted therapies and more accurate clinical prognosis.
抑制特定细胞膜受体——例如人表皮生长因子受体——的靶向生物制剂已被广泛应用于大多数肿瘤类型的研究和临床试验,包括乳腺癌,肺癌,胃肠癌,泌尿系统癌症等等。这些受体通过复杂的信号传递通路激活关键的蛋白激酶,在癌症发生发育中扮演重要角色。然而,在过表达这些受体的病人中,仅有一小部分对特定分子靶向治疗有反应。要改善医疗效果,必须能够识别确定性预测生物标记物并了解它们的生物物理组构,而这依然是非常有挑战性的。这里我们提出用我们的超分辨率成像技术揭示几种关键生长因子受体寡聚的组构状态,结合特别发展的数学工具,建立一个基于图像参数的模型以预测乳腺癌细胞中的蛋白激酶活化,探索癌细胞间非基因因素的异质性。我们的整套技术将极大地促进对乳腺癌发育的了解,并为达到对癌症更知情的个人化分子靶向治疗和更准确的临床预后这一最终目标开辟一个强力有效的方法途径。

结项摘要

对于乳腺癌、肺癌等多种癌症,生长因子受体在其发生发育中扮演重要角色。细胞膜上的这些受体在与它们对应的生长因子结合后发生聚合并被激活,通过复杂的信号传递通路激活关键的蛋白激酶,从而调控癌细胞的生长与增殖。因此,抑制特定细胞膜受体——例如人表皮生长因子受体——的靶向生物制剂已被广泛应用于大多数肿瘤类型的研究和临床试验,包括乳腺癌,肺癌,胃肠癌,泌尿系统癌症等等。然而,在过表达这些受体的病人中,仅有一小部分对特定分子靶向治疗有反应。要改善医疗效果,必须能够识别确定性预测生物标记物并了解它们的生物物理组构,以及这些组构参数和癌细胞生长激活之间的关联。而这依然是非常有挑战性的。在这项研究中我们发展了一种双通道超分辨率荧光成像技术,对不同波长量子点标记的两种关键生长因子受体EGFR和c-Met的寡聚体成像,并提取出其聚合度(N)、单体间距(d)和异聚组分比(s)等生物物理参数。随后我们发展了一套贝叶斯统计方法,建立了基于这些超分辨图像参数的定量模型,以精准预测(92%准确度)乳腺癌细胞中的蛋白激酶MAPK的磷酸化(即活化)度,探索癌细胞间非基因因素的异质性。我们的整套技术将极大地促进对乳腺癌发育的了解,并为达到对癌症更知情的个人化分子靶向治疗和更准确的临床预后这一最终目标开辟一个强力有效的方法途径。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crybb2 associates with Tmsb4X and is crucial for dendrite morphogenesis
Crybb2 与 Tmsb4X 结合,对于树突形态发生至关重要
  • DOI:
    10.1016/j.compbiomed.2018.05.029
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Biochemical and Biophysical Research Communications
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Sun Minxuan;Ahmad Nafees;Zhang Ruobing;Graw Jochen
  • 通讯作者:
    Graw Jochen

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其他文献

医学研究生压力源与人格特征及社会支持的相互关系
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    基础医学与临床
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    侯琳;纪超;张若冰;王詠;张镇
  • 通讯作者:
    张镇
MicroRNA-590-5p、microRNA-103、microRNA-34c-5p、Dicer及BRMS-1基因在肺癌中的表达研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国现代医学杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    陈莹;张若冰;杨凯云;谭慧;平妮娜;吴锡南;何越峰
  • 通讯作者:
    何越峰
砷对HOXD10基因表达的影响
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国职业医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尚莉;平妮娜;张若冰;史丽霞;罗神利;何越峰
  • 通讯作者:
    何越峰
miR-126、miR-355及Exportin-5在肺癌中表达研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    实用医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张若冰;杨凯云;谭慧;平妮娜;姚树祥;吴锡南;何越峰
  • 通讯作者:
    何越峰
大都市中心城区城市空间资源整合的初步探索——深圳“金三角”地区城市更新的系列实践
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    国际城市规划
  • 影响因子:
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  • 作者:
    吕晓蓓;朱荣远;张若冰;周素红
  • 通讯作者:
    周素红

其他文献

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张若冰的其他基金

可用于绘制融合脑图谱的光学多层干涉断层成像技术
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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