中国茜草属 (Rubia L.) 的叶绿体系统发育基因组学与分类学研究

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基本信息

  • 批准号：
    31900185
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    26.0万
  • 负责人：
    杨丽娥
  • 依托单位：
    云南师范大学
  • 学科分类：
    C0201.植物分类学
  • 结题年份：
    2022
  • 批准年份：
    2019
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Rubia L. is the type genus of the coffee family Rubiaceae and the third largest genera in the tribe Rubieae, comprising ca. 80 species restricted into the Old World. China is an important diversity center for Rubia where about half of its species (41 species) occur, 24 of which are endemic. Rubia can be used as dye and medicine, which has a great potential economic value. However, phylogenetic relationships and species delimitation within Rubia still need to be further elucidated. In this project, we attempt to adopt the multidisciplinary approach, which combines extensive field investigation and collection, specimens and literature collation with Plastid Phylogenomics study, and micro-morphological studies, to achieve a better phylogeny and infrageneric classification, to evaluate the taxonomic value of each trait, and to carry out an integrative taxonomic revision of some species of Rubia in China. Our project will be of significant importance for a revision and biogeographic study, as well as a better use of the genus.
茜草属是茜草科的模式属，全球约80种，主要分布于旧世界，我国约有41种，其中24种为中国特有。茜草属植物可作为染料和药材，具有重要的经济价值，然而最新研究显示该属还存在属内系统发育关系不明、物种划分不合理等诸多问题。本项目拟以中国茜草属植物为研究对象，通过广泛的野外考察、文献和标本查阅等工作，深入结合系统发育基因组学、宏观形态学和微形态学研究，进一步阐明茜草属内的系统发育关系，完善属下分类系统，评价各类性状的分类价值，并对国产茜草属类群进行相应的分类修订工作，为后续对茜草属的全面修订与生物地理学研究奠定基础，并为资源的合理开发利用提供依据。

结项摘要

茜草属是茜草科的模式属，全球约80种，主要分布于旧世界，我国有约41种，其中24种为中国特有。茜草属植物可作为染料和药材，具有重要的经济价值，然而最新研究显示该属还存在属内系统发育关系不明、物种划分不合理等诸多问题。本项目拟以中国茜草属植物为研究对象，通过广泛的野外考察、文献和标本查阅等工作，深入结合系统发育基因组学、形态学态学研究，进一步阐明茜草属内的系统发育关系，完善属下分类系统，评价各类性状的分类价值，并对国产茜草属类群进行相应的分类修订工作。本研究通过广泛的野外考察、材料收集，获取我国茜草属植物31个物种，67个样本材料，开展了叶绿体基因组学和形态学研究，将我国茜草属属下的分类系统进行了清晰、可靠的重建。研究结果表明我国茜草属下可划分为两个亚属、五个组，既得到分子系统学结果支持，又具有独立的形态特征。其中，两个亚属和两个组均为本研究首次提出。在我国类群最多、组成最为复杂的长柄组下，支持建立三个具有独立形态特征支持的系，其中对叶系也是本研究首次提出。至此，本研究已经建立起我国茜草属植物的分类系统框架、确定每一分类阶元的界限、确定了每一个物种的系统位置，编制了清晰分个亚属、组、系的分类检索表。研究结果可为作为我国传统中药和染料的茜草属植物的开发利用和鉴定提供有力支撑；所建立的分类系统为今后全球茜草属植物的分类学研究奠定坚实基础。

项目成果

期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Integrating morphology, molecular phylogeny and chemotaxonomy for the most effective authentication in Chinese Rubia with insights into origin and distribution of characteristic Rubiaceae-type cyclopeptides
结合形态学、分子系统学和化学分类学，对茜草进行最有效的鉴定，深入了解特征性茜草科型环肽的起源和分布
  • DOI：
    10.1016/j.indcrop.2022.115775
  • 发表时间：
    2023-01
  • 期刊：
    Industrial Crops & Products
  • 影响因子：
    5.9
  • 作者：
    Xuejia Zhang;Li-E. Yang;Yanyun Hu;Xingdong Wu;Zhe Wang;Yuanyuan Miao;Hang Sun;Zelong Nie;Ninghua Tan
  • 通讯作者：
    Ninghua Tan
The complete plastid genome of Kelloggia chinensis Franch. (Rubiaceae), an endemic species from East Asia.
Kelloggia chinensis Franch 的完整质体基因组。
  • DOI：
    10.1080/23802359.2021.2009387
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    Mitochondrial DNA. Part B, Resources
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Yang LE;Li XJ;Peng DL
  • 通讯作者：
    Peng DL

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中国茜草属sect.Oligoneura的形态计量学研究
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  • 发表时间：
    2017
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    广西植物
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    --
  • 作者：
    杨丽娥;孟盈;聂泽龙;孙航
  • 通讯作者：
    孙航
雪莲花的世界--你真的懂吗?
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  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    生命世界
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    彭德力;杨丽娥;李志敏
  • 通讯作者：
    李志敏

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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