面向阿尔茨海默病的复杂数据关联分析与融合诊断方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61806071
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0610.交叉学科中的人工智能问题
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Alzheimer's disease (AD) is a serious threat to the life and health of the elderly. The well-known Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) integrates brain imaging genomics data to provide the possibility for exploration and discovery of biomarkers associated with AD’s cause and deterioration. Due to the very finiteness of the quantity and quality of the cases’ data, along with the extraordinary difficulty of the feature heterogeneity and dimension, it is a huge challenge to build a more stable but superior model for data correlation analysis and fusion diagnosis. Therefore, (1) concerning the individual differences or outliers among case samples, we will propose a robust correlation and prediction model based on the feature selection learning to achieve the pathological mechanism analysis from genetics to brain; (2) concerning the differences between the composition types of heterogeneous data and disease correlation as well as the nonlinear relationship among diversity features, we will propose a feature presentation based on multilayer structure and complementary discriminant information fusion prediction model for disease diagnosis, accomplishing outstanding generalization performance through small samples data training; (3) concerning the high-dimensional imaging genomics data analysis on whole-brain and whole-genome, we will propose an efficient approximation computing method to enhance the scalability of the models. This project will provide solid data-driven technical support for the pathologic understanding and auxiliary diagnosis of AD, having an important clinical value.
阿尔茨海默病是严重威胁老年人生命健康的重大疾病。著名的“阿尔茨海默病神经影像计划”整合了脑影像基因组学数据,为探索和发现与其成因及恶化相关的生物标志物提供了可能。由于该疾病组学数据本身较为复杂,即病例数量和质量受限、特征异构(包括动态变化)且维度较高,导致构建更加稳定且性能优越的数据关联分析与融合诊断模型面临巨大挑战。因此,本项目将(1)针对病例样本存在个体差异或离群点的问题,提出抗噪声的鲁棒特征选择关联与预测模型,实现基因-大脑病理机制分析;(2)针对数据构成类型与疾病相关程度存在差异以及特征间存在非线性关系的问题,提出基于多层结构的特征表示和互补判别信息融合的疾病诊断预测模型,实现在小样本数据训练下达到良好的泛化性能;(3)针对全脑全基因数据特征维度较高的问题,提出快速的近似计算方法,增强模型的可扩展性。本研究将为该疾病的病理解析与辅助诊断提供可靠的数据驱动技术支持,具有重要临床价值。

结项摘要

阿尔茨海默病AD是严重威胁老年人生命健康的重大疾病。著名的“阿尔茨海默病神经影像计划”整合了脑影像基因组学数据,为探索和发现与其成因及恶化相关的生物标志物提 供了可能。由于该疾病组学数据本身较为复杂,即病例数量和质量受限、特征异构(包括动态变化)且维度较高,导致构建更加稳定且性能优越的数据关联分析与融合诊断模型面临巨大挑战。在大数据背景下,基于机器学习的智能脑影像分析技术面对的挑战包括:(1)如何综合互补的对不同模态的数据(包括神经影像数据,基因数据和生理行为数据等)进行分析多模态数据融合方法;(2)如何对高维,复杂的脑影像及基因数据进行关联分析。(3)如何进行多模态多任务学习 (4) 如何提取多模态特征针对以上挑战,本项目围绕脑疾病诊断,脑认知分析开展了一系列工作,其中主要包括多模态/多任务脑影像分析,脑网络,脑影像基因关联分析等工作。本项目研究结果表明,(1)基于融合不同模态的分析方法,在获得更好的疾病诊断精度的同时能深入探索其病理机制。(2)基因-图像关联分析方法不仅有助于提高基因与影像之间关联分析的能力,还可以发现一些与疾病密切相关的遗传风险因素。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(3)
Adaptive sparse learning using multi-template for neurodegenerative disease diagnosis
使用多模板的自适应离散学习进行神经退行性疾病诊断
  • DOI:
    10.1016/j.media.2019.101632
  • 发表时间:
    2020-04-01
  • 期刊:
    MEDICAL IMAGE ANALYSIS
  • 影响因子:
    10.9
  • 作者:
    Lei, Baiying;Zhao, Yujia;Lei, Haijun
  • 通讯作者:
    Lei, Haijun
Discovering Network Phenotype between Genetic Risk Factors and Disease Status via Diagnosis-aligned Multi-modality Regression Method in Alzheimer’s Disease
通过与阿尔茨海默病诊断相符的多模态回归方法发现遗传风险因素与疾病状态之间的网络表型
  • DOI:
    10.1093/bioinformatics/bty911
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Bioinformatics
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Wang Meiling;Hao Xiaoke;Huang Jiashuang;Shao Wei;Zhang Daoqiang
  • 通讯作者:
    Zhang Daoqiang
Identify Consistent Cross-Modality Imaging Genetic Patterns via Discriminant Sparse Canonical Correlation Analysis
通过判别稀疏典型相关分析识别一致的跨模态成像遗传模式
  • DOI:
    10.1109/tcbb.2019.2944825
  • 发表时间:
    2021-07-01
  • 期刊:
    IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Wang,Meiling;Shao,Wei;Zhang,Daoqiang
  • 通讯作者:
    Zhang,Daoqiang
Multi-modal neuroimaging feature selection with consistent metric constraint for diagnosis of Alzheimer's disease
具有一致度量约束的多模态神经影像特征选择用于诊断阿尔茨海默病
  • DOI:
    10.1016/j.media.2019.101625
  • 发表时间:
    2020-02-01
  • 期刊:
    MEDICAL IMAGE ANALYSIS
  • 影响因子:
    10.9
  • 作者:
    Hao, Xiaoke;Bao, Yongjin;Shen, Li
  • 通讯作者:
    Shen, Li

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其他文献

基于统计学习的影像遗传学方法综述
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    自动化学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郝小可;李蝉秀;严景文;沈理;张道强
  • 通讯作者:
    张道强
脑影像智能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张道强;朱旗;郝小可;邵伟;黄嘉爽;王明亮;黄硕
  • 通讯作者:
    黄硕
基于超网络的基因和脑影像关联分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    模式识别与人工智能
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李蝉秀;郝小可;张道强
  • 通讯作者:
    张道强

其他文献

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郝小可的其他基金

面向多中心的多模态数据分析及脑疾病预测模型研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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