基于二代测序的Usher综合征致病基因突变研究

结题报告

项目介绍

AI项目解读

基本信息

批准号：
81570886
项目类别：
面上项目
资助金额：
57.0万
负责人：
李杨
依托单位：
首都医科大学
学科分类：
H13.眼科学
结题年份：
2019
批准年份：
2015
项目状态：
已结题
起止时间：
2016-01-01 至2019-12-31

项目参与者：
张晓慧；李毅斌；许可；滕羽菲；谢玥；田露；
关键词：
Usher综合征突变二代测序致病基因

项目摘要

Usher syndrome (USH) is the most common syndromic- retinitis pigmentosa, representing approximately 50% of adult cases with deaf- blindness. With the genetic research progressing, gene therapy will be a potential method for patients with USH, therefore, it is very important for the patients having a rapid and accurate molecular diagnosis. USH is extremely clinical and genetic heterogeneous, it is very difficult to get a rapid and accurate molecular diagnosis for USH patients using conventional mutation analysis methods. The current study will do comprehensive mutation analysis in a large cohort of patients with USH by targeted exome sequencing or whole exome sequencing combined with some routine analysis methods such as Sanger DNA sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification. The purpose of this study is to determine the mutation spectrum, identify the new USH-causing disease gene, and define the correlations between the genotype and phenotype. The results will provide the accurate molecular diagnosis for patients with USH, which are foundations for their future gene therapy, and provide genetic consultant for their family members.

Usher综合征 (Usher syndrome, USH) 是最常见的一种综合征性视网膜色素变性, 其在盲聋患者中比例高达50%。随着分子遗传学的发展，基因治疗将成为其潜在的治疗方法，因此快速准确基因诊断对USH患者十分重要。USH具有高度临床和遗传异质性，加之其USH致病基因多样及致病突变形式复杂，传统基因突变分析方法很难对USH患者进行快速准确分子遗传学诊断。本研究将在前期工作基础上用高通量二代测序技术的目标区域外显子组测序或全外显子组测序,结合Sanger-DNA测序，探针连接多重扩增等实验技术对大样本量USH患者进行全面深入致病基因突变分析，旨在确定国人各型USH患者致病基因突变特点和基因突变谱，发现新的致病基因，建立基因型与表型间关系，为USH患者提供准确分子遗传诊断，为患者将来进行基因治疗奠定基础，为患者家系成员提供相应的临床咨询。

结项摘要

Usher综合征 (Usher syndrome, USH) 是最常见的一种综合征性视网膜色素变性（RP）, 其在盲聋患者中比例高达50%。随着分子遗传学的发展，基因治疗将成为其潜在的治疗方法，因此快速准确基因诊断对USH患者十分重要。USH具有高度临床和遗传异质性，加之其USH致病基因多样及致病突变形式复杂，传统基因突变分析方法很难对USH患者进行快速准确分子遗传学诊断。本研究在前期工作基础上用高通量二代测序技术的目标区域外显子组测序结合Sanger-DNA测序，探针连接多重扩增等实验技术对收集的150例临床诊断USH患者进行全面深入致病基因突变分析。首先我们完成了119例USH患者致病基因突变特点进行了总结分析，在这组患者中，有92 名患者检测到双突变，5名患者检测到单突变，1名患者检测到半合突变，总检出率为78.2%。在这组患者中共发现了13基因（7个USH的致病基因， 6个其他遗传性视网膜疾病的致病基因）的138种突变，其中的78种突变为新突变。7个USH致病基因为ABHD12, CDH23, GPR98, MYO7A, PCDH15, USH1C, USH2A，其中 MYO7A基因是USH1的主要致病基因，约60% USH1患者携带该基因突变；USH2A是USH2的主要致病基因，约67.7%USH2患者携带该基因突变。在USH2A基因突变中，突变 c.8559-2A>G最为常见，突变频率高达19.1%，且该突变仅在中国USH患者中检出。本项目研究结果初步建立了中国人USH致病基因的构成特点和常见致病基因的突变谱，其特点与欧美其他种族患者的特点明显不同；本结果为USH患者快速、准确的分子遗传诊断及其将来进行基因治疗奠定基础。另外对比分析了携带USH2A基因突变UHS2患者（93例）与非综合征RP患者（59例）的基因型，建立确定基因型与表型的关系，为患者提供相应的遗传咨询。