创建精准模拟人类肝脏CYPs生理行为的酵母人工肝

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872729
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2102.合成生物学与生物改造技术
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Cytochrome P450 monooxygenases (CYPs) are the major players of drug metabolisms and hormone biosynthesis in human liver. Thus, the studies on pharmacology, pharmacokinetics, and toxicology that are related to new drug development, and the production of drugs, drug precursors, and drug metabolites all require the understanding and mimics of the physiological functions of human liver CYPs. Thus, this project is proposed to design and completely synthesize the XVII artificial chromosome in Sacchromyces cerevisiae that carries all human P450 genes and the required auxiliary genes. Through regulated heterologous expression of these human genes, we aim to accurately mimic the physiological behaviors of all human liver CYPs in yeast. The so-called “Artificial Yeast Liver” would be useful for the fast evaluations of drug metabolisms, the cost-effective manufacturing of drug-related products, and efficient hormone biosynthesis.
细胞色素P450单加氧酶(CYPs)是人类肝脏中药物代谢和激素合成的主要执行者,因此新药的药理、药代和毒理研究,以及药物相关产品的生产均对人类肝脏CYPs生理功能的认识和模拟提出了客观需求。本项目拟运用合成生物手段在酿酒酵母体内设计与合成一条全新的、可自主复制、稳定遗传、携带全体人源CYPs基因及其还原伴侣/辅助蛋白编码基因的XVII号人工染色体,并通过可调控基因异源表达来精准模拟人类肝脏CYPs的生理行为,首次创建可用于药物代谢快速评价,药物、药物前体及药物代谢物低成本制备以及激素高效合成的“酵母人工肝”。

结项摘要

细胞色素P450单加氧酶(CYPs)是人类肝脏中药物代谢和激素合成的主要执行者。为了高效、精准、低成本模拟人类肝脏CYPs的生理行为,本项目成功创建了可用于药物代谢快速评价及药物代谢物低成本制备的“酵母人工肝”。项目组完成了XVII号人工染色体的设计、合成与组装,并在此基础上实现了所有人体P450基因及其还原伴侣/辅助蛋白编码基因在重组酿酒酵母细胞中的表达,进而完成了“酵母人工肝”的转录组测序分析。初步完成了“酵母人工肝”的药物代谢功能评价,通过药物饲喂转化实验,获得了降血脂药洛伐他汀、退烧药扑热息痛、抗凝药华法林、抗生素红霉素及激素睾酮的“酵母人工肝”代谢图谱,并与人类肝脏对相应药物的代谢图谱进行了比较分析。本项目获得的若干“酵母人工肝”中间菌株和最终菌株不仅可以增进人体P450酶药物代谢功能和药理/毒理/病理机制的认识,而且有望进一步开发成为药物代谢标准化合物制备的合成细胞工厂,兼具基础研究意义和应用前景。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Compartmentalized biosynthesis of fungal natural products
真菌天然产物的区室化生物合成。
  • DOI:
    10.1016/j.copbio.2020.12.006
  • 发表时间:
    2021-06-01
  • 期刊:
    CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Du, Lei;Li, Shengying
  • 通讯作者:
    Li, Shengying
Cytochrome P450 enzymes in fungal natural product biosynthesis
真菌天然产物生物合成中的细胞色素 P450 酶
  • DOI:
    10.1039/d1np00004g
  • 发表时间:
    2021-06-01
  • 期刊:
    NATURAL PRODUCT REPORTS
  • 影响因子:
    11.9
  • 作者:
    Zhang, Xingwang;Guo, Jiawei;Li, Shengying
  • 通讯作者:
    Li, Shengying
Engineering cytochrome P450 enzyme systems for biomedical and biotechnological applications
用于生物医学和生物技术应用的工程细胞色素 P450 酶系统
  • DOI:
    10.1074/jbc.rev119.008758
  • 发表时间:
    2020-01-17
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Li, Zhong;Jiang, Yuanyuan;Zhang, Wei
  • 通讯作者:
    Zhang, Wei
Development of MEMS directed evolution strategy for multiplied throughput and convergent evolution of cytochrome P450 enzymes
开发MEMS定向进化策略以实现细胞色素P450酶的倍增通量和收敛进化
  • DOI:
    10.1007/s11427-021-1994-1
  • 发表时间:
    2021-08-31
  • 期刊:
    SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES
  • 影响因子:
    9.1
  • 作者:
    Ma,Li;Li,Fengwei;Li,Shengying
  • 通讯作者:
    Li,Shengying
Fungal-derived brevianamide assembly by a stereoselective semipinacolase
通过立体选择性半频那醇酶组装真菌衍生的布雷维亚酰胺
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Nature Catalysis
  • 影响因子:
    37.8
  • 作者:
    Ye Ying;Du Lei;Zhang Xingwang;Newmister Sean A.;McCauley Morgan;Alegre-Requena Juan V;Zhang Wei;Mu Shuai;Minami Atsushi;Fraley Amy E.;Adrover-Castellano Maria L.;Carney Nolan A.;Shende Vikram V.;Qi Feifei;Oikawa Hideaki;Kato Hikaru;Tsukamoto Sachiko;Paton
  • 通讯作者:
    Paton

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  • 通讯作者:
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李盛英的其他基金

真菌活性杂萜天然产物的汇聚式与发散式生物合成
  • 批准号:
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    2022
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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