高等植物RPS2调控核糖体生物合成过程的分子机理研究

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基本信息

  • 批准号:
    31770874
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0507.核酸生物化学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Ribosomes are ribonucleoprotein (RNP) nanomachines that convert the genetic information encoded in mRNAs into proteins. As a major consumer of the cell’s resources, ribosome biogenesis plays an essential role in cells. Because ribosome biogenesis is so closely linked to the growth and proliferation of cells, dysregulation of ribosome assembly has serious consequences on the health of organisms. Complete loss-of-function mutations in most ribosomal proteins and assembly factors are lethal; while partial loss-of-function mutations of these molecules can cause diverse diseases. Ribosome biogenesis pathway in yeast is well established, while that in Arabidopsis remains unclear. Our previous result showed that pre-rRNA processing pathway in Arabidopsis is similar to that in human. In this grant proposal, we will investigate the molecular mechanism of ribosomal protein RPS2 regulating pre-rRNA processing and protein translation in Arabidopsis.
作为蛋白质合成的场所,核糖体扮演着十分重要的角色。核糖体生物合成是细胞中最复杂和最耗能的基本生命过程之一,受到严格的调控和监督。核糖体生物合成与细胞生长和增殖密切相关,该过程的异常会导致严重的后果。大多数核糖体蛋白和组装因子的完全缺失突变是致死的,而部分缺失突变则会导致多种人类遗传疾病。核糖体生物合成过程及其调控方式的研究是生物学研究的热点之一,但高等植物中相关的研究还很欠缺。我们前期的研究结果表明,相对于核糖体生物合成研究得较为清楚的单细胞酵母,拟南芥的rRNA前体加工方式与人类细胞更为相似。本项目以拟南芥为研究材料,综合运用生物化学、遗传学、大规模组学和生物信息学等手段,以核糖体蛋白RPS2为切入点,系统深入地研究RPS2参与核糖体生物合成过程的调控机制。本项目的研究成果不仅有助于阐明高等植物核糖体生物合成的过程和调控网络,同时也将为深入了解核糖体相关的多种疾病的作用机制提供新思路。

结项摘要

核糖体生物合成是细胞内最复杂、最耗能的生物学过程,该过程受到严格的监管和调控。其中核糖体RNA前体的转录和加工过程主要发生在核仁中,但植物中rRNA前体加工的具体过程和机制研究并不是很清楚。在基金委上一个面上项目的资助下,我们发现拟南芥精氨酸甲基转移酶AtPRMT3参与调控rRNA前体的加工过程,但具体的分子机制还有待于深入分析!在本项目的资助下,我们筛选到与AtPRMT3互作的核糖体小亚基蛋白RPS2,并发现rps2a2b突变体和atprmt3具有相似的生长发育和rRNA前体加工的缺陷。通过免疫沉淀实验,我们发现RPS2直接与rRNA前体结合,并能招募核糖体加工因子,包括U3 snoRNP在内的90S/SSU加工复合体等,从而参与rRNA前体加工和核糖体组装过程,揭示了AtPRMT3和RPS2调控rRNA加工和核糖体组装的分子机理和调控网络。本项目的研究成果不仅进一步阐明了高等植物核糖体生物合成的过程和调控网络,同时也为深入了解核糖体相关的多种疾病的作用机制提供了新思路。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Extensive profiling of the expressions of tRNAs and tRNA-derived fragments (tRFs) reveals the complexities of tRNA and tRF populations in plants
对 tRNA 和 tRNA 衍生片段 (tRF) 表达的广泛分析揭示了植物中 tRNA 和 tRF 群体的复杂性
  • DOI:
    10.1007/s11427-020-1891-8
  • 发表时间:
    2021-02-08
  • 期刊:
    SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES
  • 影响因子:
    9.1
  • 作者:
    Ma, Xuan;Liu, Chunyan;Cao, Xiaofeng
  • 通讯作者:
    Cao, Xiaofeng
Impact of poly(A)-tail G-content on Arabidopsis PAB binding and their role in enhancing translational efficiency
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    Genome Biology
  • 影响因子:
    12.3
  • 作者:
    Zhao Taolan;Huan Qing;Sun Jing;Liu Chunyan;Hou Xiuli;Yu Xiang;Silverman Ian M;Zhang Yi;Gregory Brian D;Liu Chun Ming;Qian Wenfeng;Cao Xiaofeng
  • 通讯作者:
    Cao Xiaofeng
Ribosomal RNA Biogenesis and Its Response to Chilling Stress in Oryza sativa
水稻核糖体 RNA 生物合成及其对低温胁迫的响应。
  • DOI:
    10.1104/pp.17.01714
  • 发表时间:
    2018-05-01
  • 期刊:
    PLANT PHYSIOLOGY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Hang, Runlai;Wang, Zhen;Cao, Xiaofeng
  • 通讯作者:
    Cao, Xiaofeng
Biogenesis, action and biological functions of an Arabidopsis 5′ tRF, 5′ tsR-Ala
拟南芥 5-tRF、5-tsR-Ala 的生物发生、作用和生物学功能
  • DOI:
    10.1007/s11427-021-2053-4
  • 发表时间:
    2022-01
  • 期刊:
    Science China Life Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu Chunyan;Cao Bo;Cao Xiaofeng
  • 通讯作者:
    Cao Xiaofeng
Protein arginine methyltransferase 3 fine-tunes the assembly/disassembly of pre-ribosomes to repress nucleolar stress by interacting with RPS2B in arabidopsis
拟南芥中蛋白质精氨酸甲基转移酶 3 通过与 RPS2B 相互作用来微调前核糖体的组装/分解以抑制核仁应激
  • DOI:
    10.1016/j.molp.2020.10.006
  • 发表时间:
    2021-02-01
  • 期刊:
    MOLECULAR PLANT
  • 影响因子:
    27.5
  • 作者:
    Hang, Runlai;Wang, Zhen;Cao, Xiaofeng
  • 通讯作者:
    Cao, Xiaofeng

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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