DPH1基因新可变剪接体DPH1-IR在鼻咽癌中致癌功能及机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81460430
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    47.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1802.肿瘤发生
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Ovarian cancer gene 1(DPH1) functions as a tumor suppressor gene in ovarian cancer. Our previous studies successfully found and cloned a new alternative splicing transcript(named DPH1-IR) of DPH1 gene in C666-1, a nasopharyngeal carcinoma (NPC) cell strain. One single intron between Exon 10 and Exon 11 of DPH1 pre-mRNA was retained in transcription and produced a novel transcript. But its functions and mechanisms in NPC are unknown.We detected that expression of DPH1-IR in mRNA level was higher in NPC cell lines and tissue speciems than in normal cantrols. On basis of these results,we hypothesized that DPH1-IR probably demonstrated functions of potential oncogene. To validate the hypothesis, we constructed plasmids of DPH1-IR and DPH1-WT and transfected them into HONE1, a nasopharyngeal cancer cell with low DPH1-IR-expressing level,which was proved by our preliminary foundings, respectively. Surprisingly, we found that DPH1-IR could express protein and increase the clone numbers in clone formation assay whereas DPH1-WT could dramatically decrease the clone numbers.Fist,we will develop a specific DPH1-IR antibody,and confirm the clinical significance of the new alternative splicing transcript by using the methods of polymerase chain reaction (PCR)and immunohistochemical staining.Next, we will overexpress and knockdown DPH1-IR in NPC cell lines, and study the abilities of invasive and the clone formation in vitro, and also study abilities of both tumorgenesis and tumor metastasis in nude mice mode. Finally,The oncogenic mechanism of DPH1-IR in NPC will also be explored. The target is to demenstrate the function and significance of the new alternative splicing transcript of DPH1 gene in the process of formation and development of NPC,and preliminarily explore its oncogenic mechanisms.
DPH1是卵巢癌抑癌基因。我们前期在人鼻咽癌细胞株C666-1中发现并克隆了DPH1基因一个新的可变剪接体(DPH1-IR),该可变剪接体在10号及11号外显子之间保留了一个内含子,但其功能及机制不清。我们发现:DPH1-IR mRNA在人鼻咽癌细胞、组织中表达上调。据此,我们提出DPH1-IR可能具有潜在致癌功能的假设。为证实该假设,我们在DPH1-IR低表达的鼻咽癌细胞HONE1中转染DPH1野生型及DPH1-IR基因,发现:DPH1-IR能表达蛋白,与野生型相反,DPH1-IR能增强细胞克隆及侵袭能力。为此,我们拟研制DPH1-IR特异性抗体,并通过PCR、免疫组化等方法进一步确认该剪接体表达的临床意义,继而探讨它对鼻咽癌细胞侵袭能力、裸鼠成瘤及转移能力等影响。在此基础上,进一步研究该剪接体的致癌机制。旨在明确DPH1新剪接体在鼻咽癌发生、发展中的作用及意义,并初步阐明其分子机制。

结项摘要

DPH1是在卵巢癌等实体瘤中表现出抑癌基因功能。作为一种“抑癌基因”,它在鼻咽癌中有无可变剪接现象?如果发生,新可变剪接体的功能及意义又是如何?这些均未见报道。.(一)首先发现DPH1具有多种可变剪接体及其理论意义.我们首先发现,DPH1存在多种可变剪接体,这些可变剪接体除了存在保留一个内含子(one-intron retained,DPH1-IR)外,还存在保留两个内含子(two-intron retained, DPH1-DIR)的现象,甚至存在基因缺失突变。具体可变剪接及缺失突变位点的示意图,详见附件图1.DPH1 在鼻咽癌中存在多种剪接模式。.在揭示了DPH1存在多种形式可变剪接体基础上,我们又成功建立了DPH1基因野生型(Wild type, DPH1-WT)、保留一个内含子、保留两个内含子这三种表达质粒,这为研究野生型基因、多种可变剪接体在细胞、分子、动物水平上的功能,进而通过siRNA沉默技术研究DPH1所保留的内含子基因序列片段敲低后基因功能变化,打下了切实的基础。最终必将为阐明DPH1及其突变体在鼻咽癌中的功能及其作用机制,揭示DPH1在鼻咽癌发生、发展中的作用规律,为鼻咽癌靶向DPH1的基因治疗提供理论依据。.(二)发现DPH1-IR在鼻咽癌中的表达、功能及其意义.对于新可变剪接体DPH1-IR基因功能,我们进行详细研究,结果如下:.(1)DPH1-IR再次验证。.通过RNA-sequencing,验证了保留一个内含子的可变剪接,EXON 10和EXON 11之间的内含子在剪接过程中被保留下来,并因其序列中恰好有终止密码子TAG而发生翻译终止。详见附件图2.DPH1 在鼻咽癌细胞株C666-1中的两种可变剪接转录本。.对于DPH1-IR功能,我们研究结果发现:DPH1-IR mRNA在人鼻咽癌细胞、组织中表达上调。据此,提出DPH1-IR可能具有致癌功能的假设。.为证实该假设,我们在DPH1-IR低表达鼻咽癌细胞HONE1中转染DPH1野生型及DPH1-IR基因,发现:DPH1-IR能表达蛋白,与野生型相反,DPH1-SIR能增强细胞克隆及侵袭能力。我们研制了DPH1-IR特异性抗体,并通过免疫组化确认该剪接体表达的临床意义,继而探讨它对鼻咽癌细胞侵袭能力、裸鼠成瘤及转移能力等影响。在此基础上,进一步研究该剪接体的的致癌机制。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
CT引导下微波凝固术治疗鼻咽癌肺转移
  • DOI:
    10.3969/j.issn.1006-5725.2017.02.o02
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    实用医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    伍红良;刘芳贤;王文华;陈瑶;浦京京;柳正春;黄辉;赵博;李思维
  • 通讯作者:
    李思维
Positive effect of HPV status on prognostic value of blood lymphocyte-to-monocyte ratio in advanced cervical carcinoma.
HPV 状态对晚期宫颈癌血液淋巴细胞与单核细胞比率的预后价值有积极影响。
  • DOI:
    10.1186/s12935-016-0334-1
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Cancer cell international
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Li SW;Yuan W;Zhao B;He ZK;Guo X;Xia WX;Xu LH
  • 通讯作者:
    Xu LH
TRIM11, a direct target of miR-24-3p, promotes cell proliferation and inhibits apoptosis in colon cancer.
TRIM11 是 miR-24-3p 的直接靶标,可促进结肠癌细胞增殖并抑制细胞凋亡
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.13550
  • 发表时间:
    2016-12-27
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yin Y;Zhong J;Li SW;Li JZ;Zhou M;Chen Y;Sang Y;Liu L
  • 通讯作者:
    Liu L
Prognostic value of phosphorylated Raf kinase inhibitory protein at serine 153 and its predictive effect on the clinical response to radiotherapy in nasopharyngeal carcinoma.
153位丝氨酸磷酸化Raf激酶抑制蛋白的预后价值及其对鼻咽癌放疗临床反应的预测作用。
  • DOI:
    10.1186/s13014-016-0696-5
  • 发表时间:
    2016-09-20
  • 期刊:
    Radiation oncology (London, England)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li S;Liu T;Mo W;Hou Q;Zhou Y;Liu M;He Z;Liu Z;Chen Q;Wang H;Guo X;Xia W;Zeng M;Zhao H
  • 通讯作者:
    Zhao H
LncRNA PANDAR regulates the G1/S transition of breast cancer cells by suppressing p16(INK4A) expression.
LncRNA PANDAR 通过抑制 p16(INK4A) 表达来调节乳腺癌细胞的 G1/S 转变。
  • DOI:
    10.1038/srep22366
  • 发表时间:
    2016-03-01
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Sang Y;Tang J;Li S;Li L;Tang X;Cheng C;Luo Y;Qian X;Deng LM;Liu L;Lv XB
  • 通讯作者:
    Lv XB

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其他文献

聚碳硅烷先驱体法制备连续SiC自由膜研究
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  • 作者:
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    张立同
国内外绿色食品研究的知识图谱分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    粮食科技与经济
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    --
  • 作者:
    石小晶;李思维;姚安阳;顾颖;于荣;张正勇
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关节软骨与软骨下骨改变在不同骨关节炎动物模型中的特点
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    冷慧杰
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  • 发表时间:
    2015
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  • 作者:
    兰琳;李思维;陈立富;丁马太
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干法重介质流化床煤炭颗粒受力特性与分选研究
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  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
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  • 作者:
    戴林;房淑海;李思维;吕冠男;柴学森;段晨龙;周恩会
  • 通讯作者:
    周恩会

其他文献

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李思维的其他基金

LncRNA PANDAR通过募集Sirt1去乙酰化Ku70促进鼻咽癌放疗抵抗的 分子机理
  • 批准号:
    81760545
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    34.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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