一种深海适冷菌分泌的新型蛋白酶deseasin MCP-01的催化机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30770040
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    陈秀兰
  • 依托单位：
    山东大学
  • 学科分类：
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份：
    2010
  • 批准年份：
    2007
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2008-01-01 至2010-12-31

项目摘要

假交替单胞菌SM9913是一株分离自深海沉积物的适冷菌。该菌株分泌的蛋白酶MCP-01 是一种新型的多结构域的subtilase，我们将其命名为deseasin（Chen et al,Microbioly-SGM,2007）。MCP-01的成熟酶除N端的催化结构域以外，C端还有一个PKD结构域。MCP-01和其它蛋白酶明显不同的结构预示着它可能具有不同的催化机制。本项目首先研究酶的底物结合部位特征和其特异性切割位点及对各位点的催化效率, 阐明其对可溶性蛋白的催化机制；然后研究酶C-端的PKD结构域和其突变体对颗粒状蛋白底物的结合能力以及MCP-01和其PKD结构域缺失突变体对可溶和不可溶蛋白的催化效率，阐明PKD结构域在酶催化过程中的功能和该酶催化降解不可溶蛋白底物的分子机制。这些研究将为开发新型蛋白酶MCP-01的新用途和揭示深海沉积物中蛋白质的分解代谢与氮循环机制提供理论依据。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（11）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Structural basis for the autoprocessing of zinc metalloproteases in the thermolysin family
嗜热菌蛋白酶家族中锌金属蛋白酶自动加工的结构基础
  • DOI：
    10.1073/pnas.1005681107
  • 发表时间：
    2010-10-12
  • 期刊：
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子：
    11.1
  • 作者：
    Gao, Xiang;Wang, Jue;Zhang, Yu-Zhong
  • 通讯作者：
    Zhang, Yu-Zhong
Mechanistic insight into the function of the C-terminal PKD domain of the collagenolytic serine protease deseasin MCP-01 from deep sea Pseudoalteromonas sp. SM9913: binding of the PKD domain to collagen results in collagen swelling but does not unwin
深入了解深海假交替单胞菌 MCP-01 胶原蛋白溶解丝氨酸蛋白酶 C 端 PKD 结构域的功能。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    J Biol Chem.
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Li, Y;He, HL;Su, HN;Chen, XL;Zhao, GY;Xie, BB;Lv, YH;Liu, H;Zhang, YZ;Zhou, BC;Hu, J;Wang, YK
  • 通讯作者：
    Wang, YK
Hydrolysis of insoluble collagen by deseasin MCP-01 from deep-sea Pseudoalteromonas sp. SM9913: Collagenolytic characters, collagen-binding ability of C-terminal polycystic kidney disease domain, and implication for its novel role in deep-sea sedimen
深海假交替单胞菌 deseasin MCP-01 水解不溶性胶原蛋白。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子：
    4.8
  • 作者：
    Zhang, Yu-Zhong;Chen, Xiu-Lan;Zhao, Hui-Lin;Xie, Bin-Bin;Zhao, Guo-Yan;Zhou, Bai-Cheng
  • 通讯作者：
    Zhou, Bai-Cheng
Ecological Function of Myroilysin, a Novel Bacterial M12 Metalloprotease with Elastinolytic Activity and a Synergistic Role in Collagen Hydrolysis, in Biodegradation of Deep-Sea High-Molecular-Weight Organic Nitrogen
髓溶解素是一种新型细菌 M12 金属蛋白酶，具有弹性蛋白溶解活性，在胶原蛋白水解中具有协同作用，在深海高分子量有机氮的生物降解中的生态功能
  • DOI：
    10.1128/aem.02285-08
  • 发表时间：
    2009-04-01
  • 期刊：
    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Chen, Xiu-Lan;Xie, Bin-Bin;Zhang, Yu-Zhong
  • 通讯作者：
    Zhang, Yu-Zhong
The complete genome of Zunongwangia profunda SM-A87 reveals its adaptation to the deep-sea environment and ecological role in sedimentary organic nitrogen degradation.
Zunongwangia profunda SM-A87的完整基因组揭示了其对深海环境的适应及其在沉积物有机氮降解中的生态作用
  • DOI：
    10.1186/1471-2164-11-247
  • 发表时间：
    2010-04-17
  • 期刊：
    BMC genomics
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Qin QL;Zhang XY;Wang XM;Liu GM;Chen XL;Xie BB;Dang HY;Zhou BC;Yu J;Zhang YZ
  • 通讯作者：
    Zhang YZ

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其他文献

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  • 通讯作者：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    文华轩

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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