基于内收缩技术的后价键自洽场方法

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21273176
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    78.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

The proposal of this project is to develop new ab initio post-VBSCF methods and program. The method development includes second quantization for classical valence bond theory; efficient optimization method with core-valence separation, and post-VBSCF methods with internal contraction. Based on the developed methods and algorithms, new version XMVB program will be presented. Then related applications, including chemical bondings and chemical reactions, will be performed. By applying the techniques which are used in molecular orbital methods, the computational efficiency and accuracy of valence bond methods will be improved greatly, leading to a practical tool for quantitative calculations.
本项目将开展从头计算水平的后价键自洽场计算新方法研究和程序研发,包括基于非正交轨道的价键理论二次量子化方法,基于价-芯分离的高效的价键理论优化方法和基于内收缩技术的后价键自洽场方法。项目将利用发展的新方法研发全新版本的厦门价键(XMVB)计算程序,并以此为基础开展相关的价键理论应用研究。项目拟开展的方法研究成果将进一步发展从头算水平的经典价键理论。通过大量借助分子轨道理论计算方法的技术,本项目将提高价键理论计算方法的效率,在计算速度和计算精度上使价键理论的计算方法进一步接近于相应的分子轨道理论方法,使价键理论计算方法成为分子轨道理论的补充,不仅在定性研究上,而且在定量研究中成为高精度的量子化学计算的工具。

结项摘要

本项目自2013年实施以来,根据研究计划开展从头计算水平的后价键自洽场计算新方法研究和程序研发,提出了基于张量分析的非正交轨道约化密度矩阵方法,发展了基于非正交轨道的价键理论二次量子化方法,提出了基于内收缩技术的后自洽场方法价键二级微扰方法VBPT2,基于解析梯度的高效价键理论优化方法和基于精确Hessian的高效稳定价键理论优化方法,基于seniority数的价键方法,完全活性空间价键方法VBSCF(CAS)),引入了Cholesky分解技术。开展的方法研究成果将进一步发展从头算水平的经典价键理论,颁布了新版本的XMVB程序。发表了22篇学术论文。

项目成果

期刊论文数量(37)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Selective Chlorination of Substrates by the Halogenase SyrB2 Is Controlled by the Protein According to a Combined Quantum Mechanics/Molecular Mechanics and Molecular Dynamics Study
根据量子力学/分子力学和分子动力学的联合研究,卤素酶 SyrB2 对底物的选择性氯化是由蛋白质控制的
  • DOI:
    10.1021/acscatal.5b02825
  • 发表时间:
    2016-04-01
  • 期刊:
    ACS CATALYSIS
  • 影响因子:
    12.9
  • 作者:
    Huang, Jing;Li, Chunsen;Shaik, Sason
  • 通讯作者:
    Shaik, Sason
The application of cholesky decomposition in valence bond calculation
胆囊基分解在价键计算中的应用
  • DOI:
    10.1002/jcc.24442
  • 发表时间:
    2016-07
  • 期刊:
    Journal of Computational Chemistry
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Gong Xiping;Chen Zhenhua;Wu Wei
  • 通讯作者:
    Wu Wei
XMVB 2.0: A New Version of Xiamen Valence Bond Program
XMVB 2.0:新版厦门价债计划
  • DOI:
    10.1002/qua.24855
  • 发表时间:
    2015-06-05
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Chen, Zhenhua;Ying, Fuming;Wu, Wei
  • 通讯作者:
    Wu, Wei
Red-Shifting versus Blue-Shifting Hydrogen Bonds: Perspective from Ab lnitio Valence Bond Theory
红移与蓝移氢键:从 Ab Intiio 价键理论的角度
  • DOI:
    10.1021/acs.jpca.6b02245
  • 发表时间:
    2016-05-05
  • 期刊:
    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Chang, Xin;Zhang, Yang;Mo, Yirong
  • 通讯作者:
    Mo, Yirong
Seniority Number in Valence Bond Theory
价键理论中的资历数
  • DOI:
    10.1021/acs.jctc.5b00416
  • 发表时间:
    2015-09-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Chen, Zhenhua;Zhou, Chen;Wu, Wei
  • 通讯作者:
    Wu, Wei

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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