布氏锥虫中识别甲基化、乙酰化组蛋白的蛋白结构域的结构和功能研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:U1332137
- 项目类别:联合基金项目
- 资助金额:70.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:A3205.稳态强磁场
- 结题年份:2016
- 批准年份:2013
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2014-01-01 至2016-12-31
- 项目参与者:孙红宾; 廖善晖; 戴昆; 叶开琴; 王瑞; 吴学雷; 梅松; 杨晓; 张笑乐;
- 关键词:
项目摘要
Recent studies reveal the essential roles of epigenetic regulation in cellular processes. In higher organisms, systematic epigenetic researches have elucidated the mechanism of histone modification, DNA methylation and non-coding RNA-induced silencing in many aspects of cellular processes, such as transcriptional regulation and gene silencing. Trypanosoma brucei (T. brucei) is the lethal parasite responsible for sleeping sickness in human and nagana in cattle. As a model organism, it has been recognized to have great value for scientific research. However, epigenetic studies on T. brucei are still at the beginning. Our study will focus on the structure and function of protein domains (including bromo, chromo and pwwp domains), which recognize acetylated or methylated histones in T. brucei. We will investigate the NMR solution structure of these domains, their recognition of modified histones and cellular functions. This study will strengthen our understanding on epigenetic regulation in eukaryotes. Meanwhile, we are trying to screen small molecular inhibitors for trypanosomiasis therapy, based on the structural studies of these protein domains.
近年来的研究显示,表观遗传学调控在细胞进程的各个方面都起到了至关重要的作用。系统的表观遗传学研究已经部分揭示了高等真核生物中组蛋白修饰、DNA甲基化、非编码RNA诱导沉默在细胞的转录调控,基因沉默等方面的机制。布氏锥虫是导致人的昏睡病和家畜的那加那病的致死性寄生生物。它作为一种模式生物已被证明具有重要的科学研究价值。然而在布氏锥虫中,表观遗传学研究仍然处于起始阶段。本项目将围绕布氏锥虫中识别乙酰化、甲基化组蛋白修饰的蛋白结构域(包括bromo, chromo和pwwp结构域)的结构和功能开展相关的研究。研究布氏锥虫中这些结构域的NMR溶液空间结构,识别组蛋白修饰的分子作用机制及其在细胞中的生物学功能。这些研究将使我们能更为深入地了解真核生物中的表观遗传学调控。同时,我们将以蛋白质结构为基础,筛选相关的小分子抑制剂用于开发药物治疗锥虫感染并发症。
结项摘要
近年来的研究显示,表观遗传学调控在细胞进程的各个方面都起到了至关重要的作用。系统的表观遗传学研究已经部分揭示了高等真核生物中组蛋白修饰、DNA甲基化、非编码RNA诱导沉默在细胞的转录调控,基因沉默等方面的机制。布氏锥虫是导致人的昏睡病和家畜的那加那病的致死性寄生生物。它作为一种模式生物已被证明具有重要的科学研究价值。然而在布氏锥虫中,表观遗传学研究仍然处于起始阶段。本项目围绕布氏锥虫中识别乙酰化、甲基化组蛋白修饰的蛋白结构域(包括pwwp,bromo和chromo结构域)的结构和功能开展相关的研究。研究布氏锥虫中这些结构域的NMR溶液空间结构,识别组蛋白修饰的分子作用机制及其在细胞中的生物学功能。同时,我们将以蛋白质结构为基础,筛选相关的小分子抑制剂用于开发药物治疗锥虫感染并发症。我们解析了布氏锥虫转录因子TbTFIIS2-1和TbTFIIS2-2的PWWP结构域的NMR溶液空间结构,鉴定了PWWP结构域结合的组蛋白赖氨酸甲基化小肽。我们发现TbTFIISs可以与PAF1复合物相互作用,协同调控VSG基因的转录。我们还完成了锥体虫BDF2和BDF5的bromo结构域的NMR溶液结构解析,鉴定了bromo结构域结合的组蛋白乙酰化小肽。利用体内内源表达,串联亲和纯化和质谱技术我们找到了与BDF5相互作用的若干蛋白,研究了这些蛋白之间的相互作用网络及其在细胞中的功能。这些研究将使我们能更为深入地了解真核生物中的表观遗传学调控。此外,我们还筛选出了两个与bromo结构域具有较高亲和力的特异性结合的小分子化合物。
项目成果
期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Solution structure of Q388A3 PDZ domain from Trypanosoma brucei
布氏锥虫 Q388A3 PDZ 结构域的溶液结构
- DOI:--
- 发表时间:2016
- 期刊:Journal of Structural Biology
- 影响因子:3
- 作者:涂晓明;涂晓明
- 通讯作者:涂晓明
Induced folding under membrane mimetic and acidic conditions implies undiscovered biological roles of prokaryotic ubiquitin-like protein Pup
在膜模拟和酸性条件下诱导折叠意味着原核泛素样蛋白 Pup 尚未发现的生物学作用
- DOI:--
- 发表时间:2016
- 期刊:Protein and Peptide Letters
- 影响因子:1.6
- 作者:涂晓明;涂晓明
- 通讯作者:涂晓明
Solution structure of leptospiral LigA4 Big domain
钩端螺旋体LigA4大域的溶液结构
- DOI:--
- 发表时间:2015
- 期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
- 影响因子:3.1
- 作者:Song Mei;Jiahai Zhang;Xuecheng Zhang;Xiaoming Tu
- 通讯作者:Xiaoming Tu
Solution structure of TbTFIIS2-1 PWWP domain from Trypanosoma brucei.
布氏锥虫 TbTFIIS2-1 PWWP 结构域的溶液结构。
- DOI:10.1002/prot.25035
- 发表时间:2016
- 期刊:Proteins: Structure, Function, and Genetics
- 影响因子:--
- 作者:Wang Rui;Zhang Jiahai;Liao Shanhui;Tu Xiaoming
- 通讯作者:Tu Xiaoming
Solution structure of a bacterial immunoglobulin-like domain of the outer membrane protein (LigB) from Leptospira
钩端螺旋体外膜蛋白 (LigB) 的细菌免疫球蛋白样结构域的溶液结构
- DOI:10.1002/prot.24723
- 发表时间:2015-01-01
- 期刊:PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
- 影响因子:2.9
- 作者:Mei, Song;Zhang, Jiahai;Tu, Xiaoming
- 通讯作者:Tu, Xiaoming
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酿酒酵母 Rap1 BRCT 结构域的溶液结构揭示了一种新的折叠
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- 发表时间:--
- 期刊:Biochem Biophys Res Commun.
- 影响因子:--
- 作者:涂晓明
- 通讯作者:涂晓明
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- 期刊:Scientific Reports
- 影响因子:4.6
- 作者:涂晓明
- 通讯作者:涂晓明
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- DOI:10.1007/s12104-008-9084-x
- 发表时间:2008-03
- 期刊:Biomolecular NMR Assignments
- 影响因子:0.9
- 作者:涂晓明
- 通讯作者:涂晓明
其他文献
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