布氏锥虫中识别甲基化、乙酰化组蛋白的蛋白结构域的结构和功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    U1332137
  • 项目类别:
    联合基金项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A3205.稳态强磁场
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Recent studies reveal the essential roles of epigenetic regulation in cellular processes. In higher organisms, systematic epigenetic researches have elucidated the mechanism of histone modification, DNA methylation and non-coding RNA-induced silencing in many aspects of cellular processes, such as transcriptional regulation and gene silencing. Trypanosoma brucei (T. brucei) is the lethal parasite responsible for sleeping sickness in human and nagana in cattle. As a model organism, it has been recognized to have great value for scientific research. However, epigenetic studies on T. brucei are still at the beginning. Our study will focus on the structure and function of protein domains (including bromo, chromo and pwwp domains), which recognize acetylated or methylated histones in T. brucei. We will investigate the NMR solution structure of these domains, their recognition of modified histones and cellular functions. This study will strengthen our understanding on epigenetic regulation in eukaryotes. Meanwhile, we are trying to screen small molecular inhibitors for trypanosomiasis therapy, based on the structural studies of these protein domains.
近年来的研究显示,表观遗传学调控在细胞进程的各个方面都起到了至关重要的作用。系统的表观遗传学研究已经部分揭示了高等真核生物中组蛋白修饰、DNA甲基化、非编码RNA诱导沉默在细胞的转录调控,基因沉默等方面的机制。布氏锥虫是导致人的昏睡病和家畜的那加那病的致死性寄生生物。它作为一种模式生物已被证明具有重要的科学研究价值。然而在布氏锥虫中,表观遗传学研究仍然处于起始阶段。本项目将围绕布氏锥虫中识别乙酰化、甲基化组蛋白修饰的蛋白结构域(包括bromo, chromo和pwwp结构域)的结构和功能开展相关的研究。研究布氏锥虫中这些结构域的NMR溶液空间结构,识别组蛋白修饰的分子作用机制及其在细胞中的生物学功能。这些研究将使我们能更为深入地了解真核生物中的表观遗传学调控。同时,我们将以蛋白质结构为基础,筛选相关的小分子抑制剂用于开发药物治疗锥虫感染并发症。

结项摘要

近年来的研究显示,表观遗传学调控在细胞进程的各个方面都起到了至关重要的作用。系统的表观遗传学研究已经部分揭示了高等真核生物中组蛋白修饰、DNA甲基化、非编码RNA诱导沉默在细胞的转录调控,基因沉默等方面的机制。布氏锥虫是导致人的昏睡病和家畜的那加那病的致死性寄生生物。它作为一种模式生物已被证明具有重要的科学研究价值。然而在布氏锥虫中,表观遗传学研究仍然处于起始阶段。本项目围绕布氏锥虫中识别乙酰化、甲基化组蛋白修饰的蛋白结构域(包括pwwp,bromo和chromo结构域)的结构和功能开展相关的研究。研究布氏锥虫中这些结构域的NMR溶液空间结构,识别组蛋白修饰的分子作用机制及其在细胞中的生物学功能。同时,我们将以蛋白质结构为基础,筛选相关的小分子抑制剂用于开发药物治疗锥虫感染并发症。我们解析了布氏锥虫转录因子TbTFIIS2-1和TbTFIIS2-2的PWWP结构域的NMR溶液空间结构,鉴定了PWWP结构域结合的组蛋白赖氨酸甲基化小肽。我们发现TbTFIISs可以与PAF1复合物相互作用,协同调控VSG基因的转录。我们还完成了锥体虫BDF2和BDF5的bromo结构域的NMR溶液结构解析,鉴定了bromo结构域结合的组蛋白乙酰化小肽。利用体内内源表达,串联亲和纯化和质谱技术我们找到了与BDF5相互作用的若干蛋白,研究了这些蛋白之间的相互作用网络及其在细胞中的功能。这些研究将使我们能更为深入地了解真核生物中的表观遗传学调控。此外,我们还筛选出了两个与bromo结构域具有较高亲和力的特异性结合的小分子化合物。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Solution structure of Q388A3 PDZ domain from Trypanosoma brucei
布氏锥虫 Q388A3 PDZ 结构域的溶液结构
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Structural Biology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    涂晓明;涂晓明
  • 通讯作者:
    涂晓明
Induced folding under membrane mimetic and acidic conditions implies undiscovered biological roles of prokaryotic ubiquitin-like protein Pup
在膜模拟和酸性条件下诱导折叠意味着原核泛素样蛋白 Pup 尚未发现的生物学作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Protein and Peptide Letters
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    涂晓明;涂晓明
  • 通讯作者:
    涂晓明
Solution structure of leptospiral LigA4 Big domain
钩端螺旋体LigA4大域的溶液结构
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Biochemical and Biophysical Research Communications
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Song Mei;Jiahai Zhang;Xuecheng Zhang;Xiaoming Tu
  • 通讯作者:
    Xiaoming Tu
Solution structure of TbTFIIS2-1 PWWP domain from Trypanosoma brucei.
布氏锥虫 TbTFIIS2-1 PWWP 结构域的溶液结构。
  • DOI:
    10.1002/prot.25035
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Proteins: Structure, Function, and Genetics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang Rui;Zhang Jiahai;Liao Shanhui;Tu Xiaoming
  • 通讯作者:
    Tu Xiaoming
Solution structure of a bacterial immunoglobulin-like domain of the outer membrane protein (LigB) from Leptospira
钩端螺旋体外膜蛋白 (LigB) 的细菌免疫球蛋白样结构域的溶液结构
  • DOI:
    10.1002/prot.24723
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Mei, Song;Zhang, Jiahai;Tu, Xiaoming
  • 通讯作者:
    Tu, Xiaoming

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其他文献

Solution structure of Rap1 BRCT domain from Saccharomyces cerevisiae reveals a novel fold
酿酒酵母 Rap1 BRCT 结构域的溶液结构揭示了一种新的折叠
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Biochem Biophys Res Commun.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    涂晓明
  • 通讯作者:
    涂晓明
Solution structure of the Big domain from Streptococcus pneumoniae reveals a novel Ca2+-binding module.
肺炎链球菌 Big 结构域的溶液结构揭示了一种新型 Ca2 结合模块。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Scientific Reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    涂晓明
  • 通讯作者:
    涂晓明
1H, 13C and 15N resonance assignment of Urm1 from Trypanosoma brucei
布氏锥虫 Urm1 的 1H、13C 和 15N 共振分配
  • DOI:
    10.1007/s12104-008-9084-x
  • 发表时间:
    2008-03
  • 期刊:
    Biomolecular NMR Assignments
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    涂晓明
  • 通讯作者:
    涂晓明

其他文献

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涂晓明的其他基金

布氏锥虫中动点蛋白和动点蛋白复合物的结构和功能研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    58 万元
  • 项目类别:
    面上项目
类泛素家族蛋白NEDD8,SUMO,Pup和SAMPs的结构和功能研究
  • 批准号:
    31270780
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    90.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
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  • 批准号:
    30770443
  • 批准年份:
    2007
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    30.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
锥体虫动点相关蛋白Mad2,Skp1,TOG和中心体相关蛋白Spc97,Spc98在有丝分裂中的功能研究
  • 批准号:
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    2006
  • 资助金额:
    26.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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