不同LET射线辐照后肿瘤干细胞的DNA双链断裂动态修复规律及其全基因组5hmC调控机理

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11875079
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    66.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A3010.核技术在其他领域中的应用
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Radiation therapy is an important application of nuclear technology in medicine. About 70% of cancer patients in China receive radiotherapy. The essence of tumor recurrence and metastasis after radiotherapy is the existence of the radiation-resistant tumor cells and their subsequent proliferation. Since only cancer stem-like cells (CSCs) in tumor have the ability of tumor initiating, it is of fundamental importance to study the mechanism of radiation resistance of CSCs. Based on our researches in past decade, this project intends to study the DNA repair dynamics under different LET irradiation in both CSCs and its counterpart non-stem cancer cells (NSCCs). It was supposed to describe the dynamics with the production, volume, fluorescence intensity and migration of each 53BP1 focus after γ, α, proton and carbon ion irradiation. Quantitatively elucidating the DSB repair dynamics may have profound impact on optimizing the dose deliver strategy in clinic radiotherapy. Furthermore, compared with NSCCs, we suppose to shed light on the up-regulated and down-regulated genes specifically expressed in irradiated and unirradiated CSCs, via 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) genome-wide sequencing and bioinformatics analysis. The specific gene expression profiling of CSCs may not only help us to understand the intrinsic radiation-resistant mechanism of CSCs, but also provide potential new targets of tumor radio-resistance.
放疗是核技术在医学中的重要应用,在我国约有70%的肿瘤患者接受放疗。放疗后肿瘤复发转移的本质是耐辐射肿瘤细胞的辐射抗性及其随后的增殖。由于肿瘤中只有肿瘤干细胞才有单独在体内形成肿瘤的能力,因此研究肿瘤干细胞的耐辐射机理,具有重要的科学意义和实践价值。本项目拟在多年的研究基础上,基于同一单克隆来源、内源稳定表达DNA双链断裂(DSB)荧光标记的肿瘤干细胞和肿瘤细胞,通过在线、离线辐照和活细胞原位三维成像,研究肿瘤干细胞在受γ、α、质子和碳离子辐照后DSB随时序的动态修复过程,定量阐明DSB修复的动态规律,为优化不同LET放疗剂量分割策略提供新的参考;基于5hmC全基因组测序,通过生物信息学分析,获得细胞受不同LET辐照前后5hmC的分布特征及其上调和下调的基因信息,探索肿瘤干细胞固有的耐辐射分子机理和应激响应的调控机理,为克服肿瘤干细胞的辐射抗性提供新的靶点参考。

结项摘要

项目背景:.放疗是核技术在医学中的重要应用,在我国约有70%的肿瘤患者接受放疗。放疗后肿瘤复发转移的本质是耐辐射肿瘤细胞的辐射抗性及其随后的增殖。由于肿瘤中只有肿瘤干细胞才有单独在体内形成肿瘤的能力,因此研究肿瘤干细胞的耐辐射机理,具有重要的科学意义和实践价值。..主要研究内容:.本项目在多年的研究基础上,基于同一单克隆来源、内源稳定表达DNA双链断裂(DSB)荧光标记的肿瘤干细胞和肿瘤细胞,通过在线、离线辐照和活细胞原位三维成像,研究了肿瘤干细胞在受γ、α和质子辐照后DSB随时序的动态修复过程,定量阐明DSB修复的动态规律,为优化不同LET放疗剂量分割策略提供新的参考;基于生物信息学分析,探讨了肿瘤干细胞和肿瘤细胞5hmC的不同特征;开发了不依赖于测序的5hmC DNA的高灵敏度电化学生物传感检测体系;进一步在全球首次完成了10^9 Gy/s超高剂量率FLASH辐照乏氧/常氧条件下正常细胞、癌细胞和癌干细胞杀伤效应的前期基础研究...重要结果:.1).搭建和改进了在线低LET的γ射线辐照系统和在线高LET的α粒子辐照系统。.2).肿瘤干细胞和肿瘤细胞受低LET γ射线辐照前后,53BP1焦点的产生及其体积、荧光强度和迁移随时序的动态变化规律。.3).肿瘤干细胞和肿瘤细胞受高LET质子射线辐照前后,53BP1焦点的产生及其体积、荧光强度和迁移随时序的动态变化规律。.4).基于DNA损伤规律,构建了靶向α核素肿瘤治疗药物体外筛选模型;.5).开发了不依赖于测序的5hmC DNA的高灵敏度电化学生物传感检测体系;.6).对比了肿瘤干细胞和肿瘤细胞特有的5hmC全基因组分布特征及其上调和下调的基因信息。.7).对比了肿瘤干细胞和肿瘤细胞应激辐射响应的5hmC全基因组分布特征及其上调和下调的基因信息。.8).研究了肿瘤干细胞和肿瘤细胞在高LET质子Flash辐照下的不同死亡方式及其可能的生物学机理;

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Association of Cancer Stem Cell Radio-Resistance Under Ultra-High Dose Rate FLASH Irradiation With Lysosome-Mediated Autophagy.
超高剂量率闪光照射下癌症干细胞的放射抗性与溶酶体介导的自噬的关联
  • DOI:
    10.3389/fcell.2021.672693
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in cell and developmental biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Yang G;Lu C;Mei Z;Sun X;Han J;Qian J;Liang Y;Pan Z;Kong D;Xu S;Liu Z;Gao Y;Qi G;Shou Y;Chen S;Cao Z;Zhao Y;Lin C;Zhao Y;Geng Y;Ma W;Yan X
  • 通讯作者:
    Yan X
Ultra-High Dose Rate FLASH Irradiation Induced Radio-Resistance of Normal Fibroblast Cells Can Be Enhanced by Hypoxia and Mitochondrial Dysfunction Resulting From Loss of Cytochrome C.
细胞色素 C 丢失导致的缺氧和线粒体功能障碍可增强超高剂量率 FLASH 照射诱导的正常成纤维细胞的放射抗性
  • DOI:
    10.3389/fcell.2021.672929
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in cell and developmental biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Han J;Mei Z;Lu C;Qian J;Liang Y;Sun X;Pan Z;Kong D;Xu S;Liu Z;Gao Y;Qi G;Shou Y;Chen S;Cao Z;Zhao Y;Lin C;Zhao Y;Geng Y;Chen J;Yan X;Ma W;Yang G
  • 通讯作者:
    Yang G
Cancer stem-like cells with hybrid epithelial/mesenchymal phenotype leading the collective invasion
具有混合上皮/间质表型的癌症干细胞样细胞引领集体侵袭
  • DOI:
    10.1111/cas.14285
  • 发表时间:
    2020-01-17
  • 期刊:
    CANCER SCIENCE
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Quan, Qianghua;Wang, Xudong;Yang, Gen
  • 通讯作者:
    Yang, Gen
A Theoretical Model for Predicting and Optimizing In Vitro Screening of Potential Targeted Alpha-Particle Therapy Drugs
预测和优化潜在靶向α粒子治疗药物体外筛选的理论模型
  • DOI:
    10.1667/rr15297.1
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Radiation Research
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Wenzong Ma;Xudong Wang;Weihao Liu;Huan Ma;Yue Su;Yuanyou Yang;Ning Liu;Yugang Wang;Gen Yang
  • 通讯作者:
    Gen Yang
Fast, Reusable, Cell Uniformly Distributed Membrane Filtration Device for Separation of Circulating Tumor Cells.
用于分离循环肿瘤细胞的快速、可重复使用、细胞均匀分布的膜过滤装置
  • DOI:
    10.1021/acsomega.2c01153
  • 发表时间:
    2022-06-21
  • 期刊:
    ACS OMEGA
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Han, Jintao;Lu, Chunyang;Shen, Mengzhu;Sun, Xiaoyi;Mo, Xiaodong;Yang, Gen
  • 通讯作者:
    Yang, Gen

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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