在自身免疫性疾病易感位点内识别鉴定Graves病新的致病易感基因

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81370888
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    120.0万
  • 负责人：
    宋怀东
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    H0703.甲状腺、甲状旁腺及相关疾病
  • 结题年份：
    2017
  • 批准年份：
    2013
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

In previous studies, we identified eight new susceptibility loci to Graves' disease (GD) and confirmed five previously reported loci by genome-wide association study and candidate gene strategy. Among these 13 susceptibility loci of Graves' disease (GD), 8 loci were shared with at least one of the other autoimmune diseases. These findings inferred that some of the susceptibility loci to other autoimmune diseases which were identified in recently GWAS studies, were possibly associated with GD. Among 5,515 SNPs that were associated with at least one of autoimmune diseases in previous reports, 79 SNPs, which located in 30 distinct chromosome regions, showed P < 0.05 in our GWAS data and were selected for further genotyping in 10,000 patients with GD and 10,000 controls, in order to identify novel susceptibility genes of GD. The relationship between GD and other autoimmune diseases were investigated based on analyzing how many susceptibility loci were shared.
我们前期采用全基因组关联分析研究（GWAS）和候选基因策略识别了8个新的Graves病(GD)致病易感基因，并验证了以前报道的5个GD易感位点，其中有8个致病易感位点是和其它不同的自身免疫性疾病共享的。在这些发现的提示下，我们设想在目前报道的其它自身免疫性疾病的致病易感位点中，可能有部分位点也和GD的发生相关。因此，本项目将在目前报道的5,515个与至少一种其它自身免疫性疾病发生相关的SNP位点中，通过在我们已经完成的1,536例GD病人和1,516例对照个体的GWAS研究数据库中分析，挑选可能和GD发生密切相关的位于30个不同染色体区段内的79个SNP位点（P < 0.05），进一步在我们收集的10,000例GD病人和相应的对照人群中，分阶段进行验证，以识别和鉴定新的GD致病易感基因。并通过对不同自身免疫性疾病之间共享致病易感基因程度的分析，探讨他们之间的关系。

结项摘要

我们前期采用全基因组关联分析研究（GWAS）和候选基因策略识别了8 个新的Graves 病(GD)致病易感基因，并验证了以前报道的5 个GD 易感位点，其中有8 个致病易感位点是和其它不同的自身免疫性疾病共享的。在这些发现的提示下，本项目希望在目前报道的其它自身免疫性疾病的致病易感位点中，识别鉴定GD 的致病易感基因。在课题组的共同努力下，本项目取得以下一些重要进展：1. 在自身免疫性疾病的致病易感位点中识别或验证了7个甲亢（Graves’病，GD）的致病易感位点，其中4个是我们课题组在国际上首次识别鉴定的。2. 我们在环境和遗传的相互作用的研究方面取得了重大进展。发现感染这种环境因素可能通过和X染色体上的SNP位点rs3827440相互作用，进而影响区段内甲亢的易感基因ITM2A的表达水平，来触发甲亢的发生。3. 利用我们GWAS研究的数据，发现了一个新的并验证了一个以前报道的影响正常人群外周血中TSH浓度的易感位点，有意义的是，我们发现，这两个影响TSH浓度的SNP位点，其使血中TSH浓度降低的等位基因型，均促进了甲状腺癌的发生，这表明外周血低水平的TSH浓度，是甲状腺癌发生的危险因素。4. 发现了一个脂肪组织高表达的可以抑制食欲的新激素Mimecan。且它抑制食欲的分子途径与leptin不同，可能是体内两条不同的外周抑制食欲的信号分子，因此二者的联合应用，可能导致肥胖治疗策略的改变。. 在该项目的部分基金资助下，本项目已发表高水平SCI收录论文7篇。获得授权发明专利1项，培养硕士研究生2名、博士研究生2名。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（1）
Genome-wide association study identifies a novel susceptibility gene for serum TSH levels in Chinese populations
全基因组关联研究确定了中国人群血清 TSH 水平的新易感基因
  • DOI：
    10.1093/hmg/ddu250
  • 发表时间：
    2014-10-15
  • 期刊：
    HUMAN MOLECULAR GENETICS
  • 影响因子：
    3.5
  • 作者：
    Zhan, Ming;Chen, Gang;Song, Huai-Dong
  • 通讯作者：
    Song, Huai-Dong
Mimecan, a Hormone Abundantly Expressed in Adipose Tissue, Reduced Food Intake Independently of Leptin Signaling.
Mimecan 是一种在脂肪组织中大量表达的激素，可独立于瘦素信号减少食物摄入量
  • DOI：
    10.1016/j.ebiom.2015.09.044
  • 发表时间：
    2015-11
  • 期刊：
    EBioMedicine
  • 影响因子：
    11.1
  • 作者：
    Cao HM;Ye XP;Ma JH;Jiang H;Li SX;Li RY;Li XS;Guo CC;Wang ZQ;Zhan M;Zuo CL;Pan CM;Zhao SX;Zheng CX;Song HD
  • 通讯作者：
    Song HD
Identification of BACH2 as a susceptibility gene for Graves' disease in the Chinese Han population based on a three-stage genome-wide association study
基于三阶段全基因组关联研究鉴定BACH2为中国汉族人群格雷夫斯病易感基因
  • DOI：
    10.1007/s00439-013-1404-2
  • 发表时间：
    2014-05-01
  • 期刊：
    HUMAN GENETICS
  • 影响因子：
    5.3
  • 作者：
    Liu, Wei;Wang, Hai-Ning;Song, Huai-Dong
  • 通讯作者：
    Song, Huai-Dong
Genetic heterogeneity of susceptibility gene in different ethnic populations: refining association study of PTPN22 for Graves' disease in a Chinese Han population.
不同民族人群易感基因遗传异质性：PTPN22与中国汉族格雷夫斯病的关联细化研究
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0084514
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Xue L;Pan C;Gu Z;Zhao S;Han B;Liu W;Yang S;Yu S;Sun Y;Liang J;Gao G;Zhang X;Yuan G;Li C;Du W;Chen G;Chen J;Song H
  • 通讯作者：
    Song H
Genetic study of early-onset Graves' disease in the Chinese Han population
中国汉族人群早发格雷夫斯病的遗传学研究
  • DOI：
    10.1111/cge.13072
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    Clinical Genetics
  • 影响因子：
    3.5
  • 作者：
    Yuan F. -F.;Ye X. -P.;Liu W.;Xue L. -Q.;Ma Y. -R.;Zhang L. -L.;Zhang M. -M.;Sun F.;Wan Y. -Y.;Zhang Q. -Y.;Zhao S. -X.;Song H. -D.
  • 通讯作者：
    Song H. -D.

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其他文献

Li RY, Li XS, Shao L, Wu ZY, Du WH, Li SX, Zhao SX, Chen KM, Chen MD, Song HD. Influence of visceral adiposity on ghrelin secretion and expression in rats during fasting.
李RY，李XS，邵L，吴ZY，杜WH，李SX，赵SX，陈KM，陈MD，宋HD。
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    J Mol Endocrinol.
  • 影响因子：
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  • 作者：
    宋怀东
  • 通讯作者：
    宋怀东
Li RY, Zhang QH, Liu Z, Qiao J, Zhao SX, Shao L, Xiao HS, Chen JL, Chen MD, Song HD . Effect of short-term and long-term fasting on transcriptional regulation of metabolic genes in rat tissues
李瑞瑞，张庆华，刘Z，乔J，赵SX，邵L，肖HS，陈JL，陈MD，宋HD。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Biochem Biophys Res Commun.
  • 影响因子：
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  • 作者：
    宋怀东
  • 通讯作者：
    宋怀东
Xu C, Zhang L, Chen N, Su B, Pan CM, Li JY, Zhang GW, Liu Z, Sheng Y, Song HD. A new locus for hereditary hypotrichosis simplex maps to chromosome 13q12.12 approximately 12.3 in a Chinese family.
徐 C，张 L，陈 N，苏 B，潘 CM，李 JY，张 GW，刘 Z，盛 Y，宋 HD。
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
    J Cutan Pathol
  • 影响因子：
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  • 作者：
    宋怀东
  • 通讯作者：
    宋怀东
Ma QY, Zuo CL, Ma JH, Zhang XN, Ru Y, Li P, Pan CM, Liu Z, Cao HM, Chen MD, Song HD. Glucocorticoid up-regulates mimecan expression in corticotroph cells. Mol Cell Endocrinol. 2010 Jun 10;321(2):239-44. Epub 2010 Feb 21.
马QY，左CL，马JH，张XN，Ru Y，李P，潘CM，刘Z，曹HM，陈MD，宋HD。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Mol Cell Endocrinol
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    宋怀东
  • 通讯作者：
    宋怀东
杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因多态性与Graves病相关
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中华内分泌代谢杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张海清;梁军;赵跃然;宋怀东;赵家军;高聆
  • 通讯作者：
    高聆

其他文献

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宋怀东的其他基金

UGRP1阳性甲状腺细胞生物学功能及其在AITD发生中的作用探讨
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相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

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技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
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AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
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          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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