低生长速率条件下细菌细胞大小改变对其细胞周期的影响

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31700045
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0103.微生物组学与代谢
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Bacteria cell cycle should be tightly regulated in order to maintain the normal growth and division of the cell. But, by which mechanisms the cells can tightly control their cell cycle are still unknown. We have found that, under fast growth conditions, the average cell volume scales exponentially with growth rate, with a scaling exponent equal to the time from initiation of a round of DNA replication to the cell division at which the corresponding sister chromosomes segregate, which validates the Schaechter-Maaløe-Kjeldgaard Growth Law. However, under slow growth conditions, how the cell cycle operates are still unknown. In this study, we are going to characterize the cell cycle of Escherichia coli under slow growth conditions by using microscope observation, quantitative PCR, flow cytometeric and single cell tracking technologies. Knowledge gained here will deepen our understanding of the bacterial cell cycle and provide important clues for studying molecular mechanisms of the bacterial cell cycle.
细菌细胞周期的准确调控对维持其生存,保持正常的生长分裂状态至关重要。但是,细菌是如何做到细胞周期的精确调控,至今不明。申请人的前期研究发现,在高生长速率条件下,细胞大小与细胞生长速率和DNA复制起始到对应细胞分裂的时间间隔两者的乘积呈指数关系,验证了前人提出的“S-M-K生长法则”。然而,在低生长速率条件下,该法则是否还适用,是领域内尚未解决的问题。针对该关键科学问题,申请人拟通过显微观测、定量PCR、流式细胞检测、微流控和单细胞实时成像等研究手段,利用合成生物学技术线性改变细胞大小,对低生长速率条件下的细胞周期进行系统研究。本项目的开展将深化人们对细菌细胞周期的理解,为研究细菌细胞周期调控的分子机制提供重要线索。

结项摘要

基于群体水平研究揭示的定量规律对于从整体层面理解细胞生长相关的协调机制至关重要。“SMK生长法则”、“恒定起始质量法则”这两个定量规律奠定了当前细菌细胞周期领域研究的基础,其形成的范式模型主导了最近半个多世纪相关的研究。在之前的一项研究中,我们在两种对应高生长速率(即倍增时间低于60分钟)的培养基中,通过扰动细胞尺寸对上述法则进行了验证。主流观点认为,上述法则在高生长速率区域成立;但是,低生长速率区域的细菌细胞周期运行调控模式至今不明。在本项研究中,我们系统、全面、定量的研究了非常宽的生长速率范围内细菌细胞周期运行情况,研究结果表明无论是“SMK生长法则”还是“恒定起始质量法则”都不能很好的描述测得的定量实验数据。进一步,我们揭示了“个体生长分裂方程”,即细菌细胞大小正比于生长速率和细菌细胞DNA复制周期的乘积。在此基础上,我们提出了以“分离许可物”为核心的细菌细胞分裂控制机制假说模型。该模型认为,“分裂许可物”的积累由细胞生长和DNA复制相关事件共同决定;当“分裂许可物”积累达到阈值时,细胞分裂。总的来说,本项研究有望作为基础为细菌细胞周期领域相关的研究带来新的活力和机遇。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
General quantitative relations linking cell growth and the cell cycle in Escherichia coli.
连接大肠杆菌细胞生长和细胞周期的一般定量关系
  • DOI:
    10.1038/s41564-020-0717-x
  • 发表时间:
    2020-08
  • 期刊:
    Nature microbiology
  • 影响因子:
    28.3
  • 作者:
    Zheng H;Bai Y;Jiang M;Tokuyasu TA;Huang X;Zhong F;Wu Y;Fu X;Kleckner N;Hwa T;Liu C
  • 通讯作者:
    Liu C

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延安市某公共建筑风环境数值模拟研究
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  • 作者:
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    杨红霞
多功能作物皇竹草引种的环境风险评价
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郑海;易自成;黎俏文;骆世明;李锦开;黎华寿
  • 通讯作者:
    黎华寿
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
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    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    罗永康*

其他文献

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大肠杆菌拟核结合蛋白H-NS调控其DNA复制与细胞分裂的机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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