鸟氨酸脱羧酶ODC二聚体稳定性抑制剂的发现与功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670768
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0502.分子生物物理
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Polyamines are a kind of organic small molecules important to many normal cellular functions. In human cells, ornithine decarboxylase (ODC) is the rate-limiting enzyme of the polyamine biosynthetic pathway. Studies have shown that the upregulation of ODC enzymatic activity and polyamines’ concentrations in human cells are positively correlated with the origination and development of many kinds of tumors. Therefore, ODC is likely an oncogenetic enzyme. In the past years, ODC inhibitors have been proved to be able to decrease the concentrations of polyamines in cells, and inhibit the growth of cancer cells. However, ODC inhibitors showed little or no efficacy in vivo, due to the increased uptake of exogenous polyamines by cancer cells, which is induced by the compensatory feedback mechanism of the polyamine regulation system. After thoroughly analyzing the research progress in this field, stimulated by the strategies of designing protein-protein interaction inhibitors, and from the viewpoint of systems biology, we are presenting a new scientific hypothesis in this research project: an ODC homodimer stabilizer might be able to inhibit the enzymatic activity of ODC, and at the same time, inhibit the compensatory feedback pathway of the polyamine regulation network. In our preliminary study, by combining a series of research tools, we validated the rationale of this hypothesis and discovered small molecules that can stabilize ODC homodimer and inhibit ODC enzymatic activity. Therefore, in this project, based on our preliminary study, we will do more work to screen and optimize ODC-dimer-stabilizing inhibitors, and study the molecular and cellular mechanism of this kind of ODC inhibitors. We hope the work in this project could validate our scientific hypothesis, and then provide a new research strategy and new research tools to the research field of polyamines.
多胺是一类具有重要生物学功能的小分子,鸟氨酸脱羧酶(ODC)是多胺合成代谢途径的限速酶。细胞中ODC活性及多胺浓度的上调与多种肿瘤发生发展高度正相关,因此ODC被认为是一个致癌蛋白酶。ODC抑制剂能够降低细胞内多胺水平,抑制肿瘤生长,但是细胞会通过反馈补偿途径,增加对胞外多胺的摄取,使ODC抑制剂在活体中疗效减弱。通过分析该领域的研究进展,结合蛋白质功能抑制剂的研究策略,本项目从蛋白相互作用与信号网络调控的角度,提出一个新的科学假设:利用小分子稳定ODC同源二聚体,达到同时抑制ODC酶活和抑制细胞外源多胺摄取能力的双重目的。前期研究中,我们综合利用多种研究手段检验了该假设的可行性,并筛选到能够稳定ODC同源二聚体和抑制ODC活性的小分子。本项目将在前期研究基础上,开展更广泛和更深入的研究,进行ODC二聚体稳定性抑制剂的大量筛选及功能和机理研究,以期为该领域的研究提供新的研究策略和工具。

结项摘要

鸟氨酸脱羧酶(ODC)是多胺合成代谢途径的限速酶,ODC活性及多胺浓度的上调与多种肿瘤发生发展高度正相关。在本项目中,我们致力于发现具有抑制ODC活性且同时能够稳定ODC同源二聚体和抑制ODC-OAZ1相互作用的多功能小分子抑制剂。为此,我们通过蛋白质结构分析,建立了一套该类多功能小分子抑制剂的计算机辅助筛选方法。利用该方法,我们筛选出了42个候选化合物进行实验验证。利用基于光吸收的ODC酶活检测方法、基于FRET系统的ODC-OAZ1相互作用检测方法、基于分析型凝胶柱的ODC二聚体检测方法等,我们获得了3个有效的新型ODC多功能抑制剂。针对其中一个抑制剂(命名为ODC-MPI-1),我们进一步利用TSA、HPLC、MST等方法验证了其对ODC的抑制能力,利用MTT、xCELLigence、HPLC、MANT-spermidine等方法验证了其对A549细胞的增殖抑制能力、对细胞多胺合成的抑制作用、以及对外源多胺摄取能力的影响,最后还分析了ODC-MPI-1在人和鼠微粒体中的稳定性、在人和鼠血清中的稳定性、与人和鼠血清蛋白的结合能力、对心肌细胞膜电位的影响、以及对裸鼠肿瘤的抑制能力。本项目的研究成果证明了筛选和设计ODC二聚体稳定性抑制剂的可行性,为设计新型ODC抑制剂提供了新思路,并为类似蛋白体系的抑制剂设计提供了新的方法。

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(1)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(6)
专利数量(4)
Potential clinical drugs as covalent inhibitors of the priming proteases of the spike protein of SARS-CoV-2
作为 SARS-CoV-2 刺突蛋白引发蛋白酶共价抑制剂的潜在临床药物
  • DOI:
    10.1016/j.csbj.2020.08.016
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL
  • 影响因子:
    6
  • 作者:
    Li, Qizhang;Wang, Zhiying;Liu, Sen
  • 通讯作者:
    Liu, Sen
生物体内多胺对蛋白质影响的研究进展
  • DOI:
    10.13345/j.cjb.170261
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张玲娅;刘森
  • 通讯作者:
    刘森
Kallikrein-related peptidase 7 is a potential target for the treatment of pancreatic cancer.
激肽释放酶相关肽酶 7 是治疗胰腺癌的潜在靶点。
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.24132
  • 发表时间:
    2018-02-27
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Du JP;Li L;Zheng J;Zhang D;Liu W;Zheng WH;Li XS;Yao RC;Wang F;Liu S;Tan X
  • 通讯作者:
    Tan X
鸟氨酸脱羧酶抗酶抑制剂蛋白家族研究进展
  • DOI:
    10.13488/j.smhx.20180411
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生命的化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张钰宏;柴晓颖;刘森
  • 通讯作者:
    刘森
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  • DOI:
    10.13345/j.cjb.190020
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李金奎;曹春雨;喻玲玲;刘森
  • 通讯作者:
    刘森

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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