鼻咽癌转移相关通路分子的microRNA调控机制及3'UTR区可变剪切的作用研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81372886
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Metastasis is the major cause of death for the patients with nasopharyngeal carcinoma (NPC). Efficient methods for the prediction and treatment of metastatic NPC are sorely needed. However, few studies have been conducted in microRNAs associated with tumor metastasis (named "metastamir") in NPC. Therefore, we sought to determine metastamirs for NPC using microRNA expression profiling array method. We will further investigate the regulation mechanisms of signaling pathways mediated by microRNAs, and the interaction between EBV genes and metastamirs. On the other hand, a new mechanism of oncogene activation was found through the loss of miRNA regulation by the alternative cleavage and polyadenylation (APA) in 3'UTR of target genes. However, no study has been conducted to investigate APA in nasopharyngeal carcinoma to date. Therefore, we proposed to study the 3'UTR shortening in nasopharyngeal carcinoma by using the cutting-edge Next-Generation RNA sequencing technology,the 3'READS technology. It is interesting to know how APA interferes miRNA mediated NPC metastasis. All together, this study proposed here will systematically investigate the mechanisms of metastmirs in NPC, which might not only provide a new target for drug design for the treatment of metastatic NPC , but also put insights on better understanding of microRNA in the tumor metastasis.
鼻咽癌转移是导致患者死亡的重要原因,预测和治疗鼻咽癌转移是临床上急需解决的关键问题,然而鼻咽癌转移相关的microRNA(metastamir)尚未得到系统深入的研究。因此,本课题拟采用microRNA表达谱芯片的方法,筛选鼻咽癌metastamir,深入研究其对转移相关信号通路的调控机制,以及EB病毒对鼻咽癌metastamir的调控作用。另一方面,靶基因3'UTR的可变剪切和多聚腺苷酸化(APA)可逃避microRNA的调控,是癌基因激活的新方式。对鼻咽癌中APA的研究目前尚未见报道。我们拟采用新一代测序技术检测鼻咽癌中转移相关信号通路基因的APA现象,探讨其对microRNA调控作用的影响,及在鼻咽癌转移中的作用。本研究将系统、深入地探讨microRNA介导的基因转录后调控在鼻咽癌转移中的作用,以期为预测鼻咽癌转移和基于microRNA的靶向药物的开发提供分子靶点和重要的理论基础。

结项摘要

本课题的主要目标是筛选鼻咽癌转移相关的信号通路和microRNA,并对靶基因3’UTR的可变剪切和多聚腺苷酸化(APA)进行分析,以期为预测鼻咽癌转移和靶向药物的开发提供分子靶点。为完成本课题,我们首先对正常鼻咽上皮细胞和三株鼻咽癌细胞系进行全基因组RNA深度测序,筛选出一系列差异表达mRNA和miRNA。收集3对鼻咽癌患者的癌和癌旁组织进行3’UTR测序,筛选mRNA 3’UTR可变剪切在癌和癌旁有显著差异的基因。并在69例鼻咽癌组织中分别采用免疫组化和qRT-PCR方法检测相关蛋白和miRNA的表达水平,与患者的临床病理特征及生存和预后进行相关性分析,结果发现若干与鼻咽癌转移相关的基因。我们对其中一部分转移相关的mRNA和miRNA进行了细胞功能和分子机制的深入研究。我们的研究发现miR-18a在鼻咽癌组织中表达量明显升高,并与远处转移相关。进一步研究发现EBV编码的LMP1蛋白可通过NF-B通路诱导miR-18a的表达。miR-18a可抑制靶基因SMG1的表达,而SMG1是mTOR拮抗分子。miR-18a通过调控SMG1的表达激活mTOR通路,从而促进鼻咽癌的生长和转移。根据我们的测序结果,发现在鼻咽癌细胞中TRIM29、EpCAM和BMP2基因高表达,并与患者分期,转移和预后相关。我们对这三种基因分别进行了深入的功能研究,发现在鼻咽癌中低表达的miR-335-5p和miR-15b-5p可转录后调控TRIM29的表达,而TRIM29可通过激活AKT/mTOR信号通路,从而促进鼻咽癌的侵袭和转移;发现EpCAM可增强鼻咽癌细胞的成球能力和侵袭转移能力,并可抑制PTEN的表达;BMP2与鼻咽癌患者预后和骨转移相关,BMP2过表达可促进鼻咽癌细胞的侵袭转移能力。相关文章已分别发表于于《Oncotarget》、《Aging》和《Cell death & disease》。另有2篇文章已撰写完成,拟投稿《Cancer》和《Theranostics》。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
BMP2 promotes proliferation and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells via mTORC1 pathway.
BMP2通过mTORC1通路促进鼻咽癌细胞增殖和侵袭
  • DOI:
    10.18632/aging.101230
  • 发表时间:
    2017-04
  • 期刊:
    Aging
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang MH;Zhou XM;Zhang MY;Shi L;Xiao RW;Zeng LS;Yang XZ;Zheng XFS;Wang HY;Mai SJ
  • 通讯作者:
    Mai SJ
Upregulated TRIM29 promotes proliferation and metastasis of nasopharyngeal carcinoma via PTEN/AKT/mTOR signal pathway
TRIM29上调通过PTEN/AKT/mTOR信号通路促进鼻咽癌增殖和转移
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.7215
  • 发表时间:
    2016-03-22
  • 期刊:
    ONCOTARGET
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhou, Xiao-Min;Sun, Rui;Mai, Shi-Juan
  • 通讯作者:
    Mai, Shi-Juan

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    沈国平
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  • 期刊:
    中山大学学报(医学科学版)
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  • 作者:
    王凤伟;刘文举;廖奕佶;邓海霞;陈诗萍;买世娟;谢丹
  • 通讯作者:
    谢丹

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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