5p15.33 TERT-CLPTM1L区域多态性与鼻咽癌的遗传关联研究

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基本信息

  • 批准号：
    81000903
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    张旸
  • 依托单位：
    中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
  • 学科分类：
    H1804.肿瘤遗传与进化
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

鼻咽癌是高发于我国南方的恶性肿瘤，具有颈淋巴结转移早、远处转移发生率高的临床特点，严重影响患者的治疗效果和预后。寻找能预测鼻咽癌发生风险与病程进展的有效指标一直是亟需解决的重要科学问题。近一年多来，多篇全基因组关联研究（GWAS）相继报道了5p15.33的TERT-CLPTM1L基因区域与多种肿瘤的发生风险相关。前人及申请人前期的免疫组化实验均发现，TERT和CLPTM1L在鼻咽癌组织中的表达均显著增高。通过生物信息学方法确定了TERT-CLPTM1L区域的26个单倍型标签SNPs。本项申请拟在此基础上，首先通过病例-对照和核心家系相结合的群体关联研究，确定这一基因组区域的多态性位点是否在群体水平与鼻咽癌的发生风险和病程进展具有相关性，然后采用一系列功能实验进一步明确显著关联的SNP位点的功能意义，揭示遗传学关联背后蕴含的生物学和医学意义，为未来的实际应用奠定基础。

结项摘要

TERT-CLPTM1L基因区域多态性已被报道与多种肿瘤的发生风险相关。该区域存在两个已知的基因，端粒酶反转录酶TERT和唇腭裂跨膜1样蛋白CLPTM1L基因。本研究探讨了这一基因区域多态性与鼻咽癌遗传易感性的关系。.本研究在TERT-CLPTM1L基因区域共确定了26个htSNPs。在广西鼻咽癌病例对照人群中分型成功25个位点，统计分析去除分布不符合哈迪-温伯格平衡准则的位点和最小等位频率（MAF）小于0.01的位点3个。以多因素logistic回归方法分析，在校正年龄、性别、吸烟、吸烟量、饮酒、家族史后，经过SNPSpD多重检验校正，在加性遗传模式和共显性遗传模式下共有4个SNPs（rs2736098、rs2735845、rs402710和rs401681）与鼻咽癌的发生风险相关。对这4个SNPs在广东鼻咽癌病例对照人群中进行了验证，发现rs2735845和rs401681仍然与鼻咽癌的发生风险显著相关（广西广东联合人群中rs2735845，OR = 1.23，P = 4.6E-5；rs401681，OR = 0.81，P = 1.0E-4）。在脐带来源的间充质干细胞中，与CC基因型相比，rs2735845 G等位携带者的CLPTM1L mRNA水平显著增加（P = 0.02）；与CC基因型相比，rs401681 TT基因型与短的端粒长度显著相关（P = 0.002）。免疫组化实验显示，TERT、CLPTM1L在鼻咽癌组织中表达均高于非癌鼻咽部组织。.TERT功能性串联重复MNS16A的S等位型是鼻咽癌发生风险的保护等位型（OR = 0.86，P = 0.014），且在分化差的鳞状细胞癌组中其保护作用更显著。携带S等位的鼻咽癌患者年龄较LL基因型鼻咽癌患者年龄大。免疫组化实验显示S等位型的TERT蛋白的表达显著低于LL基因型（P = 0.035）。.本研究首次鉴定出了与鼻咽癌遗传易感性关联的TERT-CLPTM1L基因区域中的两个SNP位点（rs2735845和rs401681）和一个串联重复多态性位点（MSN16A）。本研究为鼻咽癌的遗传易感性提供了新的遗传标记，有助于鼻咽癌发病机理的进一步研究和鼻咽癌的早期预防、诊断和个体化治疗。

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
A functional tandem-repeats polymorphism in the downstream of TERT is associated with the risk of nasopharyngeal carcinoma in Chinese population.
TERT下游的功能性串联重复多态性与中国人群鼻咽癌的风险相关。
  • DOI：
    10.1186/1741-7015-9-106
  • 发表时间：
    2011-09-20
  • 期刊：
    BMC medicine
  • 影响因子：
    9.3
  • 作者：
    Zhang Y;Zhang H;Zhai Y;Wang Z;Ma F;Wang H;Li P;Zhang Y;Yu L;Cui Y;He F;Zhou G
  • 通讯作者：
    Zhou G

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其他文献

植物表皮蜡质合成转运调控相关基因与干旱响应的研究进展
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 作者：
    王立山;丁兵;李玉花;张旸
  • 通讯作者：
    张旸
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  • 通讯作者：
    杨春燕

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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