太平洋鳕鱼cathelicidin免疫功能基因的克隆与表达及其结构与功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41076098
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    36.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

Cathelicidin(CATH)是生物体基因编码的自身免疫防御系统的重要肽类,在探讨免疫疾病发病及分子遗传机制等方面发挥了重要作用。最近,我们从北方海域主要经济鱼类之一的太平洋鳕(Gadus macrocepha)脾脏cDNA文库中成功克隆了两条CATH功能基因,为国内外首次,且为国内唯一发现的鱼类CATH。约800bp片段涵盖完整CDS,其编码的61个氨基酸的成熟肽含有多个RGS结构域,与已知的哺乳类,鸟类等CATH家族差异显著。本项目将继续鳕鱼CATH基因的筛选、克隆,为深入了解鳕鱼抗感染免疫的分子基础,研究CATH的进化历程, 进一步阐述CATH免疫相关基因进化上的生物关联性和变异性提供实物依据。并希望通过表达及分子改造,深入研究其成熟肽及衍生物的高级结构及in vitro和in vivo活性,为海洋创新药物的研制提供先导化合物,并为海水养殖病害生物学防治提供理论物质基础。

结项摘要

Cathelicidins是动物体内具有多功能的宿主防御肽家族,目前在几乎所有种类的脊椎动物体内均有发现。不仅具有强大抗微生物活性,cathelicidins还具有趋化免疫细胞、促进伤口愈合、诱导血管发生、诱导变异细胞系细胞凋亡等活性,与多种免疫疾病的发病机制有关。 细鳞鱼(Brachymystax lenok),国家二级保护动物,隶属鲑科细鳞属,冷水性鱼类,我国只存在一种,主要分布于我国的东北和秦岭一带。我们提取了细鳞鱼脾脏RNA,构建了cDNA文库;并使用RACE加半巢式PCR的方法,从脾脏cDNA文库中克隆得到一种新型cathelicidin:CATH_BRALE。CATH_BRALE 的前体包含199个氨基酸,理论等电点(pI)为12.43,理论MW为5.2006 kDa,含有15个碱性氨基酸残基(11个精氨酸和4个赖氨酸),静电荷为+13,是一种较强的碱性多肽。其成熟肽有53个氨基酸残基,序列为:RRSKARGGSRGSKMGRKDSKGGSRGRPGSGSRPGGGSSIAGASRGDRGGTRNA。与已报道的代表性鱼类cathelicidins比对结果表明,鲑科cathelicidins普遍都存在一个或多个由六个氨基酸串联序列(RPGGGS)组成的遗传不稳定区域,这点与哺乳动物cathelicidins具有一定的相似性。其次,CATH_BRALE与其他鲑科cathelicidins都含有高比例的精氨酸和甘氨酸,后者使其与其他物种cathelicidins具有很大差异,可能与大分子相互作用有关。CATH_BRALE 在鱼鳃中有最高的表达量,其次是脾脏、肝脏,同源建模显示出的ɑ-helices和反相平行的β-sheets结构,这些均属于典型阳离子抗菌肽家族特征。化学合成的CATH_BRALE对检测的40余种菌株具有广谱的杀菌活性,尤其对革兰氏阴性菌,CATH_BRALE表现出比人cathelicidin—LL-37更强的活性。CATH_BRALE对铜绿假单胞菌(pseudomonas aeruginosa)最为敏感,最小抑菌浓度仅为1.17μM,对鱼类的两种细菌性病原体杀鲑气单胞菌和嗜水气单胞菌,最小抑菌浓度(MIC)低至9.38μM。CATH_BRALE对人的红细胞只有微小的溶血活性,溶血率仅为6.8%,显示出了很高的临床应用价值。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Cathelicidins家族抗菌肽研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    动物学研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于海宁;广慧娟;厉 政;王义鹏;赖 仞
  • 通讯作者:
    赖 仞
Amphibian cathelicidin fills the evolutionary gap of cathelicidin in vertebrate
两栖动物抗菌素填补了脊椎动物抗菌素的进化空白
  • DOI:
    10.1007/s00726-011-1116-7
  • 发表时间:
    2012-08-01
  • 期刊:
    AMINO ACIDS
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Hao, Xue;Yang, Hailong;Lai, Ren
  • 通讯作者:
    Lai, Ren
Host defense peptides in skin secretions of Odorrana tiannanensis: Proof for other survival strategy of the frog than merely anti-microbial
天南青蛙皮肤分泌物中的宿主防御肽:青蛙除抗菌之外的其他生存策略的证据。
  • DOI:
    10.1016/j.biochi.2011.09.017
  • 发表时间:
    2012-03-01
  • 期刊:
    BIOCHIMIE
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    He, Weiyu;Feng, Feifei;Yu, Haining
  • 通讯作者:
    Yu, Haining
Molecular cloning, sequence analysis and phylogeny of first Caudata g-type lysozyme in Axolotl (Ambystoma mexicanum).
墨西哥钝口螈 (Ambystoma mexicanum) 中第一个有尾目 g 型溶菌酶的分子克隆、序列分析和系统发育。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Zoolog Sci
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Haining Yu;Jiuxiang Gao;Yiling Lu;Xue Qiao;Shasha Cai;Songyan Zhang;Yipeng Wang
  • 通讯作者:
    Yipeng Wang
Gene cloning, expression and characterization of avian cathelicidin orthologs, Cc-CATHs, from Coturnix coturnix
来自 Coturnix coturnix 的禽类导管素直向同源物 Cc-CATH 的基因克隆、表达和表征
  • DOI:
    10.1111/j.1742-4658.2011.08080.x
  • 发表时间:
    2011-05-01
  • 期刊:
    FEBS JOURNAL
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Feng, Feifei;Chen, Chen;Yu, Haining
  • 通讯作者:
    Yu, Haining

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基层和公共卫生人员工作努力程度影响因素分析
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  • 作者:
    常捷;于海宁;辛全兵;杨冰一;孔鹏;孟庆跃;CHANG Jie1,YU Hai-ning1,XIN Quan-bing2,YANG Bing-y
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  • 通讯作者:
    于海宁
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    通信学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于海宁;张宏莉;方滨兴;余翔湛
  • 通讯作者:
    余翔湛
Cathelicidin家族抗菌肽研究进展。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Zoological Research
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    广慧娟;厉 政;王义鹏,;赖 仞;于海宁
  • 通讯作者:
    于海宁
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    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杜思佳;于海宁;张宏莉
  • 通讯作者:
    张宏莉

其他文献

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缅甸蟒免疫调节肽Cb-CATH1抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染的机制研究
  • 批准号:
    31872223
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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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