海胆杂交子代繁殖特性及生长性状杂种优势的分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31672652
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1902.水产生物遗传育种学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Hybridization (cross breeding) is a traditional way to improve the germplasm quality and generate new species in aquaculture. A hybrid sea urchin (Anthocidaris crassispina♀ ×  Strongylocentrotus intermedius♂) and its parental species were utilized to study the reproductive characteristics by monitoring the development of gonad and the formation of gametes under microscope. On the basis of previous work, comparative transcriptomic and proteomic analysis, and microRNA prediction technique were utilized to find out the candidate genes, microRNAs and signal transduction pathways that involved in sea urchin growth heterosis, so that we can clarify the molecular mechanisms underlying sea urchin heterosis from transcription (mRNA) level, post-transcription regulation (microRNA) level and translation (protein) level. All data observed in this study will enrich our knowledge of molecular mechanisms underlying sea urchin heterosis, especially, distant hybridization, meanwhile, the data observed in this study will provide more theoretical support for effective utilization of marine hybrids as well, and give more clues to promote the development of aquaculture.
杂交育种是水产动物种质改良和新种创制的传统方式。本研究以我国产紫海胆(Anthocidaris crassispina,♀)和中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius, ♂)杂交子代为研究对象,在前期工作基础上,通过显微观察、测量等方法研究其生殖腺的发育周期及配子发生规律,探讨海胆远缘杂交(科间杂交)子代的繁殖特性;利用比较转录组、比较蛋白质组分析方法以及转录组-蛋白质组联合分析预测microRNA等生物信息学手段,从转录和翻译两个层次筛选决定紫(♀)-中(♂)杂交海胆生长性状杂种优势的候选基因及信号通路,利用转录组-蛋白质组联合分析预测microRNA方法,明确参与调控候选基因表达的microRNAs,进而阐明杂交海胆生长性状杂种优势的分子网络和调控机制,以期丰富棘皮动物杂种优势分子机制研究的资料,为充分认识和完善海洋生物杂种优势体系提供更多参考。

结项摘要

杂交育种是水产动物种质改良和新种创制的传统方式。本研究以远缘杂交海胆(紫海胆♀×中间球海胆♂;马粪海胆♀×中间球海胆♂)子代为研究对象,在前期工作基础上,通过显微观察、测量等方法研究其生殖腺的发育周期及配子发生规律,探讨海胆远缘杂交子代的繁殖特性;利用比较转录组、比较小RNA转录组、microRNA(miRNA)— mRNA联动分析、比较代谢组以及生物信息预测等技术手段,从转录、转录后调控和代谢三个层次解析杂交海胆的繁殖特性以及生长性状杂种优势形成的分子网络和调控机制。研究结果显示:(1)在生长特性方面,远缘杂交海胆在早期胚胎发育阶段就在生长速度和高温耐受性方面显示出了比双亲海胆自繁后代更为优越的杂种优势;(2)在繁殖特性方面,远缘杂交海胆的性腺发育速度与双亲海胆自繁后代相比并无显著差异且存在性别分化现象,但是,其成体性腺中成熟生殖细胞数量较少,提示,远缘杂交海胆可能由于生殖细胞成熟受阻而具有育性低和繁殖力弱等特点;(3)比较转录组、比较小RNA转录组、microRNA(miRNA)- mRNA联动分析以及比较代谢组学分析结果显示,与双亲海胆自繁后代相比,远缘杂交海胆中与生长性状杂种优势形成密切相关的基因主要富集在PI3K-Akt、cAMP和Rap1三条通路中,参与这些基因转录后调控的关键miRNAs主要包括miR-2001、let-7和miR-4852等,而这些基因的最终表达产物则通过参与脂类和类脂分子代谢、有机酸及其衍生物代谢、有机杂环化合物代谢以及核苷、核苷酸及类似物代谢途径调控远缘海胆杂交子代生长性状杂种优势的形成。本项目研究结果不仅从转录、转录后调控和代谢三个层次阐明了杂交海胆子代生长性状杂种优势形成的分子网络和调控机制,还首次证实了棘皮动物远缘杂交个体中存在线粒体父系渗漏与线粒体DNA异序性现象,创造性地构建了以壳径推算海胆性腺发育的技术方法体系,不仅丰富了棘皮动物的分子生物学数据和杂种优势形成的分子机制研究资料,更为经济棘皮动物分子辅助育种提供了新的线索和参考,为充分认识和完善海洋生物杂种优势理论体系提供了更多的参考资料。

项目成果

期刊论文数量(19)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
水产动物Akt基因研究进展
  • DOI:
    10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.04.021
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    大连海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘丽;孙景贤;常亚青;崔东遥;李莹莹;李开全;湛垚垚
  • 通讯作者:
    湛垚垚
中间球海胆卵膜与受精膜去除方法及染色体核型分析
  • DOI:
    10.3724/sp.j.1118.2020.19352
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中国水产科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈小慧;张伟杰;李雅娟;刘雷;张宝警;丁君;常亚青
  • 通讯作者:
    常亚青
Transcriptome analysis to characterize the genes related to gonad growth and fatty acid metabolism in the sea urchin Strongylocentrotus intermedius
转录组分析表征海胆 Strongylocentrotus intermedius 性腺生长和脂肪酸代谢相关基因
  • DOI:
    10.1007/s13258-019-00864-0
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Genes & Genomics
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Wang Heng;Ding Jun;Ding Siyu;Chang Yaqing
  • 通讯作者:
    Chang Yaqing
中间球海胆抗病家系的筛选及其生长性能分析
  • DOI:
    10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019-193
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    大连海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    江会杰;张伟杰;陈隆;刘杰豪;吕雪峰;王中;刘雷;常亚青
  • 通讯作者:
    常亚青
Identification and characterization of microRNAs from the tube foot in the sea urchin Strongylocentrotus intermedius
海胆 Strongylocentrotus intermedius 管足 microRNA 的鉴定和表征
  • DOI:
    10.1016/j.heliyon.2018.e00668
  • 发表时间:
    2018-06
  • 期刊:
    Heliyon
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Zhan Y;Li Y;Cui D;Pei Q;Sun J;Zhang W;Chang Y
  • 通讯作者:
    Chang Y

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其他文献

虾夷扇贝面盘幼虫细菌性疾病的病原研究
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    朱玲;陈军;张恩鹏;徐高荣;常亚青;王玲玲;宋林生
  • 通讯作者:
    宋林生
低盐胁迫下仿刺参DD104基因的定量表达分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    大连海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    田燚;莫海波;常亚青
  • 通讯作者:
    常亚青
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国水产科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    丁君;孙巍;常亚青
  • 通讯作者:
    常亚青
外源性激素对光棘球海胆性别相关基因 dmrt1、foxl2和 boule 表达的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    水 产 学 杂 志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    胡彪;崔洲平;魏金亮;张健;王娅;张伟杰;孙志惠;常亚青
  • 通讯作者:
    常亚青
虾夷马粪海胆NLR家族基因片段的克隆及表达特征分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    大连海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈亚东;刘晓飞;常亚青;仇雪梅;王秀利;刘洋
  • 通讯作者:
    刘洋

其他文献

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常亚青的其他基金

MicroRNA-92家族调控刺参疣足大小分化的分子机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目
刺参耐寒相关基因筛选及表达研究
  • 批准号:
    31072230
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
    35.0 万元
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    面上项目
虾夷扇贝生长性状的QTL定位研究
  • 批准号:
    30671594
  • 批准年份:
    2006
  • 资助金额:
    27.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
刺参多倍体及生物能量学比较研究
  • 批准号:
    30200212
  • 批准年份:
    2002
  • 资助金额:
    19.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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