自发调节的遗传开关在细菌进化中的作用:一个沙门氏菌的模型

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30970078
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

生物在进化中需要产生遗传多样性,其机制包括新基因的获得和突变的累积。然而,mutL等基因通常会严格限制遗传多样性的出现,使进化难以发生。我们最近发现,mutL能在野生和缺陷型之间自发地相互转换。这一现象提示mutL可能在生物进化中作为遗传开关,适时开合,在保持生物遗传特性相对稳定的同时,允许变异的产生。我们拟通过蛋白相互作用比较野生和缺陷型mutL产物的功能,用PCR法检测沙门菌mutL缺陷型细胞的基础频率及其在特定条件下的动态频率,进而经基因置换技术探讨mutL遗传开关的切换机制及其对细菌基因组稳定性的影响。鉴于mutL野生和缺陷型之间的转换可能发生得很快、不易检测出来,我们将通过改变碱基以阻止mutL由野生型向缺陷型的转换,把mutL锁定在野生型状态,然后观察变异是否仍能发生,以进一步探讨mutL在遗传开关中的作用。本研究将为细菌进化的调控和新病原菌产生的机制研究提供新的理论依据。

结项摘要

生物在进化中需要产生遗传多样性,其机制包括新基因的获得和突变的累积。然而,mutL等基因通常会严格限制遗传多样性的出现,使进化难以发生。我们最近发现,mutL能在野生和缺陷型之间自发地相互转换。这一现象提示mutL可能在生物进化中作为遗传开关,适时开合,在保持生物遗传特性相对稳定的同时,允许变异的产生。我们通过蛋白相互作用比较野生和缺陷型mutL产物的功能,发现突变型mutL缺乏与ATP酶结合活性,且突变株与敲除mutL菌株突变率近似,我们检测了沙门菌mutL缺陷型细胞的基础频率及其在特定条件下的动态频率,并进一步经基因置换技术对mutL遗传开关的进行“锁定”和“解锁”。观察突变发生频率和数量,发现当遗传开关处于锁定状态时细菌突变率会明显升高,而随即又对其进行解锁后其突变率可发生恢复,证实遗传开关的这种切换机制对细菌基因组稳定性有着重要的关联,可能与细菌基因组插入缺失及基因组的稳定性有着直接的关联。本研究将为细菌基因组进化的发生和调控机制的探索和新病原菌产生的机制研究提供了全新的理论角度和依据。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
SPC-P1: a pathogenicity-associated prophage of Salmonella paratyphi C.
SPC-P1:丙型副伤寒沙门氏菌致病性相关原噬菌体
  • DOI:
    10.1186/1471-2164-11-729
  • 发表时间:
    2010-12-30
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zou QH;Li QH;Zhu HY;Feng Y;Li YG;Johnston RN;Liu GR;Liu SL
  • 通讯作者:
    Liu SL
Identification of a Known Mutation in Notch 3 in Familiar CADASIL in China
中国常见 CADASIL 中 Notch 3 已知突变的鉴定
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2012-01-01
  • 期刊:
    Figshare
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu, Ji;Liu, Gui-Rong;Zhu, Yu-Lan
  • 通讯作者:
    Zhu, Yu-Lan
The type VI secretion system gene cluster of Salmonella typhimurium: Required for full virulence in mice
鼠伤寒沙门氏菌VI型分泌系统基因簇:对小鼠具有完全毒力所必需的
  • DOI:
    10.1002/jobm.201200047
  • 发表时间:
    2013-07-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Liu, Ji;Guo, Ji-Tao;Liu, Shu-Lin
  • 通讯作者:
    Liu, Shu-Lin
Pseudomonas aeruginosa isolates of distinct sub-genotypes exhibit similar potential of antimicrobial resistance by drugs exposure
不同亚基因型的铜绿假单胞菌分离株通过药物暴露表现出相似的抗菌药物耐药性潜力
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Antonie van Leeuwenhoek
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘桂荣
  • 通讯作者:
    刘桂荣
Inheritance of the Salmonella virulence plasmids: Mostly vertical and rarely horizontal
沙门氏菌毒力质粒的遗传:大部分是垂直的,很少是水平的
  • DOI:
    10.1016/j.meegid.2012.03.004
  • 发表时间:
    2012-07-01
  • 期刊:
    INFECTION GENETICS AND EVOLUTION
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Feng, Ye;Liu, Ji;Liu, Shu-Lin
  • 通讯作者:
    Liu, Shu-Lin

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  • 通讯作者:
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刘桂荣的其他基金

遗传开关调控细菌的基因组稳定性和变异性:与致病性进化相关性的探讨
  • 批准号:
    81971910
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    55 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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