广义当归属的系统发育研究与分类学修订

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470009
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0201.植物分类学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Angelica sensu lato (s.l., Apiaceae subfamily Apioideae) comprises about 110 species, with major genera including Angelica L., Archangelica Hoffm., Coelopleurum Ledeb., Ostericum Hoffm. and Czernaevia Turcz. ex Ledeb. It displays a typical eastern Asia and North America disjunct distribution pattern in temperate regions of the northern hemisphere, with two distribution centers: eastern Asia including easten Himalayan regions, and North America. China is one of the diversity centers of Angelica including 58 (35 endemic) species from ancient to evolutive members. In recent years, molecular phylogenetic studies indicate that neither Angelica s.l. nor Angelica s.s. is monophyletic, but how to make a reasonable classification is still controversal. In this project, we will select two or three nrDNA (nuclear genes) and six chloroplast gene fragments (cpDNA) as molecular targets for these taxa carry out phylogenic research, combined with data of morphological, micromorphological and observations of comparative anatomy, to discuss the taxonomic and systematic problem within Angelica s.l. and taxonomic revision. On this base, synthetical studies are carried out to explore reliable morphological identification features for intergeneric and intrageus groups within Angelica s.l. Combined with these taxa floristic geography, molecular phylogeny and geohistory information, we will study the biogeography of Angelica (s.l.) and a few key species phylogeography, in order to explore its mechanism of evolution, reveal the potential dispersal and migration routes, and clarify the origin and process of the exsting geographic distribution pattern. The long-term goal is to provided a reasonable classification for Angelica s.l. and its allies that reflects its evolutionary history, ultimately to provide new contributions for the study of the worldwide Angelicinae and Apiaceae.
伞形科广义当归属含当归属、古当归属、高山芹属、山芹属和柳叶芹属,全球约有110种,分布于北温带地区,有两个分布中心,一是东亚及东喜马拉雅,另一个是北美,为典型的东亚北美间断分布类群。中国有58种(35个特有种),是该类植物的东亚分布中心,我国分布着形态上从古老到进化的各种类群,近年分子系统学研究表明,广义及狭义当归属均非单系类群,而具体该如何分类处理则存在分歧。本研究选择2个核基因和2-3个叶绿体基因片段为分子指标,结合已有分子资料及形态学、微形态学和比较解剖学研究,拟对中国广义当归属的系统发育进行研究并对其分类问题进行修订。在此基础上结合其区系地理学、分子系统发育和地史资料,研究该类群的3近缘种的谱系地理学,以探讨其进化机制、扩散迁移路线和现有地理分布格局形成过程和机制等,为研究世界广义当归属及当归族提供佐证。

结项摘要

本项目为小额资助项目,执行时间为2年。.本项目原计划任务为:预计采集标本66种(含外类群),选择2核和2叶绿体基因片段为分子指标,结合各分支学科数据,对中国广义当归属的系统发育进行研究并对其分类问题进行修订。同时,预计采集紫花前胡及近缘外类群朝鲜当归的所有地理分布区的分子样品300个体,并对其进行谱系地理学研究,以探讨其进化机制、扩散迁移路线和现有地理分布格局形成过程和机制等,为研究世界广义当归属及当归族提供佐证。.谱系地学研究。.在执行本项目的过程中,我们共进行了10次野外采集,共采集到了98种(含外类群)187居群的广义当归属及近缘类群标本和实验样品。.(1)我们选择3核和4叶绿体基因对所采集的98种广义当归属及近缘类群样品进行了7分子片段测序,重建了其系统发育关系,探讨了属级和属下各分类等级的分类界限。.(2)谱系地理学研究方面,我们采集了3组11种85个居群814个个体的分子样品和标本。完成了4-6个分子片段测序,并对其谱系地理学进行了研究,探讨进化机制、扩散迁移路线和现有地理分布格局成因等科学问题。.(3)基于上述两个方面的结果,结合本项目执行中我们所进行的形态学、微形态和比较解剖学研究结果,对广义当归属进行了分类学修订。. 综合上述各分支学科数据,探索了广义当归属及近缘类群属级和种级分类学的可靠形态鉴定特征,探索了形态与分子发育间的联系。结合其区系地理学、分子系统发育和地史资料,研究了广义当归属及近缘群的生物地理学及谱系地理学,为世界当归族及伞形科的研究提供了佐证。. 本项资助发表学术论文16篇,其中SCI论文10篇(第一标注5篇,第二标注5篇),国内核心期刊论文6篇(第一标注1篇,第二标注4篇,第三标注1篇),培养毕业研究生7人,其中获硕士学位4人,博士学位3人。此外,在投SCI论文3篇。完成了项目各项任务,部分超额完成。

项目成果

期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Revisiting the evolutionary events in Allium subgenus Cyathophora (Amaryllidaceae): Insights into the effect of the Hengduan Mountains Region (HMR) uplift and Quaternary climatic fluctuations to the environmental changes in the Qinghai-Tibet Plateau
重温石蒜科葱亚属的进化事件:横断山地隆升和第四纪气候波动对青藏高原环境变化的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Molecular Phylogenetics and Evolution
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Xie; Deng-Feng;Huang; De-Qing;Gao; Yun-Dong;He; Xing-Jin
  • 通讯作者:
    Xing-Jin
Morphological and ecological divergence of Lilium and Nomocharis within the Hengduan Mountains and Qinghai-Tibetan Plateau may result from habitat Specialization and hybridization
横断山和青藏高原百合和野百合的形态和生态分化可能是生境特化和杂交的结果
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    BMC Evolutionary Biology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Yun-Dong Gao;Alan J Harris;Xingjin He
  • 通讯作者:
    Xingjin He
东亚特有植物合被韭和长梗合被韭遗传多样性的ISSR分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨敬天;卢艳;周颂东;何兴金
  • 通讯作者:
    何兴金
Intraspecific differentiation of Pleurospermum hookeri (Apiaceae), and its interspecific relationships with two close relatives in the genus Pleurospermum
侧柏(伞形科)的种内分化及其与侧柏属两个近亲的种间关系
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Systematics and Evolution
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Xiang-Guang Ma;Yun-Dong Gao;Cai Zhao;Xing-Jin He
  • 通讯作者:
    Xing-Jin He
基于3种基因序列对百合属Leucolirion组的系统发育与种间关系研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赖山潘;沈呈娟;周颂东;何兴金
  • 通讯作者:
    何兴金

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其他文献

宝兴百合与匍茎百合遗传多样性的ISSR
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    沈呈娟;周颂东;何兴金
  • 通讯作者:
    何兴金
中国假百合属亲缘关系及假百合 遗传多样性的ISSR分析
  • DOI:
    doi:10.7606/j.issn.1000-4025.2016.03.0449
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨梅;周颂东;何兴金;彭昶
  • 通讯作者:
    彭昶
珍稀濒危植物距瓣尾囊草遗传多样性的ISSR分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    西北植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张云香;胡灏禹;何兴金
  • 通讯作者:
    何兴金
大娄山区巴山榧树遗传多样性的RAPD分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    东北林业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周先容;周颂东;何兴金;尚进;江波
  • 通讯作者:
    江波
利用蚕豆根尖微核试验研究入侵植物胜红蓟的化感作用潜力
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    植物保护
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴亚娟;何兴金
  • 通讯作者:
    何兴金

其他文献

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广义藁本属及近缘属的分类学修订与分子系统发育研究
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中国葱属的分子系统学与细胞地理学研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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