HBV准种基线预测抗病毒药物反应性和耐药性研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81101297
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    14.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2109.医学病毒学与病毒感染研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2012-12-31

项目摘要

慢性乙型肝炎(CHB)是一种难治性疾病, α干扰素和核苷类似物(NAs)抗病毒治疗是目前国际上公认的少数有效的治疗方法。NAs治疗有效、易行、安全,已成为抗病毒治疗的主流方法,但长期使用会产生耐药。目前CHB患者抗病毒治疗的NAs选择没有统一的标准,缺乏像指导临床抗生素应用的体外药敏实验系统。抗病毒药物的选择存在很大的盲目性,正是这种盲目性令NAs抗病毒耐药的管理非常困难。大量的临床结果显示,不同的病人对同一NAs的反应性不一样,同一病人对不同NAs反应也不同。越来越多的研究表明,NAs的不同反应性与HBV存在的准种现象有密切关系。因此,全面研究准种的特点具有非常重要的意义。本课题拟采用高通量的测序技术对准种进行大样本的检测,分析准种在不同NAs作用下的动力学变化,准种的模式组成、比例分布、进化规律等。从而找出具有预测价值的准种特征,建立基线预测的数学模型,更好的指导临床合理用药。

结项摘要

慢性乙型肝炎(CHB)是一种难治性疾病,核苷类似物(NAs)治疗有效、安全,已成为抗病毒治疗的主流方法,但长期使用会产生耐药。研究表明,NAs的不同反应性与HBV存在的准种现象有密切关系。本课题采用高通量的测序技术对准种进行大样本的检测,分析准种在NAs作用下的动力学变化,准种的模式组成、比例分布、进化规律等。从而找出具有预测价值的准种特征,建立基线预测的数学模型,更好的指导临床合理用药。. 首先,我们选择40例ADV治疗一年的CHB患者不同时间点DNA标本。PCR产物混匀进行454深度测序。然后,我们对原始序列进行处理,修正测序的错误。统计各个位点的碱基情况,计算香农熵,统计各个准种的情况,计算每个标本基因型的情况。统计并查看位点主要碱基的含量,找到了具有预测价值的11个位点,其预测准确率80%以上。. 另外,我们对基因型转换问题进行了研究,选择38例ADV治疗一年的病例,用HBV短序列窗口分型方法对所测序列进行基因分型。Sanger测序结果显示,38例病人中有13例发生基因型转换,且主要是C型到B型的转换。而深度测序结果显示,所有发生基因型转换的标本在ADV治疗前已经是B和C型混合感染。进一步用Solexa深度测序对165例临床标本检测其混合感染的情况,结果混合感染比例也很高。进一步分析表明混合感染是基因型转换的基础,选择压力是基因型转换的条件,而不同基因型对药物反应性的差异是基因型转换的关键。

项目成果

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专著数量(0)
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其他文献

抑制HBV核心启动子转录活性的化合物筛选与鉴定
  • DOI:
    10.16016/j.1000-5404.202101014
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    第三军医大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙瑜雪;魏霞飞;李杰;崔静;王瑜伟;胡接力
  • 通讯作者:
    胡接力

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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