组蛋白去甲基化酶PHF8调控线粒体稳态和细胞能量代谢的功能和分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31871319
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

PHF8 is a histone demethylase, which contains PHD zinc finger and JmjC domains. Mutations in PHF8 have been found in patients with X-linked mental retardation (XLMR), and its over-expression has been seen in many different cancer types. However, the molecular mechanisms underlying PHF8 regulation of cancer development remain incompletely understood. Aberrant energy metabolism is one of the hallmarks of cancers. Our preliminary data suggested that, when mTOR was highly active in cells, PHF8 repressed the transcription of mitochondrial respiratory chain complex and mitochondrial translation genes,which was tightly linked to its functional partner YY1. Therefore, the current proposed study will focus on investigating the molecular mechanisms through which PHF8 and YY1 sense cellular energy and repress gene transcription, maintaining mitochondrial homeostasis and cellular energy metabolism. We will also investigate the implication of such mechanisms in cancer development, such as kidney renal papillary cell carcinoma (KIRP). We aim to establish a regulatory axis composed of mTOR, PHF8 and YY1, gene transcriptional repression and cancer development, with PHF8/YY1 at its center. Finally, screening and optimization of small molecules targeting PHF8 enzymatic activity or the interaction between PHF8 and YY1, and further validation of their efficacy and specificity will be done by using cell- and animal-based cancer models. To summarize, our ultimate goal is to reveal the molecular mechanisms underlying PHF8 regulation of cancer, which could be potentially serving as a drug target for the prevention and treatment of cancer.
PHF8是一个含有PHD锌指和Jumonji C(JmjC)结构域的组蛋白去甲基化酶。PHF8突变与X-连锁智力迟缓综合症密切相关,其过表达也被报道和多种癌症密切相关,但其作用分子机制不甚明确。能量代谢的失调是癌症的重要特征之一。我们前期研究表明细胞内mTOR处于高活性状态下,PHF8抑制线粒体呼吸链复合体和线粒体翻译功能相关基因的转录,并且这种功能和其结合的转录因子YY1密切相关。基于此,本项目将集中研究PHF8/YY1功能性复合物感知能量水平,抑制基因转录,从而调控线粒体稳态和细胞能量代谢的分子机制,及其该分子机制在肿瘤发生发展中的应用。建立一条mTOR/PHF8/YY1---基因转录抑制---癌症发生发展的分子通道。项目后期将针对PHF8酶活性或者PHF8/YY1相互作用进行活性小分子筛选,并通过细胞和动物实验验证其有效性和特异性,为将来的药物开发奠定基础。

结项摘要

能量代谢失调是癌症的重要标志性特征之一。PHF8是一个含有PHD锌指和Jumonji C(JmjC)结构域的蛋白去甲基化酶,其过度表达被报道与多种癌症的发生发展密切相关,但其作用的分子机制还不完全清楚。本项目主要研究PHF8调控能量代谢参与癌症发生发展的功能和分子机制。在本项目中,我们发现PHF8在多种类型的癌症中异常过度表达,与线粒体电子呼吸链复合体(ETC)亚基的基因表达水平显著性负相关。在肿瘤细胞中异常高度表达的PHF8可以结合并去甲基化修饰转录因子YY1调控其染色质结合,从而抑制细胞核编码的线粒体电子呼吸链复合体基因转录、上调肿瘤细胞内线粒体活性氧水平,这种能量代谢异常导致的氧化应激最终推动了癌症的发生发展。此外,本项目也开发了靶向PHF8的干预小分子,证实该小分子可调节PHF8底物甲基化水平、ETC基因转录、线粒体氧化应激和多种PHF8临床相关癌症类型的肿瘤细胞增殖,利用细胞系和患者来源异种移植瘤生长实验初步证实了该干预分子的体内有效性和安全性。总体上,本项目的研究揭示了癌症细胞中线粒体ETC基因转录的一个表观遗传调控机制,表明靶向蛋白去甲基化酶PHF8具有治疗临床相关癌症的潜在应用价值。

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Virtual Screening with a Structure-Based Pharmacophore Model to Identify Small-Molecule Inhibitors of CARM1
使用基于结构的药效团模型进行虚拟筛选来识别 CARM1 小分子抑制剂
  • DOI:
    10.1021/acs.jcim.8b00610
  • 发表时间:
    2019-01
  • 期刊:
    Journal of Chemical Information and Modeling
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Ting Ran;Wenjuan Li;Bingling Peng;Binglan Xie;Tao Lu;Shuai Lu;Wen Liu
  • 通讯作者:
    Wen Liu
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  • DOI:
    10.1186/s12943-022-01539-3
  • 发表时间:
    2022-03-07
  • 期刊:
    Molecular cancer
  • 影响因子:
    37.3
  • 作者:
    Xue ST;Zheng B;Cao SQ;Ding JC;Hu GS;Liu W;Chen C
  • 通讯作者:
    Chen C
LncRNA LUCRC Regulates Colorectal Cancer Cell Growth and Tumorigenesis by Targeting Endoplasmic Reticulum Stress Response
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  • DOI:
    10.3389/fgene.2019.01409
  • 发表时间:
    2020-01-31
  • 期刊:
    FRONTIERS IN GENETICS
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Tang, Guo-Hui;Chen, Xue;Liu, Wen
  • 通讯作者:
    Liu, Wen
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表皮生长因子受体靶向嵌合抗原受体T细胞与CDK7抑制剂联合治疗三阴性乳腺癌
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Cancer Immunology Research (provisionally accepted)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Lin Xia;Zao-zao Zheng;Jun-yi Liu;Yu-jie Chen;Jian-cheng Ding;Guo-sheng Hu;Ya-hong Hu;Su-ling Liu;Wen-xin Luo;Ning-shao Xia;Wen Liu
  • 通讯作者:
    Wen Liu
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  • DOI:
    10.7150/thno.39241
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    THERANOSTICS
  • 影响因子:
    12.4
  • 作者:
    Peng, Bing-ling;Li, Wen-juan;Liu, Wen
  • 通讯作者:
    Liu, Wen

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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食管癌中长链非编码RNA编码的微蛋白的鉴定、功能、分子机制和靶向干预研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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