HPV感染亚型与宿主基因组整合区域的遗传变异在宫颈癌发病中的交互作用研究

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基本信息

  • 批准号:
    81502873
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

High-risk HPV infection has been recognized as the primary cause of cervical cancer. However, only a minority of infections finally lead to invasive cancer. Both HPV types and host genetic background have been demonstrated to influence the risk of cervical cancer. During the course of HPV infection, viral DNA can integrate into certain sites of host genome. By conducting high-throughput sequencing of cervical cancer, the latest research comprehensively identified HPV integration sites and proved that the genes within integration hot spots play a vital role in cervical cancer development. But it is not clear whether functional genetic variations in these critical genes modify cervical cancer risk after infection with certain HPV types. Using a two-stage case-control design, this study aims to systematically clarify the association of genetic variations in HPV integration hot spots with cervical cancer susceptibility, and to uncover the interaction between high-risk HPV types and genetic variations. Moreover, we will explore the biological mechanism of potential functional variations in cervical cancer. This study has important public health significance, the results of which will further reveal the pathogenesis of cervical cancer, discover new susceptibility markers for early risk-predication, and finally improve the targeted cervical cancer screening and prevention.
高危型HPV感染是导致宫颈癌的主要病因,但感染者中仅有少部分最终发生侵袭性肿瘤。研究证实,HPV感染亚型与宿主遗传背景差异均能够影响宫颈癌的发病风险。在HPV感染过程中,病毒DNA可整合入宿主基因组的特定区域,最新宫颈癌测序研究通过全面鉴定HPV整合位点,证明整合热点区域的基因在宫颈癌发生中起着至关重要的作用。然而,目前尚不明确这些关键基因功能性的遗传变异是否与宿主感染HPV后的成癌倾向存在关联,并与特定HPV亚型存在交互作用。本研究拟采用两阶段病例对照设计,系统阐明HPV整合热点区域遗传变异与宫颈癌易感性的关联,同时结合HPV分型结果揭示高危亚型与遗传变异在宫颈癌发生中的交互作用,并探讨潜在功能性遗传变异影响宫颈癌发病的生物学机制。本研究的实施将进一步阐明宫颈癌发生机制,发现新的宫颈癌易感性标志物,对提高宫颈癌早期风险预测能力,进而实施更有针对性的宫颈癌筛查及预防具有重要的公共卫生意义。

结项摘要

宫颈癌是严重威胁女性健康的主要恶性肿瘤之一,如何提高宫颈癌早期风险预测能力,从而实施更有针对性的宫颈癌筛查及防治是公共卫生的重要课题。本项目结合宫颈癌研究最新进展,构建了较大样本的宫颈癌生物标本库及临床数据库,搭建了中通量的遗传变异位点分型及HPV亚型/变异体检测技术平台,从而系统研究了中国人群基因组遗传变异(包括HPV整合区、长链非编码RNA区基因的潜在功能性SNP和线粒体拷贝数)、常见高危型HPV变异特征与宫颈癌发病风险的关联及潜在交互作用。 结果显示:HPV整合区基因RAD51B的两个潜在功能性SNP(rs936917和rs936918)可能影响miRNA结合RAD51B,从而降低宫颈癌的发病风险降低;长链非编码RNA基因HOTAIR rs35643724可能影响其基因表达水平增加宫颈癌风险,而MALAT-1 rs1787666则降低其发病风险;研究明确了四种主要感染型别HPV16、18、52和58,证实HPV16的致癌性强于其他型别;进一步对HPV16进行变异体检测,发现中国女性主要感染欧洲型和亚洲型变异体,其中亚洲型相比欧洲型具有更强的致癌能力;在HPV阳性的病例对照中检测线粒体拷贝数,并与宫颈癌进行关联分析,发现线粒体拷贝数的增加与宫颈癌发病相关,呈剂量依赖效应;在调整HPV感染型别后,其关联仍具有统计学意义,是潜在的新型生物标志物。本项目研究结果有助于在高危型HPV感染人群中,综合利用病毒变异和宿主遗传标志物对HPV感染者诊断分流,进一步筛选高危人群和易感个体,为实现宫颈癌早期风险的精确预测及预防关口前移提供重要理论依据。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic variants within the cancer susceptibility region 8q24 and ovarian cancer risk in Han Chinese women.
中国汉族女性癌症易感区 8q24 内的遗传变异与卵巢癌风险。
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.16861
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Han Jing;Zhou Jing;Yuan Hua;Zhu Longbiao;Ma Hongxia;Hang Dong;Li Dake
  • 通讯作者:
    Li Dake
Effects of potentially functional polymorphisms in suppressor of cytokine signaling 3 (SOCS3) on the risk of head and neck squamous cancer.
细胞因子信号传导抑制因子 3 (SOCS3) 的潜在功能多态性对头颈鳞状癌风险的影响。
  • DOI:
    10.1111/jop.12539
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Oral Pathology & Medicine
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Hang Dong;Yin Yin;Wang Lihua;Yuan Hua;Du Jiangbo;Zhu Meng;Dai Juncheng;Chen Ning;Hu Zhibin;Shen Hongbing;Ma Hongxia
  • 通讯作者:
    Ma Hongxia
Human papillomavirus in semen and the risk for male infertility: a systematic review and meta-analysis.
精液中的人乳头瘤病毒和男性不育的风险:系统评价和荟萃分析。
  • DOI:
    10.1186/s12879-017-2812-z
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    BMC Infectious Diseases
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Lyu Zhangyan;Feng Xiaoshuang;Li Ni;Zhao Wei;Wei Luopei;Chen Yuheng;Yang Wenjing;Ma Hongxia;Yao Bing;Zhang Kai;Hu Zhibin;Shen Hongbing;Hang Dong;Dai Min
  • 通讯作者:
    Dai Min
Expression quantitative trait loci in long non-coding RNA PAX8-AS1 are associated with decreased risk of cervical cancer
长非编码RNA PAX8-AS1的表达数量性状位点与宫颈癌风险降低相关
  • DOI:
    10.1007/s00438-016-1217-9
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Molecular Genetics and Genomics
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Han Jing;Zhou Wen;Jia Meiqun;Wen Juan;Jiang Jie;Shi Jufang;Zhang Kai;Ma Hongxia;Liu Jibin;Ren Jiansong;Dai Min;Hu Zhibin;Hang Dong;Shen Hongbing;Li Ni
  • 通讯作者:
    Li Ni
Analysis of human papillomavirus 16 variants and risk for cervical cancer in Chinese population
人乳头瘤病毒16型变种与中国人群宫颈癌风险分析
  • DOI:
    10.1016/j.virol.2015.11.016
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Virology
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Hang Dong;Yin Yin;Han Jing;Jiang Jie;Ma Hongxqia;Hu Zhibin;Shen Hongbing;Xie Shuanghua;Feng Xiaoshuang;Dai Min;Li Ni;Zhang Kai;Hu Zhibin;Shen Hongbing;Clifford Gary M.;Li N
  • 通讯作者:
    Li N

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环状RNA在宫颈癌发生发展中作用的研究进展
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    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
    中华医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙玮;李江;杨卓煜;郑亚迪;吴峥;温艳;杭栋;李霓
  • 通讯作者:
    李霓

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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