淀粉样肽聚集机制的计算机模拟研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    10674029
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    32.0万
  • 负责人：
    韦广红
  • 依托单位：
    复旦大学
  • 学科分类：
    A2014.凝聚态物理新兴与交叉领域
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

淀粉样肽是一类在一定条件下发生异常折叠、聚集而形成不溶于水的淀粉样纤维的多肽或蛋白质。淀粉样纤维沉积是许多人类疾病的重要特征。研究表明，淀粉样肽的聚集导致了细胞毒性，而具有毒性的聚集体很可能是淀粉样纤维以及在聚集早期形成的寡聚体。由于淀粉样肽聚集跟多种疾病有关，从而成为当今科学研究中的前沿课题之一。然而，由于淀粉样纤维的形成过程非常复杂，涉及到各种各样的淀粉样形貌和低聚体中间态，所以其形成机制尚不清楚。本课题将用有效搜索蛋白质构象空间的方法- - Activation Relaxation Technique和并行温度分子动力学模拟,分别结合简化的蛋白质模型及全原子蛋白质模型来研究淀粉样肽的聚集问题。通过分析聚集过程中形成的寡聚体的结构特征、寡聚体的组装路径、淀粉样纤维的生长模式、氨基酸序列以及温度对聚集的影响等，来认识和探索淀粉样纤维形成的分子机制。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Effects of the RGTFEGKF Inhibitor on the Structures of the Transmembrane Fragment 70-86 of Glycophorin A: An All-Atom Molecular Dynamics Study
RGTFEGKF 抑制剂对血型糖蛋白 A 跨膜片段 70-86 结构的影响：全原子分子动力学研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Self-assembly of amyloid-forming peptides using molecular dynamics simulations
使用分子动力学模拟自组装淀粉样蛋白形成肽
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
The (-strand-loop-(-strand conformation is marginally populated in (2-microglobulin (20-41) peptide in solution as revealed by replica exchange molecular dynamics simulations
复制品交换分子动力学模拟显示，溶液中的 (2-微球蛋白 (20-41) 肽中存在少量的 (-链-环-(-链构象)
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Thermodynamics and dynamics of amyloid peptide oligomerisation are sequence dependent
淀粉样肽寡聚化的热力学和动力学依赖于序列
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 作者：
  • 通讯作者：

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其他文献

富勒烯与β淀粉样肽低聚体结合的分子动力学模拟
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Acta Physico - Chimica Sinica
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周晓颖;郗文辉;韦广红
  • 通讯作者：
    韦广红

其他文献

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韦广红的其他基金

ALS相关蛋白低复杂度结构域多肽自组装和相分离的分子模拟研究
  • 批准号：
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    面上项目
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    面上项目
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    37.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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