新型离子通道TehA突变体结构及其新颖门控机制的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470728
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    85.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Membrane proteins, embedded in the membrane, play important roles in diverse cellular functions. Recently, we determined a 1.2 ? resolution crystal structure of the bacterial TehA. Based on systematically analyses on the protein sequences, we discovered a family of novel anion channel, including the recent identified SLAC1. SLAC1 plays a central role in initiating stomatal closure in response to a wide range of environmental stress. This study shed new insight into the understanding of the SLAC1 function, based on the analysis of TehA structure. The current TehA structure snapshot a closed state of an ion channel, and the high resolution structural information revealed that the channel gate adopted a high energetic conformation. This finding, together with functional analysis, led to a novel gating mechanism for this family of novel anion channel, which needs further follow-up studies to confirm. In our preliminary study, we identified some interesting TehA mutants with possible open pore, as evidenced by their large conductance in the electrophysiological analysis on Xenopus oocyte. We plan to explore the novel gating mechanism through structural analysis on the open pore mutant of TehA. In addition, we aim to use TehA as a model to understand the different effect of detergent on the membrane protein crystallization and explore the possibility of using the bound Br- ion for phasing. The findings will be useful to understand the novel gating mechanism of a family of novel anion channel and shed light to the understanding the SLAC1 function.
膜蛋白是一类嵌在生物膜的蛋白质, 在各种各样生命活动中扮演了不同的角色,执行着重要的生物学功能。最近,我们解析了细菌膜蛋白TehA的1.2埃高分辨率的晶体结构,通过生物信息学分析发现了一类新型的离子通道,包括最近在植物中发现的响应胁迫应答过程中直接启动气孔关闭的SLAC1分子。该结构处于处于关闭状态的构象,但是高分辨率的结构细节揭示该离子通道的门处于不稳定的高能量状态,具有一种新颖的门控机制。我们在初步研究中发现了可能处于开放状态构象的突变体。本项目拟通过解析其突变体的晶体结构来进一步探索该类新型离子通道新颖的门控机制。此外,本项目还计划以TehA为模型蛋白,探索膜蛋白结晶的规律和卤素离子在膜蛋白相位求解中的应用,争取获得膜蛋白结构生物学研究方法上的突破。该项目的完成不仅能有助于深入认识新型膜蛋白离子通道的结构-功能,还将为理解在植物SLAC1分子作用机理提供重要信息。

结项摘要

项目成果

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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