基于MCMC算法的贝叶斯建模研究儿童接种流感疫苗的直接和间接效果

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81903373
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3009.传染病流行病学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Seasonal influenza (hereinafter refer to influenza) is associated with a substantial disease burden among children in China. Vaccination is the most effective method for prevention, but influenza vaccine is not covered by National Immunization Programme in China and the cost of vaccination is completely borne by the vaccinees. Currently, the uptake rate is only 2%. No systematic studies have addressed the questions with regards to transmission mechanism of influenza, and the direct and indirect effects of children vaccination programme at the population level in China, which could be one of the key bottlenecks for policy-making on vaccination. Using the Markov chain Monte Carlo method based on Bayesian theoretical framework, the proposed research is designed to clarify the transmission mechanism of influenza by developing Susceptible-Exposed-Infectious-Recovered transmission dynamic model. Then we will evaluate the direct and indirect effects of vaccination programme in children in these areas where free vaccination is available, and further explore the direct and indirect effects if such programme are gradually expanded to other areas and the whole country. This study aims to estimate the key epidemiological parameters of influenza, and quantify the impact of influenza vaccination programme in children on the disease burden of influenza among themselves and other age groups. It is believed that the deliverables of this research would provide scientific evidences for national and local policy-makers on influenza immunization strategy in children.
季节性流感(简称"流感")对我国儿童健康危害严重。接种疫苗是最有效的预防手段,但流感疫苗尚未纳入我国免疫规划,需公众自费接种,目前接种率仅2%。我国流感传播动力学机制,及儿童接种疫苗在人群层面的直接和间接保护效果尚缺乏系统、深入的研究,成为制定免疫策略的核心瓶颈之一。本研究通过构建“易感-暴露-感染-康复”传播动力学模型,结合基于马尔科夫链蒙特卡洛算法的贝叶斯方法,开展我国流感传播动力学机制研究;在此基础上,针对已为儿童提供免费接种的典型地区,定量测算疫苗接种在人群层面的直接和间接效果;进一步估计逐步将儿童免费接种推广到其他有条件地区以及全国的直接和间接效果。本研究将回答我国流感传播动力学关键参数,儿童接种流感疫苗对自身及其他人群的流感疾病负担的影响等关键科学问题。研究结果可为国家/地方政府制定儿童流感疫苗免疫策略提供直接科学证据。

结项摘要

我国儿童流感疾病负担严重。接种疫苗是最有效的预防手段,但流感疫苗尚未纳入我国免疫规划,需公众自费接种,接种率极低(<5%)。我国流感传播动力学机制及儿童接种疫苗在人群层面的直接和间接保护效果尚缺乏系统、深入的研究,成为制定免疫策略的核心瓶颈之一。本项目系统收集和整理了长时间序列的多源数据,包括全国和各省流感样病例监测数据和病原学监测数据、流感相关的高危人群比例、流感疾病负担、流感疫苗的效力/效果等,构建了研究数据库。在此基础上,构建“易感-暴露-感染-康复”传播动力学模型;采用基于马尔科夫链蒙特卡洛算法的贝叶斯方法整合多源数据,测算出北京、上海和广东等地流感病毒传播力和对不同年龄组人群的易感性,阐明了我国流感病毒在人群传播的机制。最后,基于传播动力学和疾病负担模型,阐明了典型地区(即北京)在目前6月龄-14岁儿童流感疫苗免费接种情境下产生的直接和间接保护效果,然后进一步评估了上海和广东将6月龄-14岁儿童流感疫苗纳入免疫规划产生的直接和间接保护效果。以上研究结果加深了对流感病毒在人群中传播流行和其导致的严重疾病负担的科学认识,并定量测算了将儿童流感疫苗纳入国家免疫规划的直接和间接保护效果,可为流感防控尤其是制定流感疫苗免疫策略提供科学依据。本项目共发表中英文论文6篇(第一或通讯作者/含共同),包括SCI论文3篇;其中4篇本项目为第一标注。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Estimating mortality associated with seasonal influenza among adults aged 65 years and above in China from 2011 to 2016: A systematic review and model analysis.
2011-2016年中国65岁及以上成年人季节性流感死亡率估算:系统评价和模型分析
  • DOI:
    10.1111/irv.13067
  • 发表时间:
    2023-01
  • 期刊:
    INFLUENZA AND OTHER RESPIRATORY VIRUSES
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Dong, Kaige;Gong, Hui;Zhong, Guangjie;Deng, Xiaowei;Tian, Yuyang;Wang, Minghan;Yu, Hongjie;Yang, Juan
  • 通讯作者:
    Yang, Juan
[Estimating the disease burden of seasonal influenza in China, 2006-2019].
  • DOI:
    10.3760/cma.j.cn112137-20201210-03323
  • 发表时间:
    2021-03-02
  • 期刊:
    Zhonghua yi xue za zhi
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Gong, H;Shen, X;Yu, H J
  • 通讯作者:
    Yu, H J
Assessing vaccination coverage, timeliness, and its temporal variations among children in a rural area in China
评估中国农村地区儿童的疫苗接种覆盖率、及时性及其时间变化
  • DOI:
    10.1080/21645515.2020.1772620
  • 发表时间:
    2020-07-04
  • 期刊:
    HUMAN VACCINES & IMMUNOTHERAPEUTICS
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    He, Yangni;Liu, Yang;Yu, Hongjie
  • 通讯作者:
    Yu, Hongjie
中国60岁及以上老年人接种四价流感疫苗的成本效果分析
  • DOI:
    10.3760/cma.j.cn112137-21210123-00224
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中华医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    严涵;杨娟;陈志元;龚慧;钟广洁;余宏杰
  • 通讯作者:
    余宏杰
促进老年人季节性流感疫苗接种专家共识
  • DOI:
    10.3760/cma.j.cn112137-20201209-03314
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中华医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    中华预防医学会流感预防控制工作委员会
  • 通讯作者:
    中华预防医学会流感预防控制工作委员会

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基于主成分分析的河南省粮食产量影响因素研究
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  • 作者:
    宋洪涛;姚海江;莫雨平;赛音朝克图;唐银杉;许安萍;杨娟;李志刚
  • 通讯作者:
    李志刚

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基于贝叶斯层次模型在纵向队列中研究流感病毒感染的血清流行病学特征及抗体动力学机制
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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