车前子来源阿拉伯木聚糖溶液构象表征及计算机分子模拟

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21564007
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0309.高分子物理与高分子物理化学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Three dimensional structure and conformation of polysaccharide in solution have great effects on its bioactivities. It is significant to elucidate the relationship between polysaccharide structure and its conformational characteristics clearly and scientifically. Plantain seeds could be both used as medicine and food, and are rich in polysaccharide of arabinoxylan. However, previous researches could not explain the gut health improving bioactivities of the polysaccharide from structural and conformational aspects. Seeds of Plantago asiatica L. are widely sown in Ji’an and Yi’chun rural areas in Jiangxi Province. According to previous studies in our lab, polysaccharide from seeds of Plantago asiatica L., mainly consisted of arabinose and xylose, is to be subjected for analysis in this research. Polysaccharide primary chain or branched chain is hydrolyzed by special enzyme or other methods to get sub-fractions, which would be purified if necessary. Then, HPSEC, dynamic and static light scattering and atomic force microscope are applied to characterize the polysaccharides conformational properties. Their fine structure are determined by currently structural characterization methods of polysaccharide, such as methylation, partial acid hydrolysis and NMR, etc. According to changes of polysaccharide in structure and conformation before and after degradation, effects of primary chain or branched chain on conformational characteristics of the polysaccharide would be concluded. Finally, molecular simulation by computer is applied to construct polysaccharide structure, and the conformation characteristics would be calculated and obtained. This research is aimed at acquiring useful information of relationship between structure and conformational characteristics of arabinoxylan from Plantain seeds. Results would help us to understand mechanism of the polysaccharide in improving gut health from structural and conformational aspects. At the same time, the system of analyzing methods would also guide researches on structural and conformational analysis of polysaccharide from other resources.
多糖在溶液中的空间三维结构和构象对其生物功能有重要影响,科学阐明多糖结构与溶液构象对应关系具有很强的科学意义。车前子属于药食两用资源,富含阿拉伯木聚糖,但其发挥良好肠道功能活性的物质结构、构象基础还不清楚。江西省吉安、宜春盛产大粒车前子,本课题拟在前期研究基础上,以大粒车前子多糖为研究对象,通过酶法水解等技术特异性水解多糖主链或支链,获得降解后多糖片段,利用HPSEC、动静态光散射仪、原子力显微镜结合现代多糖结构表征方法解析多糖构象、结构特征,通过比较水解前后车前子多糖结构、构象变化,分析多糖主链、支链结构对其构象特征的影响。并利用计算机分子模拟技术构建上述多糖,模拟计算构象参数。通过本研究,将构建信息较为齐全的车前子来源阿拉伯木聚糖的结构和溶液构象特征对应关系数据库,从而为从结构、构象角度探讨车前子多糖肠道功能活性的物质基础提供数据参考,同时也为其他来源多糖的结构与构象关系研究提供借鉴。

结项摘要

多糖在溶液中的空间三维结构和构象对其生物功能有重要影响,阐明多糖结构与溶液构象对应关系具有很好的科学意义。本课题在前期研究基础上,以大粒车前子多糖为研究对象,通过三氟乙酸水解、草酸水解等技术降解多糖,获得降解后多糖片段,利用HPSEC、原子力显微镜结合现代多糖结构表征方法探索多糖结构对其构象特征的影响,并利用计算机模拟技术进行验证。典型的大粒车前子多糖为阿拉伯木聚糖类多糖,主链由β-1,4-linked Xylp构成,高度分支化,阿拉伯糖分布在其侧链上。大粒车前子多糖呈现明显的半柔顺、线性链构象特征,侧链基团对多糖链的刚性强度有重要影响,减少侧链取代基团将增强车前子阿拉伯木聚糖链的刚性强度。进一步结合计算机模拟技术,发现阿拉伯糖侧链的分支位置对多糖构象性质有很大影响,当主链β-1,4-Xylp残基上的O-2或者O-2、O-3同时发生取代时,能显著降低阿拉伯木聚糖链的刚性强度;当主链β-1,4-Xylp残基上的O-2、O-3同时发生取代时,Ara残基数量越多,阿拉伯木聚糖的刚性结构越弱。通过本研究,构建了信息较为齐全的车前子来源阿拉伯木聚糖的结构和溶液构象特征对应关系数据,从而为阿拉伯木聚糖类多糖的结构与构象关系研究提供借鉴。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Fractionation, physicochemical properties and structural features of non-arabinoxylan polysaccharide from the seeds of Plantago asiatica L.
车前子种子中非阿拉伯木聚糖多糖的分级、理化性质及结构特征。
  • DOI:
    10.1016/j.foodhyd.2015.11.011
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Food Hydrocolloids
  • 影响因子:
    10.7
  • 作者:
    Jun-Yi Yin;Jun-Qiao Wang;Hui-Xia Lin;Ming-Yong Xie;Shao-Ping Nie
  • 通讯作者:
    Shao-Ping Nie
Consecutive and progressive purification of food-derived natural polysaccharide: Based on material, extraction process and crude polysaccharide
食品源天然多糖的连续渐进纯化:基于原料、提取工艺和粗多糖
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Trends in Food Science & Technology
  • 影响因子:
    15.3
  • 作者:
    Wei Tang;Dan Liu;Jun-Yi Yin;Shao-Ping Nie
  • 通讯作者:
    Shao-Ping Nie
A review on promoting structure research of polysaccharide from natural resources
促进自然资源多糖结构研究进展
  • DOI:
    10.1098/rsos.170077
  • 发表时间:
    2017-08
  • 期刊:
    Science Foundation in China
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Muir RE;Arredondo-Galeana A;Viola IM
  • 通讯作者:
    Viola IM
脱除阿魏酸后车前子多糖的溶液性质、构象特征及固体形貌
  • DOI:
    10.7503/cjcu20150513
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    高等学校化学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    殷军艺;刘晓莹;聂少平;谢明勇
  • 通讯作者:
    谢明勇
食源性多糖结构和生理功能研究概述
  • DOI:
    10.16429/j.1009-7848.2018.12.001
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国食品学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    聂少平;唐炜;殷军艺;谢明勇
  • 通讯作者:
    谢明勇

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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    殷军艺;聂少平;李昌;谢明勇
  • 通讯作者:
    谢明勇

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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