复杂全原子核酸结构的紧束缚离子模型研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    10844007
  • 项目类别：
    专项基金项目
  • 资助金额：
    10.0万
  • 负责人：
    谭志杰
  • 依托单位：
    武汉大学
  • 学科分类：
    A2012.液态、准晶与非晶态物理
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2009-12-31

项目摘要

核酸分子带有高密度的负电荷，其折叠会导致强烈静电排斥作用。溶液中的阳离子可以中和核酸的负电荷，从而调节核酸折叠中的静电能量。因此，离子在核酸折叠中起着至关重要的作用。现存主要有两种理论处理核酸离子相互作用，一是离子凝聚理论，其基于线电荷结构模型，不能处理具有实际结构的核酸分子；另一种是泊松-波尔兹曼理论，其基于平均场近似，忽略了离子分布涨落和关联作用，而此效应非常重要，尤其对高价离子。为了考虑此重要的复杂效应，我们发展了紧束缚离子(TBI)模型, 与广泛实验的比较得出，此模型能较好的描述钠、镁离子对核酸双链、发夹式结构稳定性和双链排列的影响。然而，此TBI模型是基于简化颗粒核酸结构，为了研究更复杂的核酸结构，比如HIV-1复合体等，我们必须继续发展TBI模型来处理复杂的全原子核酸分子。我们将结合大量的实验数据，用全原子TBI模型来系统的研究离子溶液中复杂结构核酸分子的热力学性质。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）

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其他文献

大分子拥挤下核酸单链的结构性质
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘凯吉;王凤华;谭志杰
  • 通讯作者：
    谭志杰
电解沉积的分形维数与ZnSO4溶液浓度的关系
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    武汉大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    沙晶;张泽兰;谭志杰;汪大海;黄清安;邹宪武
  • 通讯作者：
    邹宪武
电流变换的频率响应
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
    武汉大学学报
  • 影响因子：
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  • 作者：
    谭志杰;邹宪武
  • 通讯作者：
    邹宪武

其他文献

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谭志杰的其他基金

RNA-RNA复合体三维结构、稳定性及其中离子效应预测的物理建模
  • 批准号：
    12375038
  • 批准年份：
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  • 资助金额：
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网络空间中粒子的运动和聚集
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    10274056
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  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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  • 批准号：
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  • 批准年份：
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  • 项目类别：
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相似海外基金

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  • 财政年份：
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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