LIN28/let-7通路关键基因遗传变异与肾母细胞瘤易感性及其机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81803320
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Wilms tumor (WT) is the most common urologic cancer in children and associated with the genetic variation of genes. Previous research indicated that LIN28/let-7 pathway is involved in the occurrence of WT. Our latest study found that the LIN28B gene rs314276 C>A polymorphism was significant associated with WT susceptibility in Southern Chinese population. Besides, the different genotypes of rs314276 C>A were associated with significantly mRNA and protein expression alteration of LIN28B. We hypothesize that genetic variations of key genes in LIN28/let-7 pathway may cause abnormal signaling pathways regulating and lead to WT occurrence. We will perform a hospital-based case-control study with the purpose to determine whether the potentially functional polymorphisms in LIN28/let-7 pathway core genes are associated with WT risk in Chinese children. Further functional assay analyses will be applieded to study the role of SNPs in the control of gene transcription. We will verify the research findings through the level of molecule, cell and tissue. This study may reveal the biological mechanism of core genes of the LIN28/let-7 pathway in the development of WT and provide biomarkers and theoretical basis for the prevention and treatment for WT.
肾母细胞瘤(WT)是儿童泌尿系统中常见的恶性肿瘤,其发病与基因的遗传变异有关。最新研究报道,LIN28/let-7信号通路参与WT的发生发展。我们前期研究发现该通路LIN28B基因转录因子结合位点的rs314276C>A改变与WT发病风险显著相关,且该位点不同基因型之间mRNA和蛋白表达存在显著差异。我们提出假说:该通路关键基因的遗传变异可能引起基因表达异常,进而信号通路调控异常,最终导致WT的发生。本项目拟采用病例-对照研究方法,进一步评价该信号通路关键基因具有潜在生物学功能的遗传变异与WT发病风险的关系,探讨遗传变异对基因表达的影响,针对位点的潜在生物学功能,从分子、细胞、组织水平进行功能验证,阐明该通路关键基因遗传变异与WT发生的机制。本项目的完成,对揭示LIN28/let-7信号通路关键基因参与WT发生的分子遗传学机制具有重要意义,并为WT个体化预防和治疗提供新的线索及理论依据。

结项摘要

肾母细胞瘤是儿童泌尿系统中常见的恶性肿瘤,其发病与基因的遗传变异有关。最新研究报道,LIN28/let-7信号通路参与肾母细胞瘤的发生发展。我们采用病例-对照研究的方法,于四个中心合计355例肾母细胞瘤患者以及1070例对照中研究LIN28/let-7通路6个关键基因(LIN28A、LIN28B、HMGA2、C-MYC、NRAS、KRAS)合计18个单核苷酸多态性(SNP)位点与肾母细胞瘤易感性的关系,并进行后续的相关数据分析处理以及一定的功能实验。我们发现:(1)LIN28A基因rs3811463T>C和rs34787247 G>A多态性改变与肾母细胞瘤易感性增加有关。拥有1个危险基因型的个体和拥有1-3个危险基因型的个体发病风险增加。拥有1-3个危险基因型的个体与大于18月龄、女性、男性以及临床I期+II期患者发病风险增加有关。(2)LIN28B基因rs314276 C>A的多态性改变与肾母细胞瘤的发病风险呈负相关。携带1-4个危险基因型者发病风险显著上升。rs314276CA/AA基因型携带者在大于18月龄、男性以及临床I期和II期患者中具有更显著的保护性。携带1-4个危险基因型个体在18月龄以下、男性以及临床I期和II期患者中具有显著的危险作用。(3)KRAS基因rs12587 G>T多态性改变与肾母细胞瘤的发病风险呈正相关。拥有1-3个KRAS危险基因型个体的发病风险增加。rs12587 GT/TT基因型携带者在大于18月龄患者中具有更显著的危险性。(4)所选HMGA2基因SNPs的多态性改变与肾母细胞瘤易感性无显著关联。但分层分析中,rs968697TC/CC基因型携带者在男性患者中具有显著的危险性。拥有1-3个保护基因型个体在女性患者中降低肾母细胞瘤的发病风险。(5)所选CYMC基因SNPs的多态性与肾母细胞瘤发病风险无显著相关性。以上阳性结果位点在其他单位样本中进一步证实后有望作为肾母细胞瘤早期筛查的指标,用于中国儿童肾母细胞瘤的早期筛查。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
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专利数量(0)
Investigation of association between LINC00673 rs11655237 C > T and Wilms tumor susceptibility
LINC00673 rs11655237 C > T 与肾母细胞瘤易感性之间的关联研究
  • DOI:
    10.1002/jcla.22930
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Clinical Laboratory Analysis
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Gao Xiaofeng;Jia Wei;Zhu Jinhong;Fu Wen;Zhu Shibo;Xia Huimin;He Jing;Liu Guochang
  • 通讯作者:
    Liu Guochang
Association between PHOX2B gene rs28647582 T>C polymorphism and Wilms tumor susceptibility
PHOX2B基因rs28647582 T>C多态性与肾母细胞瘤易感性的关系
  • DOI:
    10.1042/bsr20192529
  • 发表时间:
    2019-10-18
  • 期刊:
    BIOSCIENCE REPORTS
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Lin, Ao;Fu, Wen;He, Jing
  • 通讯作者:
    He, Jing
LINC00673 rs11655237 C>T and susceptibility to Wilms tumor: A five-center case-control study
LINC00673 rs11655237 C>T 与肾母细胞瘤的易感性:五中心病例对照研究
  • DOI:
    10.1002/jgm.3133
  • 发表时间:
    2019-12-16
  • 期刊:
    JOURNAL OF GENE MEDICINE
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Li, Suhong;Lin, Ao;He, Jing
  • 通讯作者:
    He, Jing
METTL3polymorphisms and Wilms tumor susceptibility in Chinese children: A five-center case-control study
中国儿童METTL3多态性与肾母细胞瘤易感性:五中心病例对照研究
  • DOI:
    10.1002/jgm.3255
  • 发表时间:
    2020-08-07
  • 期刊:
    JOURNAL OF GENE MEDICINE
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Lin, Ao;Zhou, Mingming;He, Jing
  • 通讯作者:
    He, Jing
ALKBH5 gene polymorphisms and Wilms tumor risk in Chinese children: A five-center case-control study
中国儿童ALKBH5基因多态性与肾母细胞瘤风险:五中心病例对照研究
  • DOI:
    10.1002/jcla.23251
  • 发表时间:
    2020-02-24
  • 期刊:
    JOURNAL OF CLINICAL LABORATORY ANALYSIS
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Hua, Rui-Xi;Liu, Jiabin;Zhuo, Zhenjian
  • 通讯作者:
    Zhuo, Zhenjian

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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