不同马铃薯品种对PSTVd症状差异应答的分子机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31672002
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    65.0万
  • 负责人：
    迟胜起
  • 依托单位：
    青岛农业大学
  • 学科分类：
    C1401.植物病理学
  • 结题年份：
    2020
  • 批准年份：
    2016
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Potato spindle tuber viroid (PSTVd) is an important restriction factor in potato production. Previous studies showed that there were obvious differences of symptom among the different potato varieties infected by PSTVd, and the mechanism of the cause of the differences was not clear. This project aims to screen and identify differential expressed genes by obtaining transcriptome data using RNA-Seq technique and by confirming sRNA changes before and after inoculated by PSTVd with bioinformatics method. Differential target genes will be clarified by comparing differences of the gene changes in different potato varieties using qRT-PCR technique. Biological functions of relevant target genes during PSTVd infection will be verified by RNAi technique in order to explain the mechanism of differential responses among different potato varieties infected by PSTVd and to lay the foundation for the integrated control and breeding of potatoes for the disease resistance to PSTVd.
马铃薯纺锤块茎类病毒（PSTVd）是马铃薯生产中的重要制约因子，前期研究发现，不同马铃薯品种受到PSTVd侵染后症状表达存在明显差别，引起这种差别的分子机理目前尚不清楚。本项目拟在前期基础上，围绕不同马铃薯品种对PSTVd侵染的症状差异这一问题，通过RNA-Seq技术获取不同马铃薯品种接种PSTVd前后的转录组数据，应用生物信息学方法明确接种前后变化显著的小分子RNA（sRNA）和mRNA，筛选并鉴定引起sRNA变化的差异表达基因；通过qRT-PCR检测比较不同品种在PSTVd侵染后基因变化差异，明确差异靶标基因；结合RNAi等技术验证相关靶标基因在PSTVd侵染马铃薯过程中的生物学功能，阐明不同马铃薯品种对PSTVd症状差异应答的分子机制，以期为PSTVd的综合防控和抗PSTVd育种提供科学依据。

结项摘要

马铃薯纺锤块茎类病毒（potato spindle tuber viroid, PSTVd)是影响马铃薯生产中的一类病原生物，是我国的对外检疫对象，也是马铃薯生产的重要制约因子，不仅引起马铃薯产量的重大损失，同时还造成马铃薯块茎裂纹或呈纺锤形，严重影响马铃薯的商品价值，既能通过植株接触传播，又能通过块茎、种子、花粉等传播，且不能通过茎尖脱毒去除，一旦感染很难防除。.本研究明确了PSTVd的接种方法和PSTVd的qRT-PCR检测方法，获得了不同马铃薯品种的PSTVd病健组培苗材料，明确了PSTVd在不同马铃薯品种中的症状特点及当代和继代组培苗不同部位的表达差异；构建了PSTVd不同致病性的克隆化载体，为后续基因功能的研究与PSTVd的致病机制研究奠定了基础；对5个不同马铃薯品种PSTVd病健材料不同时期的转录组进行了RNA-seq数据分析，发现5个不同马铃薯品种PSTVd病健差异表达基因1033个；重点选取了在五个品种唯一都高表达的RPP13基因，开展了其在不同马铃薯品种PSTVd处理病健组培苗的实时表达研究，初步验证了RPP13基因在不同马铃薯品种PSTVd病健组培苗、匍匐茎和块茎中差异表达，现在正在进行其在不同马铃薯品种病健材料中敲除和过表达时的症状表现差异，同样选取获得其他差异表达基因的功能研究也在进行中；通过qRT-PCR对不同马铃薯品种共同发生变化的差异靶标基因进行实时表达验证，结合RNAi和过表达等技术对这些靶标相关基因的功能研究，对于解析不同马铃薯品种对PSTVd的症状差异奠定了条件，对于不同马铃薯品种对PSTVd症状差异应答的分子机制的研究具有重要作用，研究结果为PSTVd的综合防控和抗PSTVd育种提供科学依据，对当前的马铃薯生产具有重要的实践意义。

项目成果

期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

云南琵琶甲化学成分的抑菌活性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    云南大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李蕾;迟胜起;李文鹏等
  • 通讯作者：
    李文鹏等
暗球腔菌属三个中国新记录种
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    菌物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    迟胜起;李秀岚;尹德彩;路炳声
  • 通讯作者：
    路炳声
核基质结合区对马铃薯Y病毒全长
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    植物病理学报，2005，35（4）：345－351
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    迟胜起;宋云枝;朱常香;温孚江
  • 通讯作者：
    温孚江
透孢黑团壳属的三个中国新记录种
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    菌物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    管晓辉;迟胜起;李秀岚;路炳声
  • 通讯作者：
    路炳声

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码