趋化受体MCP2201介导的趋化激活和抑制的机理研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:31870037
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C0103.微生物组学与代谢
- 结题年份:2022
- 批准年份:2018
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2019-01-01 至2022-12-31
- 项目参与者:周楠; 汪云浩; 朱海珍; 王语婧;
- 关键词:
项目摘要
The mechanism how bacterial chemoreceptors work is one of the most interesting questions in the study of molecular biology, microbiology and so on. Based on chemoreceptors binding ligand or not, some two-state transmembrane signaling models, e.g. rotation and piston models, have been proposed. In our previous study, bacterial chemoreceptor MCP2201 existed in three different states, i.e., ligand-free, attractant-bound inhibitor-bound forms, and was classified to chemoreceptor clusters of orthologous groups 2 (COG2). COG2 need a potential chemoreceptor array adaptor protein CheV to function optimally, lack of enough study, and significantly distinguished itself from those well-studied chemoreceptors, such as Tar and Tsr. We determined the ligand binding domain (LBD) of MCP2201 in its ligand-free form, which exists as a dimer similar to LBD of Tar and Tsr. Strikingly, the attractant-bound LBD exists as a trimer that has never been reported. Further, we found that MCP2201 could present different oligomeric organizations in three states. These results indicate that MCP2201 represents a class of chemoreceptors with novel mechanisms, which may transduce signals via the alternation of LBD oligomerization. Here, we plan to study the conformational change, CheA kinase activity regulation, methylation levels and so on of MCP2201 in three states via biophysical, biochemical and structural assays, to reveal the transmembrane signaling mechanism and movement regulation mechanism and to explore the common mechanism between MCP2201 and other well-studied chemoreceptors.
细菌趋化受体的机制研究是分子生物学和微生物学最为活跃的领域之一。基于趋化受体结合配体前后的双状态,研究人员提出了一系列跨膜信号传递的双状态或动态模型。我们针对具有天然、吸引剂结合和抑制剂结合三种状态的趋化受体MCP2201的研究表明其属于与连接蛋白CheV的分布关联且研究较少的COG2群体,显著区别于研究较多的双状态的Tar等。晶体结构显示其配体结合域天然状态具有与已知趋化受体相同的二聚组装,但其与吸引剂的复合物呈现一种新颖三体结构。进一步我们发现其三种状态均呈现不同的寡聚组装。这些结果表明MCP2201代表一类具有新机制的受体,可能通过配体结合域寡聚组装的变化将不同化学物质的信号传递至胞内。我们拟利用生物物理、生物化学、结构生物学等研究MCP2201全长或结构域多种状态的构象和性质差异,揭示其介导趋化的分子机制和信号途径,进而探索与其他趋化受体信号传递机制的共性。
结项摘要
细菌的趋化性能够帮助细菌适应快速变化的环境,获得有限的营养并在生态系统中占据有利生境,在细菌致病、生物被膜、生物修复以及共生体(比如根瘤)形成中都发挥了重要的作用。细菌趋化运动由位于细胞膜上的趋化受体阵列感受外界信号,并将信号传递至胞内调控细菌鞭毛的转动进而完成对细菌运动的调控,这一过程是分子生物学和微生物学最为活跃的领域之一。国内外研究人员对趋化受体和相关阵列进行了持续的研究,基于趋化受体结合配体前后的双状态,提出了一系列跨膜信号传递的双状态或动态模型。但是当前大多数研究基于趋化吸引剂与趋化受体的作用来开展研究,关于趋化排斥剂的研究相对较少,且几乎没有趋化抑制剂的研究。在前期完成了鉴定丛毛单胞菌趋化受体MCP2201趋化吸引剂为柠檬酸以及确定其相互作用机制的基础上,我们在本研究中确定苹果酸为趋化受体MCP2201的趋化排斥剂,首次测定了趋化受体与趋化排斥剂的复合物结构。此外,我们发现趋化受体MCP2201存在一类以丙二酸为代表的趋化排斥剂,这次首次发现趋化受体存在天然的趋化抑制剂。针对具有天然、吸引剂结合和抑制剂(或排斥剂)结合三种状态的这一独特的趋化受体MCP2201,我们综合利用生物化学、分子遗传学、结构生物学等技术手段,研究MCP2201全长或结构域多种状态的构象和性质差异,阐释了趋化受体MCP2201识别不同类型小分子信号并转导产生不同类型信号的机制,并揭示其介导趋化的分子机制和信号途径,进而探索了其与其他趋化信号传递机制的共性。本课题对MCP2201结构的深入研究以及对MCP2201趋化排斥、趋化抑制机制的探索可以充实对整个趋化受体领域的认知,更进一步阐明细菌有望实现利用有限的趋化受体通过响应TCA循环中间产物达到对多种芳香化合物的降解,这种识别机制也有助于阐明环境微生物利用有限受体识别有限效应物进一步达到对大量各种各样化合物进行响应的机制。
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The ligand-binding domain of a chemoreceptor from Comamonas testosteroni has a previously unknown homotrimeric structure
睾丸酮丛毛单胞菌化学感受器的配体结合域具有以前未知的同源三聚体结构
- DOI:10.1111/mmi.14326
- 发表时间:2019-09-01
- 期刊:MOLECULAR MICROBIOLOGY
- 影响因子:3.6
- 作者:Hong, Yuan;Huang, Zhou;Li, De-Feng
- 通讯作者:Li, De-Feng
The 1-beta-methyl group confers a lower affinity of L,D-transpeptidase Ldt(Mt2) for ertapenem than for imipenem
1-β-甲基基团赋予 L,D-转肽酶 Ldt(Mt2) 对厄他培南的亲和力低于对亚胺培南的亲和力
- DOI:10.1016/j.bbrc.2019.01.082
- 发表时间:2019
- 期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
- 影响因子:3.1
- 作者:Zhao Fen;Hou Yan-Jie;Zhang Ying;Wang Da-Cheng;Li De-Feng
- 通讯作者:Li De-Feng
Crystal structure of the chromosome partition protein MukE homodimer
染色体分配蛋白 MukE 同二聚体的晶体结构
- DOI:10.1016/j.bbrc.2021.12.032
- 发表时间:2021-12-17
- 期刊:BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
- 影响因子:3.1
- 作者:Qian,Jia-Wei;Wang,Xiao-Yan;Guo,Lu
- 通讯作者:Guo,Lu
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:{{ item.doi || "--"}}
- 发表时间:{{ item.publish_year || "--" }}
- 期刊:{{ item.journal_name }}
- 影响因子:{{ item.factor || "--"}}
- 作者:{{ item.authors }}
- 通讯作者:{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:{{ item.authors }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
其他文献
A Novel Binding Pattern Unique in Two Ligands for One Carbohydrate Recognition Domain in Galectins
半乳糖凝集素中一个碳水化合物识别域的两种配体独特的新型结合模式
- DOI:--
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:--
- 作者:C. Bian;Z. Ying;张迎;Defeng Li;李德峰;Dacheng Wang;王大成
- 通讯作者:王大成
人民币实际有效汇率对不同类商品进出口的影响——兼对“总和偏倚”的一个检验
- DOI:10.16304/j.cnki.11-3952/f.2015.10.007
- 发表时间:2015
- 期刊:宏观经济研究
- 影响因子:--
- 作者:于爱芝;李德峰;孙青莲
- 通讯作者:孙青莲
光合细菌制氢试验装置及其技术研究进展
- DOI:--
- 发表时间:--
- 期刊:Biomass Chemical Engineering
- 影响因子:--
- 作者:周雪花;李德峰;张全国;李刚;杜金宇
- 通讯作者:杜金宇
其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:{{ item.doi || "--" }}
- 发表时间:{{ item.publish_year || "--"}}
- 期刊:{{ item.journal_name }}
- 影响因子:{{ item.factor || "--" }}
- 作者:{{ item.authors }}
- 通讯作者:{{ item.author }}

内容获取失败,请点击重试

查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:
AI项目摘要
AI项目思路
AI技术路线图

请为本次AI项目解读的内容对您的实用性打分
非常不实用
非常实用
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
您认为此功能如何分析更能满足您的需求,请填写您的反馈:
李德峰的其他基金
新型直接氨氧化途径中羟胺氧化酶的分子机制及其分布和影响因素研究
- 批准号:32370041
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
岩溶地下水系统寡营养条件下的微生物碳代谢研究
- 批准号:
- 批准年份:2020
- 资助金额:80 万元
- 项目类别:重大研究计划
相似国自然基金
{{ item.name }}
- 批准号:{{ item.ratify_no }}
- 批准年份:{{ item.approval_year }}
- 资助金额:{{ item.support_num }}
- 项目类别:{{ item.project_type }}
相似海外基金
{{
item.name }}
{{ item.translate_name }}
- 批准号:{{ item.ratify_no }}
- 财政年份:{{ item.approval_year }}
- 资助金额:{{ item.support_num }}
- 项目类别:{{ item.project_type }}