人类周期性表达基因的生物信息学鉴定和实验验证

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30971454
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    8.0万
  • 负责人：
    张闻
  • 依托单位：
    昆明医科大学
  • 学科分类：
    C0703.细胞增殖及细胞周期
  • 结题年份：
    2010
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2010-12-31

项目摘要

周期性表达基因在细胞周期和细胞癌变中具有关键作用，但目前对人类周期性表达基因的鉴定还不够全面和可靠。我们的前期工作成功建立了酵母周期性表达基因的周期正态融合模型，编译完成《人类基因功能手册》、《人类基因聚类》等工具书。在此基础上，本项目拟运用生物信息学方法分析细胞周期时序表达微阵列和人类基因注解等数据，通过贝叶斯统计建模、计算机模拟和生物学实验验证相结合的技术路线，建立人类周期正态融合模型和算法，系统可靠地鉴定人类周期性表达基因。对检出基因的染色体定位、产物分布、活性和相关途径等生物学功能信息进行全方位理论和实验分析，所得结果用于构建细胞周期相关基因数据库，为揭示细胞周期原理、细胞癌变机理，以及寻找癌症治疗药靶提供理论依据和方法。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（5）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（1）
专利数量（0）
小鼠睾丸发育全过程中生精细胞的自发性凋亡
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    云南大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张彦;罗兰;张闻;李京昆
  • 通讯作者：
    李京昆
Dynamic extended folding: Modeling the RNA secondary structures during co-transcriptional folding
动态延伸折叠：共转录折叠过程中 RNA 二级结构的建模
  • DOI：
    10.1016/j.jtbi.2009.07.027
  • 发表时间：
    2009-11-07
  • 期刊：
    JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY
  • 影响因子：
    2
  • 作者：
    Cao, Huai;Xie, Hua-Zhen;Liu, Ci-Quan
  • 通讯作者：
    Liu, Ci-Quan
小鼠睾丸发育过程中p53基因的表达规律
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    昆明理工大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    曾慧芳;罗兰;张彦;张闻;李清
  • 通讯作者：
    李清
Splicing signals in the human hemoglobin genes at the sequence and folding levels
人类血红蛋白基因中序列和折叠水平的剪接信号
  • DOI：
    10.1007/s11859-011-0718-y
  • 发表时间：
    2011-06
  • 期刊：
    Wuhan University of Natural Sciences
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Li Q;Xie H;Zhang W;Liu C;Zhang L
  • 通讯作者：
    Zhang L
人类基因组结构变异
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    何永蜀;张闻;杨照青
  • 通讯作者：
    杨照青

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其他文献

以学生为中心的医学遗传学课程教学模式应用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    昆明医科大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    罗兰;田明;杨榆玲;吴艳瑞;张闻;陈元晓
  • 通讯作者：
    陈元晓
含硅铝酸钠溶液中硅酸根离子结构对脱硅的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    Journal of Central South University
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    刘桂华;张闻;齐天贵
  • 通讯作者：
    齐天贵
细菌双杂交验证古菌UDG与TRX相互作用的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    昆明医学院学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张璐;张闻;陈元晓
  • 通讯作者：
    陈元晓
后过渡金属配合物催化乙烯齐聚与聚合的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    化学进展
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张闻;张文娟;孙文华
  • 通讯作者：
    孙文华
疏水性有机污染物在土壤/沉积物中的赋存状态研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    环境化学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    孙红文;张闻
  • 通讯作者：
    张闻

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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