三个新基因在玉米籽粒植酸代谢途径中的功能鉴定

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31501392
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

About 75% of seed total phosphorus is found in phytic acid. Phytic acid and its metabolits are involved in a number of metabolic, developmental and signaling pathways with essential biological function. However, biosynthesis of phytic acid is poorly understood in plant because of some ‘missing links’ in the pathway..In previous study, we employed an association population consisted of 527 maize inbred lines for genome wide association study (GWAS) using phytic acid and inositol phosphate content as phenotype data, and obtained three candidate genes. And all the Arabidopsis mutants of three genes showed reduced phytic acid content compared with wild type. Therefore, the three genes were supposed to involve in phytic acid metabolism pathway. In this case, the functions of three genes will be identified and characterized via genetic complementation assay of Arabidopsis mutants, expression pattern, tissue and cellular localization, overexpression and RNAi transgenic plant, analysis of protein interaction and other molecular evidence. This study will provide new information for better understanding of phytic acid metabolism pathway. Meanwhile, novel functional genes discovered in this research could be used for improvement of maize quality.
禾本科和油料作物种子中总磷的75%以植酸形式存在。植酸及其代谢中间产物在植物体内参与种子休眠、维持细胞内磷平衡及信号转导等多种生命活动,具有重要生物学功能。但是,植酸在植物体尤其是种子中的代谢过程依然存在很多“断点”,未得到完整的阐释。.在前期研究中,以植酸及其代谢物磷酸肌醇为表型数据,通过对527份玉米自交系构成的关联群体进行全基因组关联分析,筛选出3个功能未知的基因。三个基因的T-DNA插入突变体种子中植酸含量均下降约70%。推测候选基因与植酸代谢途径的调节密切相关。本项目拟以上述基因为研究对象,通过拟南芥突变体互补实验,候选基因的表达模式、组织及细胞定位、应用过表达和RNAi转基因研究及互作蛋白的筛选分析其在玉米籽粒中的生理功能,不仅可以探明植酸在玉米籽粒中的代谢途径,为调控玉米籽粒植酸代谢的研究提供重要信息,而且可获得具有自主知识产权的功能基因,为改良玉米品质提供重要的基因资源。

结项摘要

在前期研究中,以植酸及其代谢物磷酸肌醇为表型数据,通过对527份玉米自交系构成的关联群体进行全基因组关联分析,筛选出3个功能未知的基因。.lpar1, ZmLPA-like1,经生物信息学分析是作用于肌醇磷酸代谢途径的激酶,其保守结构域是P-Loop环。RNAi的转基因种子植酸水平显著下降,无机磷水平显著升高;相反,过表达的转基因种子中无机磷水平显著下降,植酸水平显著升高。LC-MS/MS测定显示RNAi的转基因种子中,InsP3, InsP4, InsP5 和InsP6的含量都有所下降,InsP1的含量上升。MST的底物结合实验显示除Ins(1,2,3,4,6)P5外,其余十几种底物都有不同程度结合。用ADP GloTM试剂盒证实,lpar1在Ins(1,2,5,6)P4 ,Ins(1,4,5,6)P4, Ins(4,5)P2, Ins(1,4)P2和 Ins(1,3,4)P3存在下有激酶活性。.根据RT-PCR结果显示,lpar2和lpar3这两个基因在胚中的表达水平均比胚乳中高。lpar2和lpar3的GFP融合蛋白的亚细胞定位实验显示两个基因均定位于胞质、细胞核和细胞膜中。lpar2和lpar3基因获得了过表达转基因种子,现与Qi319和B73两个自交系进行回交转育,初步测定发现,两个基因的过表达转基因种子中的植酸含量均有所升高,磷含量降低,这些基因可以促进肌醇磷酸合成。.本项目鉴定了ZmLPA-like1基因的功能,作为一个催化肌醇磷酸合成途径的激酶,找到了其作用的底物。这是第一个解析作用底物的带有P-Loop结构域的酶。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Rapid Method for Simultaneous Determination of Inositol Phosphates by IPC‑ESI–MS/MS and Its Application in Nutrition and Genetic Research
IPC-ESI-MS/MS 快速同时测定肌醇磷酸盐及其在营养和遗传研究中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Chromatographia
  • 影响因子:
    1.7
  • 作者:
    张少军;杨文竹;赵倩倩;周晓今;范云六;陈茹梅
  • 通讯作者:
    陈茹梅

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

Clinical Report: A Female with Down Syndrome and Autism
临床报告:一名患有唐氏综合症和自闭症的女性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Hongkong journal of pediatrics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨文竹;赵云静
  • 通讯作者:
    赵云静

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败,请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:

AI项目思路

AI技术路线图

杨文竹的其他基金

玉米HD-ZIP家族蛋白ZmHDZ6调控玉米耐旱的分子机制
  • 批准号:
    32372064
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
关闭
close
客服二维码