介孔纳米材料富集质谱鉴定糖肽新方法用于大肠癌血清糖肽组的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    21005020
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    19.0万
  • 负责人：
    张莹
  • 依托单位：
    复旦大学
  • 学科分类：
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

多肽组研究表明几乎所有细胞都受多肽调节。由于重要的生命进程大多被翻译后修饰所控制，专门的翻译后修饰多肽组研究对于进一步揭示多肽在调节机体的病理/生理状态中所起的作用有着极为重要的意义。细胞内一半以上的蛋白质/多肽被糖基化所修饰，然而因缺乏有效的糖肽分析方法，目前尚无系统化的"糖肽组学"研究报道。本项目首次提出"糖肽组学"研究的概念，针对其中的关键问题，即复杂样品中低丰度糖肽的高选择性、高效分离富集和糖肽的高灵敏、高通量质谱鉴定等提出解决方案。拟在前期发展的氨基苯硼酸修饰介孔纳米材料快速高效富集糖肽方法的基础上，通过改进修饰方法、调节介孔开口孔径等，使其具有1)更佳的糖肽尺寸匹配性；2)更高的糖肽富集特异性；3)更好的质谱分析兼容性。进而建立以生物质谱为基础的氨基苯硼酸修饰介孔纳米材料用于血清糖肽组学研究的方法，并将其应用于人大肠癌血清的糖肽组学研究，寻找人类大肠癌潜在糖肽类生物标志物。

结项摘要

糖基化蛋白质的研究十分重要,针对生物样品中糖基化蛋白质鉴定困难的问题，本项目发展了一系列基于生物质谱的糖蛋白/糖肽研究的新技术新方法。我们设计并合成了一系列新型复合纳米材料用于糖蛋白质的高选择性富集。包括氨基苯硼酸修饰的介孔纳米材料MCM-41-CPB，同时具有糖基化肽段富集的特异性以及肽组学研究所需的体积排阻效应，建立了一种从血清中一步高通量富集内源性糖肽的方法，首次揭示了大鼠的血清糖肽组；合成了Fe3O4@PMAA@Ag材料，通过材料表面亲水性的Ag粒子和糖肽间的亲水相互作用，实现了低至微升级的肠癌血清样本中的糖蛋白质组挖掘。这些方法为糖基化蛋白质的研究提供了一些高灵敏的方法。

项目成果

期刊论文数量（13）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Enhanced Ionization of Phosphatidylcholines during MALDI Mass Spectrometry Using DCTB as Matrix
使用 DCTB 作为基质增强 MALDI 质谱中磷脂酰胆碱的电离
  • DOI：
    10.1002/cjoc.201200600
  • 发表时间：
    2012-09
  • 期刊：
    Chinese Journal of Chemistry
  • 影响因子：
    5.4
  • 作者：
    Zhang Ying;Lu Haojie
  • 通讯作者：
    Lu Haojie
Highly specific revelation of rat serum glycopeptidome by boronic acid-functionalized mesoporous silica
硼酸功能化介孔二氧化硅高度特异性揭示大鼠血清糖肽组
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2012-11-13
  • 期刊：
    ANALYTICA CHIMICA ACTA
  • 影响因子：
    6.2
  • 作者：
    Liu, Liting;Zhang, Ying;Lu, Haojie
  • 通讯作者：
    Lu, Haojie
Improved analysis of oligosaccharides for matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry using aminopyrazine as a derivatization reagent and a co-matrix
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  • DOI：
    10.1039/c3an01228j
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Analyst
  • 影响因子：
    4.2
  • 作者：
    Cai Yan;Zhang Ying;Yang Pengyuan;Lu Haojie
  • 通讯作者：
    Lu Haojie
Recent progress in quantitative glycoproteomics
定量糖蛋白组学最新进展
  • DOI：
    10.1007/s10719-012-9398-x
  • 发表时间：
    2012-08-01
  • 期刊：
    GLYCOCONJUGATE JOURNAL
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    Zhang, Ying;Yin, Hongrui;Lu, Haojie
  • 通讯作者：
    Lu, Haojie
Ligand-free strategy for ultrafast and highly selective enrichment of glycopeptides using Ag-coated magnetic nanoarchitectures
使用银涂层磁性纳米结构超快速和高选择性富集糖肽的无配体策略
  • DOI：
    10.1039/c2jm35196j
  • 发表时间：
    2012-12-07
  • 期刊：
    JOURNAL OF MATERIALS CHEMISTRY
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Ma, Wan-Fu;Li, Lu-Lu;Wang, Chang-Chun
  • 通讯作者：
    Wang, Chang-Chun

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  • 通讯作者：
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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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