长链非编码RNA BAALC-AS1的m6A 甲基化修饰在食管鳞状细胞癌中的作用及机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81902835
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.5万
  • 负责人：
    张弘悦
  • 依托单位：
    北京大学
  • 学科分类：
    H1802.肿瘤发生
  • 结题年份：
    2022
  • 批准年份：
    2019
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

M6A methylation as a dynamic modification of coding RNA and non-coding RNA has become a new way of genetic information regulation, participate in the regulation of the pathological process of many kinds of diseases. However, m6A methylation has made some progress in the modification of coding RNA, but the modification mechanism of m6A methylation for long non-coding RNA (lncRNA) is still unknown. At present, we have found that lncRNA BAALC-AS1 (Homo sapiens BAALC antisense RNA 1) has copy number amplification in ESCC through human whole genome sequencing and is highly expressed in ESCC cell lines. After knockdown of BAALC-AS1 expression in ESCC cell lines, cell proliferation, migration and invasion abilities were inhibited. In addition, the overall level of m6A methylation in ESCC was low, and the ALKBH5 was highly expressed, and the ALKBH5 could regulate the expression of BAALC-AS1 and its m6A methylation level. Meanwhile, m6A methylated recognition protein YTHDF2 interacted with BAALC-AS1. Based on the previous experimental results, this project will further explore the role of BAALC-AS1 in ESCC and clarify ALKBH5 can modify the m6A methylation of BAALC-AS1 through YTHDF2 dependent pathway, so as to promote the of progress of ESCC. In order to provide new ideas for clinical diagnosis and treatment.
m6A甲基化作为编码RNA和非编码RNA上发生的动态修饰已成为一种全新的遗传信息调控方式，参与调节多种疾病的病理过程。目前，m6A甲基化对于编码RNA的修饰取得一定进展，但其对于长链非编码RNA的修饰机制仍不清楚。我们通过人类全基因组测序发现，长链非编码RNA BAALC-AS1在食管鳞癌中存在拷贝数扩增且在食管鳞癌细胞系中高表达，具有促进细胞增殖、迁移、侵袭能力。此外，食管鳞癌RNA整体水平的m6A甲基化呈低水平，去甲基化酶ALKBH5可以调控BAALC-AS1的表达及其m6A甲基化水平。同时，m6A甲基化识别蛋白YTHDF2与BAALC-AS1存在相互作用。本项目将依据前期实验结果的基础上深入探究BAALC-AS1在食管鳞癌中的作用及机制并阐明去甲基化酶ALKBH5可通过YTHDF2依赖途径修饰BAALC-AS1的m6A甲基化从而促进肿瘤的发生发展。以期为临床诊治提供新思路。

结项摘要

长链非编码RNA （long noncoding RNA, lncRNA）参与多种癌症的进展，但其具体机制尚不清楚。我们通过人类全基因组测序发现，长链非编码RNA BAALC Antisense RNA 1（BAALC-AS1）在食管鳞癌中存在拷贝数扩增且在食管鳞癌组织和细胞系中高表达，并与食管鳞癌恶性表型相关。本研究旨在探讨lncRNA BAALC-AS1调控食管鳞癌恶性表型的具体机制。体内和体外实验均表明，BAALC-AS1促进食管鳞癌细胞增殖、迁移和侵袭。BAALC-AS1直接与蛋白质G3BP Stress Granule Assembly Factor 2（G3BP2）相互作用，从而抑制G3BP2对c-Myc RNA 3′UTR的降解，从而导致c-Myc表达积累。此外，c-Myc可作为转录因子直接结合到BAALC-AS1的启动子区域，从而诱导其表达。综上，本研究将揭示食管鳞癌中 BAALC-AS1 的组织分布特点及其作用机制，阐明 BAALC-AS1/G3BP2/c-Myc 反馈环路在食管鳞癌发生发展中的作用。这可能为食管鳞癌的治疗提供一个新的治疗靶点并促进新的治疗策略发展。

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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