长链非编码RNA BC015064:三阴乳腺癌侵袭的新机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81302304
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Due to the characters of low degree of differentiation, high heterogeneity, serious invasion and metastasis ability, high recurrence frequency, importantly the poor prognosis and ineffective rescue tactics, triple-negative breast cancer(TNBC) becomes one difficult trouble of breast cancer clinical treatment. BC015064 was specially over-expressed in TNBC, identified from differential lncRNA expression profile between TNBC tissue and non-TNBC tissue. Previous study showed that down-regulated expression of BC015064 in TNBC cells could inhibit the invasion ability of the invasive cells. On the other hand, bioinformatic analysis and experiment data indicated that tob1 could be a candidate target gene of BC015064. This study will confirm the role of BC015064, using overexpression and knock down strategies in the breast cancer cells which differentially express ER, PR, or Her-2, playing in the TNBC invasion progression by analyzing the cell behavior and molecular characteristics; subsequently clarify the underlying mechanism between BC015064 and gene tob1. Up to now, there was no report about the function and mechanism of lncRNA in regulating the TNBC invasion progression, and lncRNAs may open up a world in TNBC invasion research. This study may provide a new target for the gene targeted therapeutics of TNBC.
三阴乳腺癌由于肿瘤分化程度低、异质性高、侵袭及转移脏器能力强、复发率高,且缺乏有效的治疗手段,预后极差,是乳腺癌临床治疗的重大难题。BC015064是我们采用芯片技术筛选三阴乳腺癌与非三阴乳腺癌组织中差异非编码RNA时发现的、高表达于三阴乳腺癌组织中的lncRNA。前期研究发现,BC015064在三阴乳腺癌细胞MDA-MB-231细胞中表达沉默可抑制肿瘤细胞的侵袭恶性;生物信息学及实验验证初步确定tob1为BC015064下游靶标。本研究拟取雌、孕激素受体或Her-2受体表达状态不同的乳腺癌细胞,采用过表达与沉默策略,从细胞行为学、分子特征等方面,明确BC015064在三阴乳腺癌侵袭过程中的功能;并以tob1为机制研究切入点,揭示BC015064可能的作用机制。本研究具有源头创新性,将有助于理解三阴乳腺癌侵袭力强的分子机制,可能为三阴乳腺癌的基因靶向治疗提供新靶点。

结项摘要

三阴性乳腺癌(TNBC)是乳腺癌中的一个重要亚型,浸润性较强,复发转移率高、生存时问短,缺乏有效的治疗方式。近年来,LncRNA被证实在肿瘤发生、发展中发挥重要的调控作用。通过高通量测序,筛选三阴乳腺癌与非三阴乳腺癌组织之间差异表达的LncRNA,发现上调LncRNAs880条,下调LncRNAs784条;基因功能聚类分析显示:差异表达的LncRNA参与细胞进程调节、细胞代谢进程及生物调节等;具有蛋白结合等功能;信号通路分析显示它们主要参与PPAR信号途径,蛋白酶体,卵母细胞减数分裂,细胞周期等信号通路;通过qRT-PCR技术,在13例三阴乳腺癌和39例非三阴乳腺癌中验证发现70条差异表达的LncRNAs;选取4株三阴乳腺癌细胞系及3株非三阴乳腺癌细胞系,qRT-PCR验证发现8条LncRNAs的表达模式与组织中的结果吻合;ROC曲线分析结果显示,其中6条LncRNA具有诊断意义。进一步研究,我们发现IGKV和LINC00052过表达抑制MCF-7的迁移,BC015064过表达促进MCF-7的迁移;通过CCK-8实验证实,IGKV抑制MCF-7的增殖,BC015064过表达刺激MCF-7的增殖;通过trans-well filter实验,IGKV抑制MCF-7的侵袭能力,BC015064过表达促进MCF-7的侵袭;通过FISH和核质分离-定量检测,我们发现IGKV和BC015064均主要分布于细胞核内;收集BC015064和IGKV5过表达的MCF-7细胞,进行高通量基因测序,结果显示:BC015064过表达后, 47个基因表达上调,32个基因表达下调;IGKV5过表达后,75条基因上调,140条基因表达下调。针对差异基因分析,BC015064过表达后,表达变化的基因主要参与调控转录、激素受体介导的信号转到等生物学进程,;IGKV5过表达后,差异表达基因主要参与外源性葡萄糖醛酸代谢、黄酮类化合物的代谢等过程;通过BSP 检测BC015064调控靶基因tob1的DNA 甲基化水平,结果发现BC015064过表达后,tob1的甲基化水平显著升高。以上结果表明,BC015064高表达与三阴性乳腺癌侵袭恶性程度高密切相关,并且能够通过tob1调控TNBC的侵袭能力,为TNBC的研究提供了可靠的数据,很可能为临床治疗TNBC提供有力的证据,也可能成为治疗TNBC的重要靶点。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(3)
专利数量(0)
LncRNAs as new biomarkers to differentiate triple negative breast cancer from non-triple negative breast cancer.
LncRNA作为区分三阴性乳腺癌和非三阴性乳腺癌的新生物标志物
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.7509
  • 发表时间:
    2016-03-15
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Lv M;Xu P;Wu Y;Huang L;Li W;Lv S;Wu X;Zeng X;Shen R;Jia X;Yin Y;Gu Y;Yuan H;Xie H;Fu Z
  • 通讯作者:
    Fu Z
Identification and characterization of microRNAs expressed in human breast cancer chemo-resistant MCF-7/Adr cells by Solexa deep-sequencing technology
利用Solexa深度测序技术鉴定和表征人乳腺癌化疗耐药MCF-7/Adr细胞中表达的microRNA
  • DOI:
    10.1016/j.biopha.2015.07.019
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
  • 影响因子:
    7.5
  • 作者:
    Xu Pengfei;Wang Luyu;Huang Lei;Li Wenqu;Lv Shanshan;Lv Mingming;Ma Jingjing;Zhou Qian;Wu Xiaowei;Fu Ziyi;Lu Cheng;Yin Hong
  • 通讯作者:
    Yin Hong
Perfluorooctanoic acid stimulates breast cancer cells invasion and up-regulates matrix metalloproteinase-2/-9 expression mediated by activating NF-kappa B
全氟辛酸通过激活 NF-κ B 介导刺激乳腺癌细胞侵袭并上调基质金属蛋白酶-2/-9 表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Toxicology Letters
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Chen, Fei;Ma, Jingjing;Gao, Sheng;Fu Ziyi(付子毅)
  • 通讯作者:
    Fu Ziyi(付子毅)
Effects of miRNA-197 overexpression on proliferation, apoptosis and migration in levonorgestrel treated uterine leiomyoma cells.
miRNA-197 过表达对左炔诺孕酮治疗的子宫肌瘤细胞增殖、凋亡和迁移的影响。
  • DOI:
    10.1016/j.biopha.2015.02.004
  • 发表时间:
    2015-04
  • 期刊:
    Biomedicine & Pharmacotherapy
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Fu, Ziyi;Ji, Chenbo;Wu, Jiangping;Xu, Qing
  • 通讯作者:
    Xu, Qing
Systematic analysis of gene expression pattern in has-miR-197 over-expressed human uterine leiomyoma cells.
系统分析 has-miR-197 过表达的人子宫肌瘤细胞中的基因表达模式。
  • DOI:
    10.1016/j.biopha.2015.07.039
  • 发表时间:
    2015-10
  • 期刊:
    Biomedicine & Pharmacotherapy
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wu, Xiaoli;Fu, Ziyi;Tan, Jie;Xu, Qing
  • 通讯作者:
    Xu, Qing

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其他文献

hsa-miR-197在子宫肌瘤中的表达及生物信息学特征分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国工程科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    付子毅;吴小莉;皇甫玉爽;凌静
  • 通讯作者:
    凌静
miR-363靶基因预测及生物信息学分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    南京医科大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李文衢;石晓燕;吕珊珊;黄雷;付子毅;贾雪梅
  • 通讯作者:
    贾雪梅
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  • DOI:
    10.16571/j.cnki.1008-8199.2019.04.015
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    医学研究生学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    崔洋洋;谢晖;付子毅;王水
  • 通讯作者:
    王水
lncRNA TUG1对卵巢癌细胞OVCAR3的增殖迁移及能量代谢的影响
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    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    许鹏飞
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    实用临床医药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    戴璐娴;杨晓红;付子毅;谢晖
  • 通讯作者:
    谢晖

其他文献

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付子毅的其他基金

内源性脂肪分泌肽MASP3抑制乳腺癌侵袭转移的应用基础研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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