染色质组装因子CAF-1亚基的结构与功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470744
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    90.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

CAF-1(chromatin assembly factor 1), consisting of three subunits, is a highly conserved histone chaperone in eukaryotic cells,which assembles newly synthetic histone H3.1-H4 heterodimer to nascent DNA during DNA replication. CAF-1 also functions in DNA repair and heterochromatin silencing. In the past twenty years, many studies about CAF-1 have been reported, however the functional mechanism of CAF-1 is still unclear. We plan to study CAF-1 by studying the structures and the function of its three subunits and the interactions among them. Our recent preliminary results revealed the fine interaction of the subunits, and found that yeast CAF-1 can bind DNA, which is similar to another histone chaperone Rtt106. A DNA binding region was further identified within the large subunit Cac1. We will further the study the interactions and the functions of the three subunits by structural and cellular approaches, in order to reveal the mechanisms underlying this important protein complex.
染色质组装因子CAF-1是一种真核生物中高度保守的组蛋白分子伴侣,含有三个亚基。它的一个主要作用是在DNA复制过程中将新合成的H3.1-H4异二聚体组装到正在复制的DNA上。除此之外,CAF-1还参与了细胞的DNA损伤修复和基因沉默等过程。因此,CAF-1是基本生命过程中非常重要的蛋白复合体。自发现二十年来,关于CAF-1的功能研究有很多,但关于CAF-1的作用机制仍所知甚少。我们希望通过研究CAF-1各个亚基的结构与功能,特别是大亚基的功能,以及各个亚基之间的相互作用关系来研究CAF-1的组装及分子机制。我们初步的实验结果研究了各亚基的精细相互作用关系,发现了酵母中CAF-1具有直接结合DNA的能力,而且在CAF-1大亚基Cac1中发现一个能够结合DNA的结构域。我们希望通过生化、细胞生物学及结构生物学等手段来进一步揭示各亚基的结构﹑功能以及分子机制。

结项摘要

染色质组装因子CAF-1 是一种真核生物中高度保守的组蛋白分子伴侣,含有3个亚基。它的一个主要作用是在DNA 复制过程中将新合成的H3.1-H4 组装到正在复制的DNA上。因此,CAF-1 是基本生命过程中非常重要的蛋白复合体。本项目的研究内容包括利用X-射线晶体学、结构生物学、生物化学及细胞生物学等技术和手段解析酵母中CAF-1各亚基的三维结构;探讨CAF-1各组分结构和功能的关系,从结构角度揭示CAF-1自身组装的方式﹑推测CAF-1结合和识别组蛋白的分子机理。在本项目的支持下,我们对CAF-1各个亚基的以及截短体进行表达纯化,体外分析各个亚基之间以及亚基和组蛋白的相互作用关系,构建亚基之间以及CAF-1与组蛋白的互作图谱;其中,我们解析了CAF-1的部分结构,发现其具有一个特殊的winged-helix结构域,可以介导CAF-1和DNA的相互作用,对CAF-1的功能发挥关键作用。该项成果发表在Nucleic Acids Res上(影响因子:10)。 除了已经发表的结构,我们对通过对CAF-1其它亚基的以及截短体进行表达纯化以及体外分析,开展了结构生物学研究工作,相关结果正在整理中。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A DNA binding winged helix domain in CAF-1 functions with PCNA to stabilize CAF-1 at replication forks.
CAF-1 中 DNA 结合翼状螺旋结构域与 PCNA 一起发挥作用,使 CAF-1 稳定在复制叉上
  • DOI:
    10.1093/nar/gkw106
  • 发表时间:
    2016-06-20
  • 期刊:
    Nucleic acids research
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Zhang K;Gao Y;Li J;Burgess R;Han J;Liang H;Zhang Z;Liu Y
  • 通讯作者:
    Liu Y
NMI and IFP35 serve as proinflammatory DAMPs during cellular infection and injury.
NMI 和 IFP35 在细胞感染和损伤期间充当促炎性 DAMP。
  • DOI:
    10.1038/s41467-017-00930-9
  • 发表时间:
    2017-10-16
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Xiahou Z;Wang X;Shen J;Zhu X;Xu F;Hu R;Guo D;Li H;Tian Y;Liu Y;Liang H
  • 通讯作者:
    Liang H
A non-canonical GTPase interaction enables ORP1L-Rab7-RILP complex formation and late endosome positioning
非典型 GTPase 相互作用使 ORP1L-Rab7-RILP 复合物形成和晚期内体定位
  • DOI:
    10.1074/jbc.ra118.001854
  • 发表时间:
    2018-09-07
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Ma, Xinli;Liu, Kai;Liang, Huanhuan
  • 通讯作者:
    Liang, Huanhuan

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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