通过β地中海贫血常见突变追踪海南岛原住民的人群起源和演变

β地中海贫血是包括我国南方在内的全球热带和亚热带地区高发的人类单基因遗传病，β珠蛋白基因CD41-42（-CTTT)缺失是东南亚及我国人群中导致β地贫的一种最常见和分布最广泛的突变，也是我国南方β地贫最高发的海南岛黎族群体中独特的单一致病突变。历史上黎族人群为海南岛最早的原住民，其主要迁徙地为广西壮族的居住地。为检验海南岛黎族群体的β地贫高频率源于建立者效应这一假设，本研究选择广西壮族和海南黎族这两个亲源关系最近的群体以及当地汉族人群为对象，通过对随机大样本的β珠蛋白基因的突变和单倍型分析，追踪该突变的起源及其进化历程，并结合上述两地人口变迁的历史资料，设置迁移至海南岛的建立者有效群体大小、人口"瓶颈"维持时间和人群分化时间，通过基于单倍型的似然值模拟计算，以期重构海南岛黎族原住民的起源和人群演变的历史事件，为我国民族起源的研究提供有价值的分子进化依据，也可为人类学研究提供可借鉴的新思路。

通过本研究，我们分析了我国海南汉族、海南黎族、广西汉族和广西壮族人群-珠蛋白基因的单核苷酸多态性和单倍型的结构特点及其与-地贫CD41-42（-CTTT）突变的关系，研究结果表明我国南方人群的-珠蛋白基因在进化过程中受到平衡选择的作用，可能与疟疾选择作用相关；中国南方地区人群CD41-42（-CTTT）突变可能是单一起源，该突变发生在黎族和壮族人群分化之前，其起源和扩散与疟疾选择作用、遗传漂变、人群迁徙以及基因转换密切相关；除了疟疾选择作用外，建立者效应可能是造成黎族人群-地贫突变单一和频率高于其它人群的主要原因；四个人群的β-珠蛋白基因的遗传结构非常相似，在进化过程中没有发生分化。此外，为探讨壮族与黎族人群之间的母系遗传关系，我们随机选取888名健康个体，包括277名广西壮族人，198名海南黎族人，222名广西汉族人以及191名海南汉族人。通过分析线粒体DNA控制区中第一高变区与第二高变区序列变异，我们发现壮族与黎族人群单倍型类群频率分布相似。海南人群与广西人群在线粒体DNA的遗传关系上十分相似，其母系基因库都表现出了中国南方人群遗传特征。广西壮族与海南黎族很有可能起源于共同的祖先。中介网络图显示出海南黎族人群主要位于系统发育树的分支上。这种模式反映出人群分化历史，说明海南黎族很可能是由广西壮族繁衍而来。为了研究--SEA是否受到疟疾的自然选择，我们选取了来自中国广东广西的--SEA携带者76人，正常个体138人作为研究样本。通过扫描--SEA缺失段上下游约410kb的28个SNP位点，推断出携带有SEA缺失的单倍型存在有正性选择作用的标志，而且大约起源于3200年前，与疟疾的流行时间大致吻合。综合SEA缺失在世界范围内的流行病学调查结果，即--SEA变异只存在于菲律宾、越南、泰国和中国南部地区，可以推断SEA缺失突变是一个近期产生的事件，研究结果填补该遗传疾病在分子进化研究领域的空白。

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